Coronaviren - NEU BIOZENTRUM UNIVERSITÄT BASEL - Januar 30, 2020 - Universität ...
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BIOZENTRUM
UNIVERSITÄT BASEL
Januar 30, 2020
Coronaviren - NEU
Hans H Hirsch, MD, MSc
Klinische Virologie
Labormedizin
Infektiologie & Spitalhygiene
Universitätsspital Basel
Transplantation & Clinical Virology
Departement Biomedizin
Universität Basel
Situation 29. Januar 2020
8000
200
(2.5%)
2
Fragen ??
n Was sind Viren ?
n Welche Viren befallen regelmässig die Atemwege ?
n Wie unterscheiden sich Atemwege-infizierende Viren ?
n Wie weisen wir diese Viren nach ?
n Was sind Coronaviren ?
n Was ist neu am neuartigen Coronavirus ?
n Was weiss man zur Übertragung ?
n Wie ist der klinische Verlauf ?
n Was bedeutet das für Diagnostik, Therapie, Infektionskontrolle ?
3
Was sind Viren ?
Genetische Programme,
welche
geeignete Zellen
für die eigene
Vermehrung
um-programmieren
® Schaden
Virionen
- RNA oder DNA Genom
- Kapsid
- (Lipidhülle)
Antivirale Substanzen
- hoch-spezifisch
- kein Breitspektrum
4
(≠ Antibiotika)
Welche Viren befallen regelmässig unsere Atemwege ?
n >16 verschiedene Viren befallen regelmässig die Atemwege, Saisonalität
Rhinoviren Respiratorisches Influenza A Humane Coronaviren
Syncytial Virus
Influenza B - HCoV-229E
- HCoV-OC43
- HCoV-NL63
- HCoV-HKU1
Ison MG, Hirsch HH (2019)
Community-acquired respiratory
viruses in transplant patients:
diversity, impact, unmet clinical needs.
Clin Microbiol Rev 32:e00042-19.
5
Compagno F, Braunacker-Mayer L, Khanna N, Stolz D, Battegay M, Frey U, Tamm M, Kouyos R, Hirsch HH (2017) https://doi.org/10.1128/CMR.00042-19.
Comparing viral respiratory tract infections in symptomatic children and adults by mulitplex NAT from 2010 - 2015 (ePoster abstract ECCMID 2017 Vienna)
Wie unterscheiden sich Atemwege-infizierende Viren ?
n Transmission; Reproduktion R0; Prädilektion für obere und untere Atemwege
n Komplikationsrate ? Obere Atemwege
Schnupfen
Rhinoviren
Halsschmerzen
Sinusitis Humane Coronaviren
Resp Syncytial Virus
Laryngitis Influenzaviren
Tracheitis
Bronchitis
CORONAVIREN ? INFLUENZA MASERN
Pneumonie 2019-nCoV
1 Meter 2 Meter
Untere Atemwege
6
Wie weisen wir Viren nach ?
n Diagnostischer Nachweis des Virus-spezifischen Genoms
n Genetischer Fingerabdruck
n Nukleinsäure-Amplifikations-Test (NAT oder PCR)
n Einzeln - aber quantitativ (QNAT)
n Viele gleichzeitig – aber qualitativ (multiplex NAT)
n Alle Varianten gleichzeitig- Next generation sequencing (NGS)
n Untersuchungsmaterial von betroffener Lokalisation
n Nasen-Rachen Abstrich, Bronchialflüssigkeit, …
7
Was ist NEU am neuartigen Coronavirus 2019-nCoV (Wuhan) ?
n Virus-Stamm welcher bisher nicht im Menschen nachgewiesen wurde
n Keine oder wenig Kreuzimmunität in der menschlichen Population?
• Einzelstrang ss(+) RNA Genom
• 27’000 -32’000 Nukleotide
• Virion zirka 100 nm
Durchmesser
• Corona-ähnliche Glykoproteine
(“spikes”)
• Lipid-Hülle
Zhu N, et al (2020) A novel Coronavirus from patients with pneumonia in China, 2019 NEJM
DOI:10.1056/NEJMoa2001017
Was ist NEU am neuartigen Coronavirus 2019-nCoV (Wuhan) ?
n Genetische Ähnlichkeiten erlauben (nur) begrenzte Vorhersage
• Einzelstrang ss(+) RNA Genom
• 27’000 -32’000 Nukleotide
• Virion zirka 100 nm
Durchmesser
• Kronen-ähnliche Glykoproteine
(“spikes”)
• Lipid-Hülle
• Lineages
Chan JFW et al (2020) A familial cluster of pneumonia… Lancet http://doi.org/10.1016/S10140
Woher stammt das neuartigen Coronavirus 2019-nCoV (Wuhan) ?
n Ursprung nicht genau bekannt, aber man geht von einer Zoonose aus
n 2019-nCoV überraschend gut an Vermehrung in Menschen angepasst
Virus aus den Reservoir in Tieren Zwischenwirt Zufällige Weltweite
Familie (Virus und Wirt mit erhöhtem Übertragung auf Ausbreitung
der Corononaviren aneinander Kontakt zu Menschen (Pandemie)
angepsst) Menschen ®
Mensch zu Mensch
Anpassung
Spezies-Barriere Spezies-BarriereWie geschieht die Übertragung ?
n Erkrankungscluster in China und jetzt neu in ROW: H2H
Chan JFW et al (2020) A familial cluster of pneumonia… Lancet http://doi.org/10.1016/S10140
ROW, rest of the world; H2H, human to human transmissionWas ist die epidemische Bedeutung des Huanan Fischmarktes ?
n …H2H transmission has occurred among close contacts since December 2019
(R0 = 2.2)
• Mittlere Inkubationszeit= 5.2 Tage
(95% CI 4.1 to 7.0; 95th 12.5)
• Initiale epidemische
Verdoppelungszeit= 7.4 Tage
• Basic reproductive number R0=2.2
(95% CI, 1.4 to 3.9)
Li Q et al (2020) Early Transmission Dynamics in Wuhan… NEJM: doi.org/10.1056/NEJMoa2001316Wie ist der Verlauf nach Exposition?
n Nur laborbestätigten 2019-nCoV Infektionen: Klin Präsentation + positive Test
n Ansteckend vor symptomatischer Erkrankung ?
Inkubationszeit
3 – 5 Tage
bis erste leichte
Symptome ?
Huang C et al (2020) Clinical features of patients… Lancet doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30183-5Wodurch zeichnen sich schwere Verläufe aus?
n Nur laborbestätigte 2019-nCoV Infektionen
Huang C et al (2020) Clinical features of patients… Lancet doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30183-5Wie kann man 2019-nCoV Pneumonie behandeln?
15Was bedeutet das für Diagnostik und Infektionskontrolle?
Wie gehen wir vor in der aktuellen Situation?
n Diagnostik basiert auf 3 Säulen
1) 2019-nCoV-Wuhan Nachweis
Multiplex-NAT Resultate Januar 2020 USB
– Resultat nach 1 Tag NAVI Genf (N=377)
(Prof Adrian Egli; Labormedizin)
2) Erreger-Nachweis mittels Multiplex-NAT
3) Andere Ätiologie/Diagnose
ADV
11%
B pertussis
HCoV
HMPV
50% Rhinovirus
12%
Influenza A
Influenza B
HPIV
Respiratory Syncytial Virus
Mycoplasma pneumoniae
Negativ
Comprehensive diagnostics for respiratory virus infections after transplantation
or after potential exposure to swine flu A/H1N1:what else is out there?
Dumoulin A, Widmer A, Hirsch HH (2009) Transplant Infect Dis 11: 2972019-novel Coronavirus im Vergleich
10x weniger
10x mehr
3x mehr
10x mehr
20x mehr
18
Munster VJ et al (2020) A Novel Coronavirus Emerging… NEJM DOI: 10.1056/NEJMp2000929Universitätsspital Basel Prof Manuel Battegay
Team Labormedizin Prof Adrian Egli
Team Infektiologie & Spitalhygiene PD Dr Rainer Gosert
Team Pneumologie Dr Karoline Leuzinger
Prof Nina Khanna
Universität Basel Dr Klaudia Nägele
Team Department Biomedizin Prof Daiana Stolz
Team Biozentrum Prof Michael Tamm
Prof Andreas WidmerSie können auch lesen
