COURSES FOR MASTER STUDENTS SOSE 2023 - CHAIR OF APPLIED AND MOLECULAR MICROBIOLOGY - TU BERLIN
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Courses for Master Students
SoSe 2023
Chair of Applied and Molecular Microbiology
Prof. Dr.-Ing. Vera Meyer
Master courses offered by AMM WP 19.06. bis 23.06.2023 PD Dr. Sascha Jung Genetic and Metabolic Engineering WP 26.06. bis 30.06.2023 Dr. Carsten Pohl Fungal Biotechnology in the Post-Genomic Era WP 03.07. bis 10.07.2023 Dr. Timothy Cairns Systems and Synthetic Biology in Applied Microbiology WP 19.04. bis 22.07.2023 Dr. Bertram Schmidt Biotechnologie im Kontext von Kunst & Design W 19.04. bis 22.07.2023 Prof. Dr.-Ing. Vera Meyer P2P Teaching in der Mikrobiologie W 19.04. bis 22.07.2023 PD Dr. Sascha Jung Vertiefungsmodul Biotechnologie in der Mikrobiologie W 25.04. bis 22.07.2023 Prof. Dr. Christine Lang Genetik in der Biotechnologie WP 19.04. bis 22.07.2023 PD Dr. Sascha Jung Projektpraktikum Molekulare Mikrobiologie (BC)
Champi(gn)ons, 2017, V. meer
PR Genetic and Metabolic Engineering (6 LP)
(Alt: Praxis der Angew. & Molekularen Mikrobiologie; 0335 L 057)
Block: 19.06. bis 23.06.2023
Zeit: 10:00 bis 16:00 Uhr
Ort: TIB-Campus, Raum 494, Präsenz/hybrid
ISIS Passwort: GeMeEn_2023
Diese Wahlpflichtveranstaltung wird von Herrn PD Dr. Sascha Jung
gehalten.
Max 20 Studierende (PrfNr bei QISPOS: 2349226)
PR Genetic and Metabolic Engineering (6 LP)
(Alt: Praxis der Angew. & Molekularen Mikrobiologie; 0335 L 057)
Topic: Engineering of Aspergillus niger
Methods:
Gibson cloning, PCR, Southern blot
Chemiluminescence detection, fluorescence microscopy
Functional studies
Deletion of Overexpression GFP reporter to study
GOI of GOI localisation of GOI
SE Fungal Biotechnology in the Post Genomic Era
(3 LP) (0335 L 037)
Block: 26.06.2023 bis 30.06.2023
Zeit: 10:00 bis 16:00 Uhr
Ort: TIB-Campus in Person
ISIS Passwort: FuBi_2023
Diese Wahlpflichtveranstaltung wird von Herrn Dr. Carsten Freidank-Pohl gehalten.
Max 20 Studierende (PrfNr bei QISPOS: 16015)
SE Fungal Biotechnology in the Post Genomic Era
(3 LP) (0335 L 037)
Topics: Gene Cluster identification, Gene Transfer,
Secondary Metabolites
Introduction and application of freely available
software tools:
MultiGeneBlast, MEGA, Mzmine3, PaintOmics, ChimeraX,
cluster prediction, visualization of synteny, phylogenetic analysis, interpretation of
mass spectrometry data and identification of potential targets of natural products
This course does NOT teach you any programming skills, but a problem-solving
mindset is required for successful participation
Angewandte und Molekulare Mikrobiologie I
(IV Systems and Synthetic Biology in Applied Microbiology) (0335 L 058)
FLIPPED CLASSROOM
Block: 03.07. bis 10.07.2023
(ohne Wochenende)
Zeit: 10.00 bis 16.00 Uhr
Ort: Online
Vorbesprechung: TBD
ISIS-Passwort: SSBaM_2023
Diese Wahlpflichtveranstaltung (Integrierte Veranstaltung) wird von Dr. C. Cairns gehalten.
Max 24 Studierende (PrfNr bei QISPOS: 2347161)
Angewandte und Molekulare Mikrobiologie I
(IV Systems and Synthetic Biology in Applied Microbiology) (0335 L 058)
FLIPPED CLASSROOM
1) Systems biology in applied microbiology
an omics view on microbial fermentation
(bacteria, yeast, fil. fungi)
genomics, transcriptomics, proteomics,
metabolomics
complexity of biological networks
Weight : 560 t Genes : 3002
Speed : 900 km/h Proteins : ~ 3000
Passengers : 850 Metabolites: ~ 1000
3,000,000 components 7,000 componentsAngewandte und Molekulare Mikrobiologie I
(IV Systems and Synthetic Biology in Applied Microbiology) (0335 L 058)
FLIPPED CLASSROOM
2) Synthetic biology in applied microbiology
minimal genomes, synthetic life, ethical
considerations
standardization, modularisation, designing
biological systems
Computers Cells
Integrated Circuits
AND OR Logic Gates
NOT
Standardized partsAngewandte und Molekulare Mikrobiologie I
(IV Systems and Synthetic Biology in Applied Microbiology) (0335 L 058)
FLIPPED CLASSROOM
3) Transferable skills
How to give scientific talks
Presentation hacks
Asking good questions
How to read an interpret scientific papers (in
a time efficient way)
Computers Cells
Integrated Circuits
AND OR Logic Gates
NOT
Standardized partsBiotechnologie im Kontext von Kunst und Design
(6 oder 10 LP, 33311 L 10625)
Projekte aus Kunst-Biotech-Design selbst ausdenken und umsetzen! Offen für alle interessierten
Menschen, nicht nur Biotechnolog*innen.
Ort: Im Haus der Materialisierung (Alexanderplatz)
Kontakt: ResteDerReste@web.de
Diese Lehrveranstaltung wird von M.Sc.Lena Heber und Dr. Bertram Schmidt (beide AMM) sowie
Produktdesignerin Nora Wilhelm und Künstler Erik Göngrich (beide Mitkunstzentrale) gehalten.Biotechnologie im Kontext von Kunst und Design
(6 oder 10 LP, 33311 L 10625)Biotechnologie im Kontext von Kunst und Design
(6 oder 10 LP, 33311 L 10625)Wahlkurs SE Genetik in der Biotechnologie (2 LP)
(0335 L 044)
Zeit: Dienstag: 17.00 bis 18.00 Uhr
Ort: TIB20+21C
Beginn: 25.04.2023
Diese Wahlveranstaltung wird von Frau Prof. Christine Lang gehalten.
Anmeldung via E-Mail christine.lang@tu-berlin.de
Max 20 Studierende
The Bioeconomy Council is an
independent advisory body to the German
Federal GovernmentSE Peer-to-Peer Teaching in der Mikrobiologie (6 oder 10 LP)
EINBINDUNG IN UNSERE BSc LEHRE
Anfrage + Anmeldung für diese Wahlveranstaltung bis spätestens
14.04.2023 bei info@mikrobiologie.tu-berlin.deBlock: 4 Wochen
Ort: FG AMM (TIB, Geb. 17a)
Ziel: Einführung in die Methoden einer möglichen
Masterarbeit
Diese Lehrveranstaltung wird von einem Mitarbeiter des
FG AMM gehalten. Infos über PD Dr. Sascha Jung
Anmeldung über info@mikrobiologie.tu-berlin.deWas leider nicht im SoSe angeboten werden kann
PR Bioinformatics in Applied Microbiology (6 LP)
M. Sc. Carmen Regner
IV Molecular Biotechnology of Natural Products (6 LP)
Dr. Charlotte SteinigerInnovation Management and Entrepreneurship Seit 2010 an der TU Berlin (Fakultät V): Ein MSc in „Innovation Management and Entrepreneurship“ zum Thema Gründung für Ingenieurstudiengänge. Verschiedene Kurse inklusive einer einwöchigen „Start-up Academy“ bis hin zu diversen Workshops für Gründungsinteressierte. Weitere Events dienen der Zusammenstellung von Gründerteams wie das Format „Speed Dating“ oder der Exploration der Erfolgsaussichten der Gründungsidee im „Product Propeller“. Darüber hinaus finden regelmäßig Gespräche mit einer großen Zahl an Fachgebieten über Gründungsmöglichkeiten und -ideen statt. Empfehlung auch für MSc Arbeiten!! http://www.entrepreneurship.tu- berlin.de/menue/masterprogramme_qualifizierung/#c568995
Innovation Management and Entrepreneurship Seit 2010 an der TU Berlin (Fakultät V):
VL Leben auf anderen Planeten - Eine Einführung in
die Astrobiologie 1/2
What is life and requirements for life
Life detection instrumentation
Habitability of planets and moons in our
Solar System
Space missions
Diese Wahlveranstaltungen werden vom Zentrum für Astronomie und
Astrophysik gehalten (Prof. Dirk Schulze-Makuch)
https://www-astro.physik.tu-berlin.de/node/39(Meine) Empfehlungen für online Wahlkurse
MOOCs (weltweit)
Industrial Biotechnology, TU Delft
Biobased Products for a Sustainable (Bio)economy, RWTH Aachen & TU Delft
Introduction to Computational Thinking and Data Science, MIT
Introduction to Computer Science and Programming Using Python, MIT
Maschinelles Lernen Acatech
Engineering Life: Synbio, Bioethics & Public Policy, John Hopkins Univ
Principles of Synthetic Biology MIT
MycologosJoin MOOCs!
(Massive Open Online Course)
M -Massive:
Kurse mit Teilnehmerzahlen, die in die 100.000de gehen können
O - Open:
keine Zulassungsbeschränkung (formaler Art, Teilnehmerzahl usw.)
Kostenfreiheit (Kursgebühren, Materialien usw.)
O - Online:
Nur rein webbasierte Kurse ermöglichen eine freie, ortsunabängige
Zugänglichkeit
C - Course:
ein MOOC ist als Lehrveranstaltung konzipiert, d.h. fester Start- und
Endtermin, Strukturierung in unterschiedliche Themeneinheiten, eine(r)
oder mehrere Lehrende, ggf. Betreuungsangebote
https://www.e-teaching.org/lehrszenarien/moocJoin MOOCs!
(Massive Open Online Course)
Industrial Biotechnology, TU Delft
https://online-learning.tudelft.nl/courses/industrial-biotechnology/
Biobased Products for a Sustainable (Bio)economy
https://www.edx.org/course/biobased1x
Introduction to Computational Thinking and Data Science, MIT
https://www.edx.org/course/introduction-computational-thinking-data-mitx-6-00-
2x-4
Introduction to Computer Science and Programming Using Python, MIT
https://www.edx.org/course/introduction-computer-science-mitx-6-00-1x-8Join MOOCs!
(Massive Open Online Course)
Engineering Life: Synbio, Bioethics & Public Policy, John Hopkins
University
Start: tba
Synbio is a diverse field with diverse applications, and the different contexts (e.g.,
gain-of-function research, biofuels) raise different ethical and governance
challenges. The objective of this course is to increase learners’ awareness and
understanding of ethical and policy/governance issues that arise in the design,
conduct and application of synthetic biology. The course will begin with a short
history of recombinant DNA technology and how governance of that science
developed and evolved, and progress through a series of areas of application of
synbio.
https://www.mooc-list.com/course/engineering-life-synbio-bioethics-public-
policy-courseraJoin MOOCs!
(Massive Open Online Course)
Maschinelles Lernen
Prof. Dr. Kagermann, Prof. Dr. Wahlster
Selbststudium Deutsch
https://mooc.house/courses/machinelearning-2016
In 3 Kurswochen bieten Wissenschaftler, Vertreter aus
Unternehmen, Entwickler und Anwender in insgesamt 38
Videos Orientierungswissen für das maschinelle Lernen.
Sie erhalten einen Überblick über Methoden des
maschinellen Lernens, Anwendungsfelder und
Werkzeuge. Konkrete Anwendungsbeispiele aus
unterschiedlichsten Branchen wie der Automobilindustrie,
der Gesundheitstechnologie oder der Finanzindustrie
vermitteln einen Einblick, welche Probleme bereits heute
mit Hilfe des maschinellen Lernens gelöst werden können.Join MOOCs!
(Massive Open Online Course)
Principles of Synthetic Biology, MIT
Learn how to engineer biological systems and program organisms to perform novel
tasks. Do you like biology, biotechnology, or genetic engineering? Are you
interested in computer science, engineering, or design? Synthetic Biology is an
innovative field bringing together these subject areas and many more to create
useful tools to solve everyday problems.
https://www.mooc-list.com/course/principles-synthetic-biology-edxJoin MOOCs!
(Massive Open Online Course)
https://mycologos.world/
We are the world's first school dedicated to all that mushrooms, lichens, and micro
fungi offer. Whether you're interested in the applied sciences of mycology or the
practical arts of working with fungi, we've got you covered.Join MOOCs!
(Massive Open Online Course)
MITx 6.00.1x "Introduction to Computer Science Using Python"
MITx - 6.00.2x "Introduction to Computational Thinking and Data Science"Join MOOCs!
(Massive Open Online Course)
MITx 6.00.1x
MITx - 6.00.2x
„Ich habe die Kurse "Introduction to Computational Thinking and Data Science"
und "Introduction to Computer Science Using Python" absolviert.
Das Material der Kurse ist ausgezeichnet aufgearbeitet und gut durch die
Professoren erklärt. Die Übungen helfen das Gelernte zu festigen und haben ein
anspruchsvolles Niveau.
M. HeinJoin MOOCs!
(Massive Open Online Course)
MITx - 6.00.2x
„Es handelt sich beim besuchten Kurs um den auf 6.00.1x aufbauenden Kurs.
Ich hatte vorher keinen Kontakt mit der verwendeten Programmiersprache
Python, bin aber mit anderen Sprachen vertraut. Das Niveau habe ich als sehr
hoch empfunden, jemandem der nur begrenzte Erfahrung mit Programmierung
hat, würde ich den Kurs eher nicht empfehlen.
Alles in allem hat er mir aber sehr viel Spaß gemacht, die Kombination aus Lehre
und Anwendung war großartig.“
H. SchiebenhöferJoin MOOCs!
(Massive Open Online Course)
Industrial Biotechnology, TU Delft
„Ich habe es als Bereicherung empfunden diesen Kurs zu belegen, da es schon mal
allgemein super ist einen online Kurs zu belegen, aufgrund der zeitlichen
Flexibilität.
Die Aufgaben sind zwar teilweise sehr anspruchsvoll, aber immer lösbar, wenn
man sich ausreichend mit dem Material beschäftigt hat. Teilweise gab es auch sehr
interessante Themen-Exkursionen, die von externen Professoren gehalten
wurden, dadurch wurde es auch nie langweilig.
Alles in allem hat der Kurs Spaß gemacht und ich hab sehr viel davon
mitgenommen, was ich z.B. jetzt schon im aktuellen Bioprozesstechnik Kurs
anwenden konnte.“
C. ChristiansenJoin MOOCs!
(Massive Open Online Course)
Industrial Biotechnology, TU Delft
„Ich habe im Wintersemester 2016/17 den Onlinekurs „Industrial Biotechnology“
von der Delft Universität belegt. Der Kurs war für mich sehr informativ und durch
die gute Struktur auch sehr nachvollziehbar. Im Laufe des Kurses sollte eine
komplette Fermentation besprochen werden, wobei zunächst der physikalische
und mikrobielle Hintergrund erklärt, dann auf verschiedenen Eigenschaften des
Fermenters eingegangen und zuletzt wirtschaftliche Aspekte aufzeigt wurden.
Dabei wurden Themen wie z.B. der Vergleich von Fermenterarten, die
Bilanzierung, das „Black Box Modell“, verschiedene Prozessreaktionen aber auch
Upstream und Downstream Prozesse und die Prozessevaluation sowie
wirtschaftlicher Hintergrund erklärt. Viele der benannten Problemstellungen
wurden nicht nur mit theoretischem Wissen vermittelt, sondern auch
Mathematisch erklärt. Es kommt also in dem Kurs nicht nur auf das
Auswendiglernen und das Verständnis an, sondern es müssen auch viele
mathematische Probleme gelöst werden. …“Join MOOCs!
(Massive Open Online Course)
Industrial Biotechnology, TU Delft
„… Dies hat mich manchmal vor einigen Problemen gestellt, da sie
Aufgabestellungen sehr anspruchsvoll waren. Es war deshalb hilfreich, den
Chatbereich des Onlinekurses zu nutzen, um sich mit anderen Teilnehmern
auszutauschen, aber auch andere Studenten an der eigenen Universität zu kennen,
um gemeinsam schwierige Aufgaben zu lösen. Positiv an dem Onlinekurs finde ich
auch, dass in einem zweiten Teil jede Woche das gelernte Wissen auf eine
spezifische Fermentation angewendet wurde. So hatte man immer eine praktische
Anwendung des Gelernten. Ein weites positives Argument ist die freie Einteilung
des Kurses. Es werden zwar Wochen vorgegeben, in welchen sich das Modul
unterteilt, die zu erledigen Aufgaben müssen jedoch nicht in diesen Wochen
abgegeben werden. Wenn man also zeitlich nicht in der Lage ist, in einer Woche
alle Aufgaben erfolgreich zu lösen, kann man diese Aufgaben auch noch in den
nächsten Wochen behandeln. …“Join MOOCs!
(Massive Open Online Course)
Industrial Biotechnology, TU Delft
„… Neben all dem positiven und dem großen Wissenszuwachs, welchen ich durch
den Kurs erhalten habe, ist dieser Kurs jedoch auch kritisch zu bewerten. Durch die
vielen Aufgaben und Vorlesungen und zusätzliche eigene Recherche um Themen
besser verstehen zu können, verlangt der Kurs einen hohen zeitlichen Aufwand. Ich
habe oftmals ca. 3 Tage in der Woche investiert, um die Aufgaben lösen zu können.
Dies war mir nur möglich, da ich in diesem Zeitraum nur wenige Kurse an der TU
belegt habe. Wenn man also einen solchen Onlinekurs belegt, muss man sich
bewusst sein, dass dieser viel Zeit in Anspruch nehmen kann, besonders wenn das
eigene Hintergrundwissen zu diesem Themengebiet noch nicht stark ausgebildet
ist. Zudem muss ich sagen, dass dieser Kurs sehr mathelastig war, was ich anhand
der Einleitung in das Modul nicht vermutet hätte. Trotzdem würde ich den Kurs
jedem der ein Interesse in der Industriellen Biotechnologie hat, empfehlen.“
Franziska SahmDTG Life-Science-Network DTG: Deutsche Technion Gesellschaft Technion: Israel Institute of Technology Haifa Life Science Network of the DTG offers the possibility for Master or PhD students to join one of the participating Institutes for a 4 – 6 weeks research stay. Each of the German universities accepts up to five Technion students per year, while each German university can send up to five students to the Technion. Each student is supported by a grant of 1000 € by the DTG German Life—Science Network: TUB, TU Hamburg-Harburg, TU München, TU Dresden, Uni Hanover Contact TUB: Vera Meyer (vera.meyer@tu-berlin.de)
DTG Life-Science-Network
Neuerung, speziell für die Biotechnologen der TUB seit Herbst 2017:
Da die TUB ein verpflichtendes Praktikum fordert, das an einer
ausländischen Hochschule abgeleistet werden darf, sofern es mind. acht bis
zwölf Wochen umfasst, hat die Stiftung zusätzliche Mittel zur Verfügung
gestellt, die diese längere Periode besser abdecken.
Für TUB-Praktikanten, die 8 Wochen oder länger nach Haifa gehen, werden
für den Aufenthalt 1.600€ gewährt, sowie
eine Erstattung der Verwaltungskosten am Technion von bis zu 250€
(Tuitition fee) und das Labor erhält 400€.
Contact TUB:
Vera Meyer (vera.meyer@tu-berlin.de)Sie können auch lesen
