PubMed - und was noch? Im Supermarkt der Informationsquellen - Stand Juni 2012 Edith Motschall, Institut für Medizinische Biometrie und ...

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PubMed - und was noch? Im Supermarkt der Informationsquellen - Stand Juni 2012 Edith Motschall, Institut für Medizinische Biometrie und ...
PubMed – und was noch?
Im Supermarkt der Informationsquellen

                               Stand Juni 2012

Edith Motschall, Institut für Medizinische Biometrie und Medizinische Informatik, Freiburg
PubMed - und was noch? Im Supermarkt der Informationsquellen - Stand Juni 2012 Edith Motschall, Institut für Medizinische Biometrie und ...
Im Supermarkt der Informationsquellen (Auswahl):

             TRIP Database                                                 Scopus
                                             Medline          Embase

UpToDate
                   Clinical Evidence             Biosis     Science Citation Index

     Cochrane Library                                     Psycinfo        CC MED

    OvidMD         Verlagsdatenbanken                PEDro Physiotherapy Evidence Database
                   (Volltext, z.B. Science direct)

     MEDPILOT.DE
                        DIMDI                        SCIRUS          Google Scholar
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Gemeinsamkeiten – Unterschiede
        zwischen den Informationsquellen

-   Art der Datenbank (Literatur-, Fakten-, Volltext-Datenbanken)
-   Ausgewertete Zeitschriften, Inhalte (Auswahl v. Hersteller)
-   Suchmöglichkeiten, technische Umsetzung
-   Inhaltliche Erschließung (Thesaurus)
-   Aktualität
-   Kosten

          Embase

                           Überschneidungen und Ergänzungen
                           variieren je nach Fachgebiet
           Medline
                           Embase enthält Medline
                           (alles? Schlagwörter nicht in jedem Fall für
                           beides anwendbar)
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Welche Informationsquelle für welche Fragestellung?

Arten von Literatur   Inhalte               Fragestellung         Informations-
                                                                  quellen (Beispiel)
Primärliteratur       Originalartikel       ein bestimmtes, eher Medline,
                      (Forschungsergebnis   seltenes Problem     Embase
                      einer Studie)                              Central

                      Auswahl von           aktuelle Forschung    ACP Journal Club
                      Originalartikeln nach von klinischer        www.acpjc.org
Sekundärliteratur     Qualitätskriterien,   Relevanz
                      Zusammenfassung
                      und Kommentierung
                      Synthese von          ein typisches, eher   Cochrane Library
Zusammenfassungen     relevanten Artikeln   häufig auftretendes
                      aus der               Problem
                      Primärliteratur
                      (z.B. systematische
                      Übersichtsarbeiten)
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Informationsquellen für das Auffinden von Primärliteratur (1)
                           Literaturdatenbanken (Auswahl):

                                                                      Anbieter/
Datenbank         Hersteller                 Besonderheit             Suchoberfläche

              National Library of      Vorwiegend                  NLM: PubMed,
 Medline                               engl. Sprachraum.           MEDPILOT.DE,
              Medicine (NLM), USA.
                                       Thesaurus: MeSH             DIMDI,
                                                                   Wolters Kluwer: OvidSP

Cochrane      Cochrane Collaboration   umfassendste Datenbank      Wiley Online Library,
Central       (weltweites Netz v.      kontrollierter klinischer
Register of   Wissenschaftlern)        Studien:                    Wolters Kluwer:
Controlled                                                         OvidSP
Trials                                 - aus Datenbanken           (Produktname:
(CENTRAL)                              - Handsuche                 EBM Reviews),

(Datenbank                             Vokabular: MeSH, nur bei    MEDPILOT.DE,
in der                                 Zitaten aus Medline
Cochrane                                                           DIMDI
Library)
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Informationsquellen für das Auffinden von Primärliteratur (2)
                           Literaturdatenbanken, Forts. (Auswahl):

Datenbank        Hersteller               Besonderheit               Anbieter (Auswahl)/
                                                                     Suchoberfläche
 Embase     Elsevier, Amsterdam     Mehr Zeitschriften aus          Elsevier: embase.com,
                                    europ. Sprachraum.              Wolters Kluwer: OvidSP,
                                    Thesaurus: EMTREE.              MEDPILOT.DE,
                                                                    DIMDI
                                    Enthält Medline: komplett   ?
 Science                            „Cited Reference Search“,       Thomson Reuters (Web
 Citation   Thomson Reuters, USA    Zitationsanalyse.               of Science),
 Index                              Conference Proceedings          MEDPILOT.DE,
                                                                    DIMDI

 CCMed      ZB MED, Köln             Zitate aus deutschen           MEDPILOT.DE,
                                     Zeitschriften ab 2000          DIMDI

            Thieme, Karger u.a.                                     ZB MED, DIMDI,
Verlags-                             Suche im Volltext              MEDPILOT.DE
daten-      Springer,
banken                                                              www.springerlink.com
            Elsevier
                                                                    ScienceDirect (Elsevier)
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Informationsquellen für Sekundärliteratur (mit Qualitätsfilter)
 Auswahl klinisch relevanter und methodisch validierter Artikel aus bedeutenden
 Zeitschriften nach strengen Evidenzkriterien.
 Zusammenfassung und Kommentierung zur Bedeutung für die klinische Praxis.

                          Hersteller          Erscheinungsweise       Anbieter/
Produkt                                       Print + Online          Suchoberfläche
 ACP Journal Club        American College                          ACP:
                         of Physicians                             www.acpjc.org,
                                                monatlich
                         (ACP)
                                                                   Wolters Kluwer:
                                                                   in EBM Reviews
                                                                   enthalten

 Journal Watch           Massachusetts          wöchentlich          www.jwatch.org
                         Medical Society

 Evidence-Based          BMJ Publishing
 Medicine                                        alle 2 Monate        ebm.bmj.com
                         Group
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Informationsquellen für Zusammenfassungen

  Produkt             Hersteller         Erscheinungsweise        Anbieter/
                                                                  Suchoberfläche
Cochrane Library     Cochrane                                  Wiley:
                                         Cochrane Reviews      www.thecochranelibrary.com
                     Collaboration       monatlich
                                                               Wolters Kluwer:
                                                               EBM Reviews (OvidSP)

                                                               MEDPILOT.DE,
                                                               DIMDI,
                                                               EBSCOhost

                                         Unterschiedlich (?)
OvidMD               Wolters Kluwer                              Wolters Kluwer:
                                         (verschiedene
                                         Quellen)                www.ovidmd.com

                                        Updates alle 4           UpToDate:
UpToDate              UpToDate          Monate.                  www.uptodate.com
                                        Wichtiges täglich

                     TRIP Database       Unterschiedlich        TRIP Database Ltd.
TRIP Database                            (verschiedene          (UK)
                     Ltd. (UK)
                                         Quellen)               www.tripdatabase.com
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Studienregister

Deutsches Register Klinischer Studien DRKS:
www.germanctr.de

Informationen zu laufenden und abgeschlossenen klinischen Studien in Deutschland

WHO: International Clinical Trials Registry Platform (ICTRP):
www.who.int/ictrp

ClinicalTrials.gov (USA):

 www.clinicaltrials.gov

Current Controlled Trials

www.controlled-trials.com

EU Clinical Trials Register

www.clinicaltrialsregister.eu
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Kostenlos zugänglich (Auswahl)
                                       Medline          Abstracts der   Other Reviews   Titelanzeige
                                                        Cochrane        (DARE)          kostenlos
                                                        Reviews                         von kostenpflichtigen
                                                                                        Datenbanken:
                                                                                        Embase, Science
                                                                                        Citation Index u.a.:

DIMDI                                        X                X              X                      X
www.dimdi.de

MEDPILOT.DE                                  X                X              X                      X
www.medpilot.de

PubMed                                       X                X
www.pubmed.gov

Cochrane Webseiten:                                           X              X
www.thecochranelibrary.com
summaries.cochrane.org

Centre for Reviews and Dissemination                          X              X
www.crd.york.ac.uk/crdweb

TRIP-Database                               (X)               X              X
www.tripdatabase.com                       Nicht
                                       empfehlenswert

Studienregister
Quellen zum Auffinden von Systematischen Übersichtsarbeiten (1)

        www.thecochranelibrary.com   (via Wiley Online Library)
Quellen zum Auffinden von Systematischen Übersichtsarbeiten (2)

Cochrane Collaboration: Abstracts der Cochrane Reviews (CDSR):
summaries.cochrane.org

                                                                 Deutschsprachige
                                                                 laienverständliche
                                                                 Zusammenfassungen
                                                                 (derzeit unvollständig
                                                                 und nicht
                                                                 aktualisiert)
Quellen zum Auffinden von Systematischen Übersichtsarbeiten (3)
   www.dimdi.de   „Eigene Datenbankauswahl“ wählen
Quellen zum Auffinden von Systematischen Übersichtsarbeiten (4)

                       www.medpilot.de
Quellen zum Auffinden von Systematischen Übersichtsarbeiten (5.1.)

www.pubmed.gov   1. Möglichkeit: PubMed Tools  Clinical Queries   Gesucht am 13.6.2012
Quellen zum Auffinden von Systematischen Übersichtsarbeiten (5.2.)
www.pubmed.gov        2. Möglichkeit: Eingrenzen von Suchergebnissen   Gesucht am 13.6.2012

3. Möglichkeit: Syntax eingeben:
   systematic [sb] und mit AND verbinden
systematic[sb] : Interne Strategie: Help  Searching PubMed  Finding Systematic Reviews

www.nlm.nih.gov/bsd/pubmed_subsets/sysreviews_strategy.html
Quellen zum Auffinden von Systematischen Übersichtsarbeiten (6)

Cochrane Reviews ab Issue 1/2005 im Science Citation Index
 Impact Factor 2010 = 6.2

 Cochrane*
Quellen zum Auffinden von Systematischen Übersichtsarbeiten (7)

www.crd.york.ac.uk/crdweb/

 Hilfe: Suchstrategien zum Auffinden von Systematic Reviews und Metaanalysen
 www.york.ac.uk/inst/crd/intertasc/sr.htm
www.tripdatabase.com Quellen zum Auffinden Systematischer Übersichtsarbeiten (8)
                                                           Advanced Search
                                                            - Sources searched by trip
                                                               - Systematic Reviews
Kostenpflichtige Portale mit qualitätsgeprüften Inhalten (1)

Clinical Evidence    http://clinicalevidence.bmj.com/ceweb/index.jsp

                                                 Systematische Übersichten:

                                                   Krankheitsbezogen:

                                                   Welche Therapien?
                                                   Welche Evidenz?

                                                  Print-Version: halbjährlich
Kostenpflichtige Portale mit qualitätsgeprüften Inhalten (2)
                  UpToDate         www.uptodate.com

Volltext einer Übersichtsarbeit
 zu variceal bleeding prevention

        Hier Suche nach Drug Interactions möglich
Kostenpflichtige Portale mit qualitätsgeprüften Inhalten (3)

                OvidMD          www.ovidmd.com

- Ranking nach Relevanz: statistische Gewichtung (z.B. Worthäufigkeiten), Evidenzquelle, Aktualität.
- Eingabe der Suchfrage: keine Trunkierungen. Automatische Zuordnung von Synonymen und
  Schreibweisen (Anm.: nicht immer).
Quellen für die Erstellung von Systematischen Übersichtsarbeiten (1)
    Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Intervention
                  www.cochrane-handbook.org

                                    How to cite this chapter:
                                    Lefebvre C, Manheimer E, Glanville J. Chapter 6: Searching for
                                    studies. In: Higgins JPT, Green S (editors). Cochrane Handbook for
                                    Systematic Reviews of Interventions. Version 5.1.0 [updated March
                                    2011]. The Cochrane Collaboration, 2011. Available from
                                    www.cochrane-handbook.org
Quellen für die Erstellung von Systematischen Übersichtsarbeiten (2)

Centre for Reviews and Dissemination (CRD):
Suche nach Studien zur Erstellung systematischer Übersichtsarbeiten:
www.york.ac.uk/inst/crd/finding_studies_systematic_reviews.htm
Quellen für das Schreiben von Systematischen Übersichtsarbeiten (1)

                                PRISMA-Statement

  Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses:

  www.prisma-statement.org

“Describe all information sources in the search (e.g. databases with dates of
coverage…) and date last searched.”

“Present the full electronic search strategy for at least one database, including any
limits, such that it could be repeated.”
www.prisma-statement.org/statement.htm

               Sampson M et al.: Precision of healthcare systematic
               review searches in a cross-sectional sample.
               Research Synthesis Methods. 2011;2:119-25.
Quellen für das Schreiben von Systematischen Übersichtsarbeiten (2)

Sampson M, et al.: Journal of Clinical Epidemiology, 2009; 62: 944-952.
Beispiel der Dokumentation einer Suche: 1. Gesuchte Datenbanken
        Thema: Deferasirox for managing iron overload in people with thalassaemia
Beispiel der Dokumentation einer Suche:
2. Strategien

Wegen überschaubarer Trefferzahl
wurde hier auf weitere Eingrenzungen
verzichtet.
Separate MeSH- bzw. EMTREE-Suche
hier nicht erforderlich.

                     Geht noch weiter mit Strategien
                     der anderen Datenbanken
Meerpohl JJ, Antes G, Rücker G, Fleeman N, Motschall E, Niemeyer CM, Bassler D. Deferasirox for managing iron
overload in people with thalassaemia. Cochrane Database of Systematic Reviews 2012, Issue 2. Art. No.:
CD007476. DOI: 10.1002/14651858.CD007476.pub2.

                                                                                                    Beispiel der
                                                                                                    Formulierung im
                                                                                                    Methodenteil des
                                                                                                    Reviews
Datenbankübergreifende Recherchen - Alles in einen Topf ?
                                                                     Medline
                                                                                     Science
Vorteil:                                           Cochrane                          Citation Index
                                                   Library
- gemeinsame Grundfunktionen
  (z.B. Textwortsuche)
  in einer Suchoberfläche

- keine besonderen
  Datenbankkenntnisse

- grobe Schätzung über Anzahl
  Zitate pro Datenbank

Nachteil:                                                        MEDPILOT.DE

- datenbankspezifische Suchfunktionen werden nicht genutzt
   wenig Variationsmöglichkeiten in Bezug auf Precision und Recall

Empfehlung:

- für die Erstellung systematischer Reviews die Datenbanken separat suchen.
- Import in ein Literaturverwaltungsprogramm. Dort Dubletten eliminieren
  (automatische Erkennung UND manuelle Durchsicht wegen untersch. Formatstandards)
Lohnt sich der Aufwand?
 Suchergebnisse zu Aerodontalgie mit umfassenden Suchstrategien in diversen Datenbanken
Datenbanken                                                                                 Anzahl Zitate
                                                                           Anzahl pro        Anzahl nach Ausschluss von
                                                                           Datenbank             Überschneidungen
                                                                                                          Davon relevant
                                                                                                          (laut Titel oder
                                                                                                          Abstract)
1. Gesamtzahl aus der Suche in MEDPILOT.DE                                       28             23                   21
   - Auswahl aller Datenbanken,
   - Sucheingabe: aerodont*

2. Erweiterte Suchstrategie in PubMed                                            80             67                   54
   - weitere Textwörter und MeSH-Begriffe,
   - Kombination mit Booleschen Operatoren

3. Erweiterte Suchstrategie in weiteren
   Datenbanken (kostenpflichtig)
             Embase (www.dimdi.de)                                               20              3                   1
             Journals@Ovid (Ovid)                                                10              9                   4
             Biosis Previews /                                                   24             11                   6
             Biosis Previews Archive (Ovid)
             Science Citation Index (Thomson)                                    24              3                   2
                                                              Gesamt            186             116                  88

Quelle: Motschall E et al: Deutsche Zahnärztliche Zeitschrift, 2008; 63: 84-88. www.dzz.de/beitragpdf/pdf_5603.pdf
Aufwand – Nutzen?

- Auswahl mehrerer Datenbanken
- Umfassende Suchstrategie je nach Funktionsumfang der
  Datenbank (  Recall – Precision variieren)
- Handsuche, Referenzen checken

               Welche Menge ist zumutbar?

        Wieviel verwertbare Publikationen bleiben übrig?
McGowan J, Sampson M.: J Med Libr Assoc. 2005 Jan;93(1):74-80
www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC545125/?tool=pubmed
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