Elektronische Fachinformationen für Chemiker - Die Datenbank - Chemisch-Geowissenschaftliche Fakultät
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Elektronische Fachinformationen für Chemiker Die Datenbank „Web of Science Core Collection“ Heike Göbel Informationsvermittlungsstelle der Chemisch‐Geowissenschaftlichen Fakultät Friedrich‐Schiller‐Universität Jena Humboldtstr. 11 07743 Jena Tel.: 03641‐9/48020 Heike.Goebel@uni‐jena.de RECHERCHE IM WEB OF SCIENCE EINE KURZE EINFÜHRUNG 2
Script dieses Seminars unter http://www.chemgeo.uni-jena.de/ Fakultät Informationsvermittlungsstelle Hilfen, Tipps und Anleitungen Elektronische Fachinformationen für Chemiker – Literatursuche im „Web of Science“ 3 Übersicht über die zu behandelnden Themen • Ablauf einer Recherche • Recherchestrategie und – protokolle • Zugang zur Datenbank Web of Science • Inhalt der Datenbank • Suche in der Datenbank • Autorensuche • Speichern/Export von Dokumenten • Suche nach „Related Records“ • Volltextzugriff • Online Hilfen 4
Ablauf einer Recherche Eine Recherche besteht grundsätzlich aus sieben Schritten: 1. Präzisierung der Suchanfrage – Verstehen des Informationsbedürfnisses 2. Auswahl der geeigneten Datenbanken 3. Formulierung der Suchanfragen 4. Übersetzung in die Datenbanksprache 5. Eingabe der Suchanfrage 6. Sichtung der Ergebnisse; ggf. Umformulierung der Suchanfragen 7. Aufbereitung der Suchergebnisse 5 RECHERCHESTRATEGIE UND RECHERCHEPROTOKOLLE 6
Vorbereitung einer Suche Beispiel: Mikrobieller Abbau aromatischer Verbindungen in Böden 7 Suchworttabelle (Wortliste) erstellen Ausarbeiten der Fragestellung Suchbegriffe und Synonyme sammeln: • Zerlegen Sie das Thema in Teilaspekte/Komponenten • Überlegen Sie sich, welche Stichworte die einzelnen Aspekte beschreiben können. • Gibt es Synonyme (andere Ausdrücke für das Wort), verwandte Begriffe, Abkürzungen und/oder andere grammatikalischen Formen der Stichworte? Diese Begriffe ebenfalls bei der Suche berücksichtigen, damit die Suchergebnisse präziser werden und sich die Zahl der brauchbaren Ergebnisse erhöht. • Benutzen Sie englische Fachbegriffe, wenn die Sprache der zu durchsuchenden Datenbank englisch ist. 8
Wortliste und Recherchestrategie Mikrobieller Abbau aromatischer Verbindungen in Böden (Microbial degradation of aromatic compounds in soils) Was suche ich? Component 1 Component 2 Component 3 Analyse des microbi? degrad? aromat? soil? Themas biodegrad? Benzol? Boden? Zerlegung in bioremediat? benzene Böden Einzelaspekte bzw. mikrobiol? Abbau? PAH ... Komponenten ... ... Wortliste mit Synonymen Erstellen der Component 1 AND Component 2 AND Component 3 Recherchestrategie Component 1 = (microbi? degrad?) OR biodegrad? OR bioremediat? OR ... Erweitern der Recherche (wenn zu wenige Treffer) Verknüpfen der (Component 1 AND Component 2) OR (Component 2 AND Component 3) Einzelkomponente Einschränken der Recherche (wenn zu viele Treffer) n mit UND/AND Weitere Aspekte ergänzen oder mit geographischem Bereich, Publikationsjahr oder -sprache einschränken. bzw. ODER/OR 9 Rechercheprotokoll • aktuellen Wissensstand zu einem Thema zusammentragen systematische Literaturrecherche • Suchstrategie dabei in einem Protokoll festhalten • Folgende Angaben nötig – Datum der Recherche – Durchsuchte Datenbanken – Eingesetzte Suchbegriffe (Synonyme, Oberbegriffe, Unterbegriffe, verwandte Begriffe) und deren genaue Verknüpfung über Suchoperatoren, evt. verwendete Maskierungen der Wortenden – Vorgenommene Einschränkungen (zeitlich, sprachlich) – Gefundene neue Suchworte/Synonyme zur Erweiterung der Suche bei zu geringer Trefferzahl – Eventuell notwendige Einschränkungen mit weiteren Suchworten bei zu großer Trefferzahl – Gefundene Trefferzahl bei jedem Suchschritt • Rechercheprotokoll - so ausführlich und genau, dass jeder andere Rechercheur dieselben Suchergebnisse erhält, wenn er mit diesen 10 Angaben eine Suche durchführt
Beispiele von Rechercheprotokollen Quelle/ Suchbegriffe Datum Trefferzahl Datenbank (inkl. Verknüpfung genauer Suchstring) Thema: Indocyaningrün Datenbank: Chemical Abstracts Plus Recherchedatum: 10.11. 2011 Zeitraum: 1995-2011 Sprachen: keine Einschränkung Dokumententypen: alle Suchstrategie: 1) Indocyanine green (5A) (deriv? OR analog? OR substitut? OR compound? OR conjugat? OR mixture?) AND (?therap? or ?diagno? or pdt or ?tumor? or ?cancer? or ?carcino? or metasta? or neoplasm? or malig? or sarcoid?) AND (Liver or hepat?) 22 Treffer 2) Indocyanine green (5A) (deriv? OR analog? OR substitut? OR compound? OR conjugat? OR mixture?) AND ( Liver or hepat? ) NOT 1) 7 Treffer 11 Beispiel einer thematischen Suche Charakterisierung und Entwicklung einer Fed-Batch-Technik im Schüttelkolben-Maßstab für Biomasse 12
Suchbegriffe finden - Suchworttabelle Analysieren Sie, welche Aspekte Ihr Thema beinhaltet, streichen Sie dabei zu allgemeine Worte Suchen Sie nach Synonymen, Ober-, Unter- und verwandten Begriffen Ermitteln Sie mögliche Trunkierungen Beispielthema: Charakterisierung und Entwicklung einer Fed-Batch- Technik im Schüttelkolben- Maßstab für Biomasse Aspekt 1 Aspekt 2 Aspekt 3 fed-batch-Technik Schüttelkolben biomasse fed-batch shake flasks biomass shaking flasks laboratory fermenters 13 Suchworttabelle in Suchstrategie umsetzen Aspekt 1 Aspekt 2 Aspekt 3 fed-batch-Technik Schüttelkolben Biomasse fed-batch UND shake flasks UND biomass oder shaking flasks fed batch Klammern um AND ODER-Verknüpfungen setzen („shake flask*“ OR „shaking flask*“) AND Trunkierungszeichen im WoS für das Wortende: * biomass*
Suchstrategie formulieren und in WoS eingeben fed batch AND biomass* AND (shak* flask* OR laboratory fermenter* OR laboratory scale) 249 Treffer 15 Suchstrategie eingrenzen mit Phrasensuche fed batch AND biomass* AND („shak* flask*“ OR „laboratory fermenter*“ OR „laboratory scale“) 161 Treffer 16
Suche mit NEAR/x – Operator einschränken biomass* AND („fed batch“) NEAR/5 („shak* flask*“ or „laboratory fermenter*“) 26 Treffer 17 Treffer durchsehen: Finde ich weitere geeignete Suchworte Suchworttabelle ergänzen und ggf. berichtigen: Aspekt 1 Aspekt 2 Aspekt 3 fed-batch-technik shak* flask* biomass* fed-batch-technique laboratory fermenter* lab fermenter* „fad batch“ microbioreactor* micro bioreactor* small bioreactor microfermenter*
Suchstrategie erweitern mit neuen Suchtermen, die in den Treffern gefunden wurden „fed batch“ AND biomass* AND (shak* flask* or „laboratory fermenter*“ or ((small or micro*) NEAR/3 bioreactor*) or “laboratory bioreactor*”) 202 Treffer 19 Zugang zu den Datenbankangeboten der ThULB http://www.thulb.uni-jena.de/ 20
Zugang zu Fachdatenbanken Datenbanken Fachübersicht 21 Fachdatenbanken Chemie 22
Datenbank WoS in DBIS der ThULB 23 Umfang der Datenbank Web of Science • Interdisziplinäre Aufsatzdatenbank: Kunst, Geistes-, Sozialwissenschaften, Medizin, Naturwissenschaften,Technik • ca. 12.000 wissenschaftliche Zeitschriften ausgewertet • ca. 40 Millionen Artikel aller Fachgebiete enthalten, enthält keine Patente • "Cited References" und "Citing References“ suchbar (Forschungsentwicklung retrospektiv und prospektiv untersuchbar) • "Find Related Records“ - Ermitteln thematisch verwandter Aufsätze über Artikel, die die gleiche Literatur zitieren • Teilweise mit direkter Verlinkung zu Volltexten • Exportformat für Literaturverwaltungsprogramme wie EndNote®, Reference Manager® and ProCite®, Citavi 24
Fachgebiete im WoS Allgemein / Fachübergreifend Mathematik, Medizin Biologie, Chemie, Elektrotechnik, Naturwissenschaft allgemein Mess- und Regelungstechnik Pharmazie Energie, Umweltschutz, Physik Kerntechnik, Ethnologie Politologie Geographie, Geowissenschaften Psychologie Informatik Pädagogik Land- und Forstwirtschaft, Soziologie Gartenbau, Fischereiwirtschaft, Sport Hauswirtschaft, Ernährung Technik allgemein Maschinenwesen, Theologie und Werkstoffwissenschaften, Religionswissenschaft Fertigungstechnik, Verfahrenstechnik, Bergbau und Hüttenwesen, Biotechnologie, Verkehrstechnik, Lebensmitteltechnologie Feinwerktechnik Wirtschaftswissenschaften 25 Teildatenbanken des WoS an der ThULB • Science Citation Index Expanded (SCI-EXPANDED) 1945 - heute • Social Sciences Citation Index (SSCI) 1956 - heute • Arts & Humanities Citation Index (A&HCI)1975 – heute 26
Wie kommt der Originalartikel (Volltext) in die Datenbank? Indexing am Beispiel Web of Science Titel Autoren Bibliographische Angaben Zeitschriftentitel, Jahrgang, Heft, Seitenzahlen Abstract Schlagworte / Indexterms Heike Göbel, IVS der Chemisch-Geowissenschaftlichen Fakultät, FSU Jena 27 Suchmaske Die Suchmaske besteht aus mindestens einer Zeile, diese kann beliebig ergänzt werden (Add Another Field) • Topic( Suche im Aufsatztitel, in der Zusammenfassung und den Stichwörtern • Title • Author (Nachname Leertaste Initiale, bis zu 5) • ResearcherID • Group Author • Publication Name • Year Published ( Unterschied zu Zeitraum auf der Einstiegsseite ! ) • Adress (Institution, häufig in abgekürzter Form ) • Language ( jetzt mit Auswahlmaske) • Dokument Type ( es erscheint eine Auswahlmaske) • Funding Agency • Grant Number 28
Suchfelder Topic Titel des Artikels, “white oak” or “quercus alba” Abstracts, Schlagworte des drug resistan* Autoren, KeyWords Plus Author Suche nach allen Autoren Bergstrom CT eines Artikels Wallen K Group Author Gruppe oder Organisation Aberdeen Lung Cancer Group welche als Autor gilt Beta Cell Biology Consortium Publication Name Zeitschriftentitel Czech Journal of Food Sciences Progress in Brain Research Publication Year Publikationsjahr des 1999 Artikels 2003-2005 Address Sucht die Institution des Emory Univ, Dept Biol, Atlanta, GA Autors (abgekürzt) 30329 USA Funding Agency Sucht den Namen der Australian Research Council zahlenden Stelle Grant number Sucht grant number P01* DP0342590 Researcher ID Sucht Researcher ID A-1009-2008 Nummer des Profils des Autors auf 29 www.researcherid.com Maskierungen - um Pluralformen und verschiedene Schreibweisen zu suchen * = keine bis viele Zeichen ? = ein Zeichen $ = kein oder ein Zeichen 30
SUCHOPERATOREN • Suchen Sie mithilfe von AND, OR,NOT, und NEAR/x um logische Suchanweisungen zu erstellen. • Setzen Sie die Suchoperatoren gegebenen- falls in Klammern – copper OR lead AND algae findet alle Nachweise, in denen lead gemeinsam mit algae vorkommt und auch alle Nachweise, in denen das Wort copper vorkommt – (copper OR lead) AND algae findet alle Nachweise, in denen das Wort algae entweder gemeinsam mit copper oder gemeinsam mit lead vorkommt • Setzen Sie einen zu suchenden genauen Wortlaut in Anführungszeichen „Phrasensuche“ 31 NEAR-Operator (Nachbarschaftsoperator) • MIT NEAR/x verknüpfte Begriffe werden gefunden, wenn sie im Abstand von höchstens x Worten stehen! – cellulose NEAR/5 wood: Abstandsoperator NEAR/5 verwenden, um Begriffe zu finden wie wood cellulose, cellulose from wood, wood-based cellulose usw. • X= 3-5 sinnvoll 32
Hinweise zur Recherchestrategie 1. Je vollständiger das Ergebnis sein soll, desto mehr Synonyme verwenden 2. Fachliteratur und Datenbanken sind in der Regel englischsprachig unbedingt mit englischen Suchworten recherchieren, deutsche Begriffe zusätzlich zur Ergänzung verwenden 3. Lateinische Begriffe sollten immer mit verwendet werden, z.B. für Mikroorganismen 4. Bei deutschen Begriffen sind Umlaute zu beachten z.B. bei Autorennamen Büchel Buechel bzw. Buchel (hängt von Datenbank ab, ob Umlaute verwendet werden oder nicht) 5. Relevanz der Suchergebnisse überprüfen und ggf. Recherche präzisieren (einschränken bzw. erweitern) 33 Besonderheiten der Autorensuche • Eingabe von Namen generell ohne ausgeschriebenen Vornamen (Angabe von Initialen mit dem Trunkierungszeichen * ist möglich) – Eingabe : Lee M* – Eingabe : Lee • Doppelnamen und Namen mit Sonderzeichen immer mit unterschiedlichen Schreibweisen suchen – Eingabe: Schroeder F* or Schroder F* – Eingabe: O‘Brian G* or Obrian G* – Eingabe: Meier-Lange F* or Meierlange F* – Eingabe: De la Rossa or Delarossa or Dela Rossa 34
Übung - Autorensuche Suchen Sie alle im WoS verzeichneten Publikationen von Prof. Ulrich Schubert, die er in Jena publiziert hat Hinweise: • Nachsehen, welchen Namen Prof. Schubert verwendet • „Basic Search“ in den richtigen Feldern (z.B. Author, Address) Übung - Autorensuche Alle Publikationen von Prof. Ulrich Schubert im WoS • Name in Publikationen: Ulrich S. Schubert, Ulrich Siegmar Schubert, U. S. Schubert • „Basic Search“ in den richtigen Feldern (z.B. Autor, Address) 1259 Treffer
Suchergebnisanzeige / Trefferliste Suchergebnis-Anzeige Trefferliste mit bibliographischen Angaben, die ausführlichen Angaben erscheinen nach in der Detailanzeige. • Dort ist anklickbar: Cited References (alle im Artikel enthaltenen Zitate) und Times Cited (Anzahl der Zitierungen von diesem Dokument), sowie View Related Records
Ausschnitt aus der Einzeltrefferanzeige 39 40
citation map(Zitatzuordnung) Klicken Sie auf die Schaltfläche, um eine Zitatzuordnung zu erstellen. Mit einer Zitatzuordnung durchsuchen Sie bis zu zwei Generationen von Rückwärts- und Vorwärtszitierungen. Zusätzliche Informationen, wie Inhaltsverzeichnisse und Journal Impact Factor 41 Speichern/Export von Dokumenten für Endnote – Ausgabe der Trefferliste – Bei Save to „Endnote desktop“ auswählen – Zahl der zu exportierenden Dokumente und Exportformat (Full Record) auswählen – Datei unter aussagekräftigem Namen speichern (voreingestellt: savedrecs.ciw) – Die Trefferliste kann man außerdem ausdrucken bzw. als als E-Mail verschicken.
Speichern/Export von Dokumenten für andere Literaturverwaltungsprogramme (Citavi...) – Ausgabe der Trefferliste – Bei Send to „Other File Formats“ auswählen – Zahl der zu exportierenden Dokumente und des Umfanges (Author, Title, Source, Abstract) auswählen – Datei unter aussagekräftigem Namen speichern (voreingestellt: savedrecs.txt) – Datei in Literaturverwaltungs- programm importieren unter Verwen- dung des jeweiligen Filters für WoS 43 Speichern/Export von Dokumenten für Word – Ausgabe der Trefferliste – Bei Send to „ Other File Formats“ auswählen – Zahl der zu exportierenden Dokumente und zu exportierende Felder auswählen – Datei unter aussagekräftigem Namen speichern (voreingestellt: savedrecs.txt) – Datei mit Word öffnen, nicht mit dem Editor! 44
Zugang zu Volltexten - Über den Button Full Text in der Trefferliste bzw. in der Detailanzeige. Zuviel gefunden? Eingrenzen der Treffermenge! • Geben Sie zusätzliche Suchworte an! • Suchen Sie nur auf bestimmten Gebieten! • Grenzen Sie den Dokumententyp auf Übersichtsartikel (Reviews) ein! • Suchen Sie nur in bestimmten Zeitschriften! • Durchsuchen Sie nur die neuesten Jahrgänge der Zeitschriften! • Suchen Sie nur nach Arbeiten, die in von Ihnen beherrschten Sprachen geschrieben sind! • Suchen Sie nur im Titelfeld! 46
Kombinieren von Ergebnismengen über History In der „Search History“ können vorangegangene Suchschritte miteinander verknüpft werden. 47 Ich finde nicht genug! Was kann ich tun? • Einen thematisch hochrelevanten Treffer auswählen • Bei diesem Treffer – Durchsehen der zitierenden Quellen – Suche nach „Related Records“ – Durchsehen der zitierten Quellen -- Nach weiteren in Frage kommenden Suchworten schauen 48
Related Record im Web of Science/Shared Refs Shared References Das bedeutet, das es gemeinsame Referenzen vom Ausgangsartikel mit der jeweiligen anderen Publikation gibt. Je mehr gemeinsame Quellen es gibt, desto enger liegen die Artikel thematisch beieinander. Online Hilfen • Über den Button Help gelangt man zu den Hilfeseiten. • Durch Anklicken von Contents kommt man zur Übersicht über alle Hilfeseiten.
Tutorial Web of Science http://wokinfo.com/training_support/training/web-of-science/ Die Hilfen liegen auch in deutscher Sprache vor! Suchübung: Bacterien-Nanocellulose • Suche Sie Nachweise zur Herstellung von Nanocellulose mithilfe von Bakterien • Stellen Sie dazu eine Suchworttabelle auf (zwei Synonyme/Schreibweisen pro Aspekt) • Bakterien: Acetobacter Xylinum bzw. Xylinus oder andere • Verwenden Sie geeignete Nachbarschaftsoperatoren und Wildcards • Suchergebnisse exportieren und speichern 1. als Datei für Textverarbeitung (Name-WoS-Suche.txt) 2. als Datei für Endnote (Name-WoS-Endnote.ciw)
Übung: Suche nach Synthesen von Salbutamol • Mögliche Formulierungen in Veröffentlichungen: – Salbutamol synthesis – Salbutamol preparation – synthesis of Salbutamol – preparation of Salbutamol – preparating salbutamol ... • Formulierung für WoS: Salbutamol NEAR/1 (synthesis or preparat*) Wie finde ich mehr Synthesen von Salbutamol? Weitere Namen der Substanz suchen? • (±)-Salbutamol • (±)-Albuterol Wenig aussichtsreich! • dl-Albuterol / dl-Salbutamol • m-Xylene-α,α'-diol, α1-[(tert-butylamino)methyl]-4-hydroxy- • α1-[[(1,1-Dimethylethyl)amino]methyl]-4-hydroxy-1,3-benzenedimethanol • 1-(tert-Butylaminomethyl)-4-hydroxy-m-xylene-α1,α3-diol • 2-(tert-Butylamino)-1-[(4-hydroxy-3-hydroxymethyl)phenyl]ethanol • 4-Hydroxy-3-(hydroxymethyl)-α-[[(1,1- dimethylethyl)amino]methyl]benzenemethanol • m-Xylene α,α'-diol, α-[(tert-butylamino)methyl]-4-hydroxy- • α1-tert-Butylaminomethyl-4-hydroxy-m-xylene-α1,α3-diol • (±)-4-[2-(tert-Butylamino)-1-hydroxyethyl]-2-(hydroxymethyl)phenol • DL-N-tert-Butyl-2(4-hydroxy-3-hydroxymethylphenyl)2-hydroxyethylamine • AH 3365 / Airomir / Albuterol / Eolene / Etinoline /Proventil HFA /Proventil Inhaler / Sabumol / Salamol EB / Salbiar / Salbutamol / Saventol / Spreor / Sultanol / Sultanol N / Ventalin Inhaler / Ventolin / Ventoline / Volmax /
Wie finde ich mehr Synthesen von Salbutamol? Struktursuche in den Datenbanken SciFinder und Reaxys 56
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