Zellbiologie & Gentechnik - Transkript

 
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April 2021

                                     Zellbiologie &
                                     Gentechnik
© Maksim Tkachenko/istockphoto.com
Zellbiologie & Gentechnik - Transkript
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|transkript 2.2021                                                           Zellbiologie und Gentechnik laborwelt. I 123

                                · Zellbiologie und Gentechnik ·
                    · Plasmide – Währung des Gen- und Zelltherapie-Zeitalters ·
                · Expertenkommentar: Fehlschnitte von Genscheren vorhersagen ·
                                    · Nanochip-Single cell-RNAseq ·
                                        · Die Dimension zählt ·
                                   · Im ewigen Eis – Kryolagerung ·
                          · Interview: Dr. Martin Schleef, Plasmid Factory ·

                                               14,4
Mikroskopie                                                                                Zellanalyse

Zellen in molekularer                                                                      Algorithmus enttarnt
Auflösung                                                                                  Krebsresistenz
Biophysiker um Stefan Hell vom Max-                                                        Mit Hilfe eines selbstlernenden Algorith-
Planck-Institut (MPI) für biophysikalische                                                 mus ist es IT-Experten um Rewire-Chef
Chemie und dem MPI für medizinische             Mrd. US-Dollar Umsatz machten              Rune Linding gelungen, morpholo-
Forschung haben eine Lichtmikroskopie-           2020 die Anbieter zellbasierter           gisch subtile Veränderungen von sage
Methode namens Minsted entwickelt,             Assays. Die Zunahme an Biologika            und schreibe 850 Millionen einzelnen
die fluoreszenzmarkierte Strukturen           beschert bis 2025 ein Wachstum auf           Krebszellen über einen Zeitraum von drei
mit molekularer Auflösung, also einem          24,7 Mrd. US-Dollar, prognostiziert         Monaten zu analysieren. Der Algorithmus
Nanometer Trennschärfe, darstellt. Das              marketdataforecast.com.                war in der Lage vorherzusagen, welche
Verfahren gestattet stufenlose Visualisie-                                                 Zellen entarten, therapieresistent werden
rung von 1 bis 200 nm-großen Strukturen. .                                                und warum.                               .

Joint-Venture                                 3D-Zellkultur                                Einzelzellanalyse

KI plus Genomik gleich                        Realistischer Screenen                       Auf der Suche nach
antikörper-Wirkstoff                          im Hochdurchsatz                             Krebsimmuntherapien
Die Züricher Investorenplattform Xlife        Die Dresdner Neuron-D GmbH entwi-            MutaSeq heißt ein neues, von Onkologen
Sciences AG ist mit dem Krebs-                ckelt ein Hochdurchsatzsystem für das        und Molekularbiologen am Heidelberger
spezialisten Indivumed GmbH ein               Testen von Wirkstoffkandidaten für die       Hi-Stem-Institut federführend entwickel-
Joint Venture eingegangen. Die dazu           Behandlung neurodegenerativer Erkran-        tes Analyseverfahren für einzelne Stamm-
gegründete lx Therapeutics GmbH wird          kungen. Die lizenzierteTechnologie be-       und Krebsstammzellen. Durch single cell-
Indivumeds KI-und Datenbankressou-            ruht auf einem Verfahren zur Herstellung     Transkriptomanalyse wird zunächst der
rcen zur Targetauswahl nutzen, um auf         dreidimensionaler Zellkulturen. Damit        Differenzierungsstatus erfasst, während
der Technologieplattform der Xlife-           lassen sich Schlüsselmerkmale humaner        die Einzelzellsequenzierung genomischer
Portfoliogesellschaft Veraxa Biotech AG       Neuronen und die Neurodegeneration           und mitochodrialer DNA Krebsmutatio-
therapeutische Antikörper gegen solide        wesentlich besser als bisher in einem        nen aufdeckt (Nat. Comm., doi: 10.1038/
Tumoren zu entwickeln.                .      Assay nachstellen.                      .   s41467-021-21650-1).                    .
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124 I laborwelt. Zellbiologie & Gentechnik                                                                 |transkript 2.2021

Preisverdächtige
Technologie
Nach der zellbiologischen Methode des Genome-Editing, steht seit
kurzem eine weitere Technologie auf dem Zettel des Nobelpreis-
Komitees in Stockholm: die durch In-vitro-Translation und anschließen-
des Verpacken in Lipidnanopartikel produzierten mRNA-Impfstoffe.

                                                                                     Nobelpreisträgerin Charpentier ange-
                                                                                     strebten In-vivo-Gentherapie betrach-
                                                                                     tet, steht und fällt damit nicht weniger
                                                                                     als die Sicherheit der Therapie. Für den
                                                                                     bewährten Ex-vivo-Einsatz der Gen-
                                                                                     scheren in Medizin und Landwirtschaft
                                                                                     stehen ja entsprechende Selektionstools
                                                                                     zur Auswahl.

                                                                                     Zukunftstechnologien
                                                                                     Ein weiterer zellbiologischer Meilenstein
                                                                                     scheint nach den Befunden klinischer
                                                                                     Tests erst einmal verschoben: Präkli-
                                                                                     nische Test eines sowohl präventiv als
                                                                                     auch therapeutisch früh in der Infektion
                                                                                     einsetzbaren Virostatikums sahen gut
                                                                                     aus: In Hamstern reduzierte Molnu-
Im vergangenen Herbst war es endlich      los Meilensteine einer immer präziser      piravir (Entwicklungsname MK-4482
soweit: Lange hatten Jennifer Doudna      messbaren Zellbiologie und immer           oder EIDD-2801), das durch Einbau des
und Emanuelle Charpentier mit dem US-     besser steuerbaren Gentechnik, der die     synthetischen Nukleosid N4-Hydroxycy-
Forscher Feng Zhang um Patente und        europäische Öffentlichkeit bisher eher     tidin zur Kopierfehler bei der Vermeh-
wissenschaftliche Meriten gerungen. So    kritisch gegenüberstand. Aber Dank der     rung des viralen mRNA-Genoms führt,
gab das stets stärker auf akademische     Pandemie kann sie plötzlich gar nicht      den Virustiter um den Faktor 10,000,
Verdienste als Anwendungen fokussierte    genug davon kriegen.                       wenn vor der Virusinfektion, also als
Nobelpreiskomitee denn auch den akade-                                               Impfstoff, eingesetzt. Waren die Nager
mischen Erstentdeckerinnen den Vorzug.    Optimieren für translation                 bereits infiziert, reduzierte der von Rig-
Anders könnte es in diesem Jahr kom-      Genau wie die Jahre zuvor durch Phar-      dgeback Biotherapeutics und Vermark-
men, denn mit Ingmar Hoerr steht der      makäufe hochgejazzte siRNA-Technolo-       tungspartner Merck & Co entwickelte
Entdecker und gegen alle Unkenrufe der    gie krankt die medizinische Anwendung      Wirkstoff den Titer um immerhin noch
etablierten Player immune Entwickler      des Genome Editing derzeit immer noch      das 2500-Fache. Nur zum Vergleich, mR-
der mRNA-Vakzine auf der Einladungs-      an der fehlenden Zielgenauigkeit der       NA-Impfstoffe wie BNT-162b2, schaffen
liste nach Stockholm. Den Proof-of-Con-   Genscheren. Doch Experten der Uni-         gerade einmal Faktor 10, wenn es hoch
                                                                                                                                  Bildnachweis: vchal/istockphoto.com

cept durch Zulassung errangen zwar die    versitätsklinik Freiburg (vgl. Seite xx)   kommt. Als Phase IIa-Erfolg vermeldeten
Kollegen Özlem Türeci und Ugur Sahin,     beschrieben im März erstmals eine          die Unternehmen Anfang März indes
doch den ersten GMP-gerecht gefertig-     Technologie, mittels der sich nicht nur    nur einen sekundären Endpunkt: die
ten Impfstoff die Tübinger Curevac, die   On- und Off-Target-Effekte, sondern        Reduktion des Virustiters; aber nicht
eigentlich das jahrzehntelange Trauer-    auch genomische Rearrangements si-         den primären Endpunkt die Sicherheit
spiel um wirkungslose Krebsimpfstoffe     cher voraussagen lassen – beides wird      des Mutagens, das auch gegen Varianten
beenden wollte. Beides sind zweifel-      als große Zulassungshürde der von          wirksam ist.                           TG
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126 I laborwelt. Expertenstatement                                                                         |transkript 2.2021

TÜV für
CRISPR/Cas
Ein neuartiges Testverfahren bewertet erstmals umfassend, wie
präzise Genscheren schneiden und welche Kollateralschäden in
einer Zelle auftreten. Die Überprüfung hat eine hohe Bedeutung
für die Entwicklung und den Einsatz sicherer Gentherapien.

Laborwelt. Was leistet Ihre Methode und   Meilenstein war die Beschreibung der       kürzen. Für die biomedizinische For-
für welche Applikationen in Forschung     CRISPR/Cas9-Genschere im Jahre 2012,       schung und für viele biotechnologische
und Entwicklung ist sie geeignet?         die 2020 mit der Verleihung des Nobel-     Anwendungsbereiche ist der Nutzen der
                                          preises für Chemie an die Wissenschaft-    Genom-Editierung enorm.
Cathomen. Die zielgerichtete Modifika-    lerinnen Emmanuelle Charpentier und
tion des Erbguts, auch Genom-Editierung   Jennifer Doudna ausgezeichnet wurde.       Einsatz in der Medizin
genannt, eröffnet neue Perspektiven in    Entwicklungsprozesse, die früher meh-      Auch in der Medizin werden Genscheren
der Grundlagenforschung und für An-       rere Jahre dauerten, lassen sich mit der   eingesetzt. Zum ersten Mal können krank-
wendungen in der Biotechnologie. Ein      Genscheren-Technologie deutlich ver-       heitsauslösende Mutationen im Erbgut
                                                                                     von Patienten korrigiert werden. Der-
                                                                                     weil werden Genscheren in 56 Studien
                                                                                     zur Behandlung von Erbkrankheiten und
                                                                                     in der Krebstherapie klinisch getestet.
                                                                                     Für den Einsatz am Menschen bestehen
                                                                                     hohe Anforderungen im Hinblick auf die
                                                                                     Sicherheit. Zusätzlich zu der beabsich-
                                                                                     tigten Wirkung am Zielort, können Gen-
                                                                                     scheren an Stellen im Erbgut schneiden,
                                                                                     die sich geringfügig von der Zielsequenz
                                                                                     unterscheiden. Solche Fehlschnitte, auch
                                                                                     Off-Targets genannt, haben meist keine
                                                                                     negativen Folgen. Wenn aber ein Fehl-
                                                                                     schnitt ein kritisches regulatorisches
                                                                                     Element im Erbgut verändert, kann die
                                                                                     Zelle im schlimmsten Fall zu einer Tu-
                                                                                     morzelle entarten.

                                                                                     Off-Targets erkennen
                                                                                     Ob und wie präzise die Genscheren im
                                                                                     Erbgut schneiden, konnte bis dato nur
                                                                                     unzureichend untersucht werden. So wer-
                                                                                     den Off-Targets entweder im Reagenzglas
                                                                                                                                 Bildnachweis: Toni Cathomen/Elsevier

                                                                                     oder in Surrogat-Zelllinien bestimmt. Die
                                                                                     direkte Bestimmung von Fehlschnitten
                                                                                     in Patientenzellen oder gar die Identifi-
                                                                                     zierung chromosomaler Umlagerungen
                                                                                     waren bisher nicht möglich. Mit unserem
                                                                                     neuen Testverfahren CAST-Seq, lassen
Fließschema zum Versuchsablauf                                                       sich erstmals Ort und Umfang fehlerhaf-
Zellbiologie & Gentechnik - Transkript
|transkript 2.2021                                                                        Expertenstatement laborwelt. I 127

                                        ter Schnitte und potentiell gefährlicher                                                    Da ein solch komplexes Testverfahren die
                                        Umlagerungen im Erbgut klinisch rele-                           Prof. Dr. Toni              meisten Anwender technisch und bioin-
                                        vanter Zellen, wie etwa Blutstammzellen,                        Cathomen                    formatisch überfordert, haben wir eine
                                        bestimmen. Das Prinzip von CAST-Seq                             ist Direktor am Institut    Firma ausgegründet. BiObservR wird
                                        beruht auf der geschickten Kombination                          für Transfusionsmedi-       zukünftig verschiedene Testverfahren
                                                                                                        zin und Gentherapie
                                        der Hochdurchsatz-Sequenzierung mit ei-                         und Wissenschaftlicher      anbieten, die der Risikoabschätzung von
                                        ner smarten Bioinformatik. So lassen sich                       Direktor am Centrum         Genom-Editierverfahren dienen. Zudem
                                        Fehlschnitte im Erbgut annotieren und                           für Chronische Immun-
                                                                                                        defizienz der Universi-
                                        chromosomale Veränderungen klassifizie-
                                                                                                                                                                      Anzeige
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                                        ren und quantifizieren. Tatsächlich fan-
                                        den wir bei allen getesteten Gen­scheren
                                        unerwünschte Umgestaltungen im Erbgut         zung, welche die Zulassungsbehörden
                                        (doi: 10.1016/j.stem.2021.02.002).            zur Bewilligung einer klinischen Stu-
                                          Eine Risikobewertung dieser Verände-        die fordern.
                                        rungen ist unerlässlich. CAST-Seq wird      • Das Testverfahren kann in der Qua-
                                        deshalb während vier Entwicklungspha-         litätskontrolle zur Freigabe eines
                                        sen zum Einsatz kommen:                       Gen-editierten Arzneimittels einge-
                                                                                      setzt werden.                                 wird die Firma arzneimittelherstellende
Bildnachweis: evorion biotechnologies

                                        • Genscherenentwickler werden das           • Während der Anwendungsphase am                Unternehmen beraten, die Gen-editierte
                                          Testverfahren nutzen, um in einer           Patienten kann mittels CAST-Seq be-           Produkte oder Genom-Editierverfah-
                                          frühen Phase die für die klinische          urteilt werden, ob sich Gen-editierte         ren in die klinische Praxis überführen
                                          Translation geeigneten Genscheren           Zellen normal entwickeln oder ob              möchten. CAST-Seq wird in diesem
                                          zu identifizieren.                          Off-Target-Effekte eine gefährliche           Rahmen einen wichtigen Beitrag zur
                                        • CAST-Seq-Analysen werden Bestand-           klonale Vermehrung von Zellen ein-            Entwicklung sicherer Gentherapeutika
                                          teil der präklinischen Risikoabschät-       leiten.                                       leisten.                             •
Zellbiologie & Gentechnik - Transkript
128 I LABORWELT. Zellbiologie & Gentechnik                                                                           |transkript 2.2021

NanoCHIP SINGLE
CELL RNA-SEQ
Assay-Miniaturisierung ermöglicht die sensitive und kostengünstige
RNA-Sequenzierung individueller Zellen. Mit Hilfe automatisierter
Isolierung von Einzelzellen in Nanowells können aus kleinsten
Mengen RNA signifikante Genexepressionsprofile jeder Zelle
erzeugt werden.

von Dr. Muna Ali, SCIENION AG

Single Cell RNA-Sequencing, kurz               der RNA beeinträchtigen. Bei zahlrei-             die einzelnen Transkripte jeder Zelle
scRNA-seq, ist ein technologischer             chen gängigen Methoden werden die in              individuell nachweisen.
Trend in der Life-Sciences-Industrie           der Zellsuspension enthaltenen Zellen               Die Probenaufbereitung und cDNA-
und ermöglicht die Transkriptomanaly-          durch ein Durchflusszytometer vonei-              Erstellung findet im cellenCHIP statt.
se individueller Zellen. Damit kann die        nander getrennt – begleitet von hohen             Zunächst werden die Barcode-Oligos
zelluläre Heterogenität von Geweben            Zellverlusten. Aus diesen Gründen                 in den Nanowells durch Zugabe von
nachgewiesen werden, welche in der             wurde bei Cellenion eine miniaturi-               Lyse und Reverse Transkriptase-Puffer
Krebsdiagnostik eine entscheidende             sierte scRNA-seq-Methode mit Hilfe                rehydriert. Anschließend erfolgt die
Rolle spielt. Die Anforderungen an die-        eines Nanowellchips, dem cellenCHIP               schonende Isolierung und Verteilung
se Methoden sind hoch: Sie müssen              sow ie der cellenONE-Einzelzell-                  einzelner Zellen aus der Zellsuspensi-
sehr sensitiv das Transkriptom jeder           i s ol ie r u ng u nd D i s p e n s ie r u ng ,   on in den cellenCHIP mit dem cellen-
einzelnen Zelle erfassen, um quali-            ­entwickelt.                                      ONE. Nach Generierung der cDNA
tative und quantitative Analysen zu                                                              wird diese in Nanotrichtern aufgefan-
ermöglichen. Viele Methoden werden             Protokoll                                         gen und steht für die Erstellung der
in kommerziellen Mikrotiterplatten             Der cellenCHIP besteht aus vier iden-             cDNA-Bibliothek bereit.
entwickelt, müssen aber hinsichtlich           tischen 96-well-Arrays und enthält in
Kosten und Reaktionsvolumen opti-              jedem Nanowell oligo dT Primer, in-               Ergebnisse
miert werden. Eine Voraussetzung für           klusive eines Zell-Barcodes sowie eines           Mit dem cellenCHIP-Protokoll konn-
die erfolgreiche RNA-Sequenzierung             Unique Molecular Identifiers (UMI)                ten anhand von nur 100 Einzelzellen
stellt zudem die schonende Zellisolie-         für die cDNA-Generierung. Anhand                  signifikante Unterschiede in den Gen-
rung dar, denn diese kann die Qualität         des Barcodes und des UMIs lassen sich             expressionsprofilen von Leberzellen
                                                                                                 (HepaRG) aus 2D-Monolayer und 3D-
                                                                                                 Sphäroid-Kultur gefunden werden.
                                                                                                 Wie in der Literatur beschrieben,
                                                                                                 zeigten die in 3D kultivierten He-
                                                                                                 paRG- Zellen einen leberähnlicheren
                                                                                                 Phänotyp im Vergleich zu Zellen, die
                                                                                                 klassisch im Monolayer kultiviert wur-
                                                                                                 den.
                                                                                                   Die Kombination aus Nanowells,
                                                                                                 Einzelzellisolierung und Nanoliter-
                                                                                                                                           Bildnachweis: SCIENION AG

                                                                                                 Dispensierung ermöglicht die Mini-
                                                                                                 aturisierung von Mikrotiterplatten-
Schematischer Ablauf der Einzelzellisolierung mit cellenONE in den Barcoded cellenCHIP für
scRNA-seq. HepaRG-Zellsuspensionen aus 2D- und 3D-Kultur werden mit Hilfe des cellen-
                                                                                                 basierten Protokollen und damit den
ONE in einzelne Zellen aufgetrennt und in den cellenCHIP verteilt. Nach cDNA-Generierung im      Zugang zu sensitiven und kostengüns-
cellenCHIP erfolgt die Erstellung der cDNA-Bibliothek und Genexpressionsanalyse.                 tigen Einzelzell-Applikationen.     •
Zellbiologie & Gentechnik - Transkript
ACCELERATE THE DEVELOPMENT
OF VACCINES AND BIOLOGICS
WITH THE BIOXP™ 3250 SYSTEM
 The BioXp™ 3250 system dramatically reduces the timelines
for identifying antibody and vaccine candidates from weeks to
 days by automatically assembling DNA clones, libraries, and
            gene fragments, in a single overnight run.

 Visit codexdna.com to register for our May 5, 2021 webinar,
     Development of a replicon RNA vaccine platform for
response to emerging variants of SARS-CoV-2, presented by
Dr. Jesse Erasmus, Department of Microbiology, University of
              Washington School of Medicine.

  GENE SYNTHESIS             DNA CLONING                 LIBRARIES

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Zellbiologie & Gentechnik - Transkript
130 I LABORWELT. Zellbiologie & Gentechnik                                                                   |transkript 2.2021

Die Dimension
zählt
Eine neue Technologie ermöglicht die Herstellung von uniformen
3D-Zellsphäroiden für die Stammzell- und Krebsforschung sowie
präklinische Arzneimittelentwicklung.

von Dr. Alexander Schepsky, faCELLitate

Um die Ursache vieler Erkrankungen im        wachsen die Zellen in dreidimensiona-      der Kulturplatte und ermöglicht die
Menschen zu verstehen, benötigt es ge-       len (3D) Modellen in einer naturnahen      Bildung von uniformen, runden Sphä-
eignete Modellsysteme, die es den Wis-       Umgebung. Ergebnisse aus 3D-Zellex-        roiden, selbst bei Zellarten, die für
senschaftlern im Labor ermöglichen           perimenten gelten als physiologisch        die 3D-Kultur nur schwer zugänglich
valide, auf den Menschen übertragbare        repräsentativ für den Menschen. Da-        sind. Im Vergleich zu anderen auf dem
Ergebnisse zu erzeugen. Heutzutage           durch steigen die Aussichten eines Me-     Markt erhältlichen Produkten sticht
werden die Analyse und das Testen von        dikamentes, die Prüfung im Tiermodell      BIOF LOAT T M du rc h sei ne ei n f a-
Medikamenten an solchen Modellen             zu bestehen, um ein Vielfaches. Dabei      che Handhabung und die hohe Re-
überwiegend im Hochdurchsatz durch-          werden kugelförmige 3D-Zellsphäroide       produzierbarkeit der Zellsphäroide he-
geführt. Die standardisierten zweidi-        zunehmend zum Modell der Wahl für          raus. Die mit BIOFLOAT TM ermittelten
mensionalen (2D) Modellsysteme erfül-        die präklinische Forschung mit dem         Ergebnisse sind für die Humanbiologie
len jedoch nicht die Voraussetzungen,        Potential zur Standardisierung von In-     von hoher Relevanz. Zudem werden
um diese Prozesse voll auszuschöpfen         vitro-Modellen für Hochdurchsatzver-       Risiken beim Übergang von der prä-
und eine Übertragbarkeit auf den Men-        fahren.                                    klinischen zur klinischen Forschung
schen zu erlauben. Das führt dazu, dass        Eine neue Möglichkeit zur Sphäroid­      verringert. BIOFLOAT TM-Produkte eig-
ein Großteil neuer Medikamente den           kultivierung hat nun das Venture Team      nen sich zur standardisierten Analyse
Sprung von der Zellkultur in das be-         faCELLitate aus dem der BASF ange-         von Zellmodellen im Hochdurch-
nötigte Tiermodell nicht erreicht – zu       gliedertem Chemovator entwickelt.          satz.
groß sind die Unterschiede zwischen          Die Produktlinie BIOFLOAT TM verhin-
beiden Systemen. Im Gegensatz dazu           dert Zell- und Proteinadsorption an        BIOFLOAT TM -96-well-plate:
                                                                                        Die BIOFLOAT TM-96-well-Platte eignet
                                                                                        sich hervorragend zur verlässlichen und
                                                                                        schnellen Erzeugung von 3D-Sphäro-
                                                                                        iden. Die BIOFLOAT TM-Beschichtung
                                                                                        ist mechanisch sehr stabil und kratz-
                                                                                        resistent.

                                                                                        BIOFLOAT TM FLEX coating :
                                                                                        Mit der BIOFLOAT TM FLEX coating so-
                                                                                        lution lässt sich jeder gängige Zellkul-
                                                                                        turartikel aus Kunststoff innerhalb we-
                                                                                        niger Sekunden mit den einzigartigen
                                                                                        BIOFLOAT TM -Polymeren beschich-
                                                                                                                                   Bildnachweis: faCELLitate

                                                                                        ten. Nach wenigen Minuten ist der
                                                                                        beschichtete Laborartikel zellabwei-
                                                                                        send und sogar proteinabweisend. Die
Schematische Darstellung des einfachen Beschichtungsprozesses von BIOFLOATTM-96-well-   so beschichteten Artikel können direkt
Platten und mikroskopische Aufnahmen von Sphäroiden auf einer Platte                    benutzt oder gelagert werden.         •
|transkript 2.2021                                                        Zellbiologie & Gentechnik laborwelt. I 131

                             verloren im ewigen eis –
                                                                                                                Listen, die der Komplexität der Lagerung
                                                                                                                und dem Wert der Proben nicht gerecht

                             kryolagerung
                                                                                                                werden.
                                                                                                                  Aber wenn mehrere Mitarbeiter Zu-
                                                                                                                griff auf das Zelllager haben, neue Stocks
                             Ein Gefühl der Hilflosigkeit macht                                                 nur mal eben „zwischengelagert“ werden
                             sich breit, wenn Zellen aus dem Kry-                                               und die ein oder andere Auslagerung
                             ostock aufgetaut werden sollen, sich                                               übersehen wird, ist das Chaos perfekt.
                             aber gar nicht mehr an der vermeint-                                               Eine unverwechselbare Zuordnung der
                             lichen Lagerposition im Flüssigstick-                                              verzeichneten Stocks ist nicht mehr ge-
                             stofftank befinden. Oft beginnt dann                                               geben. Und ob die aufgetauten Zellen
                             eine Schnitzeljagd durch die diversen                                              wie erwartet wachsen und funktionieren
                             Boxen des Tanks und mitunter finden                                                wird zum Glücksspiel.
                             sich Zellen eines längst ausgestorben                                                Mit Cellseeker gibt es nun erstmals
                             Mammuts, die ein inzwischen eme-                                                   eine auf akademische Labore zuge-
                             ritierter Doktorand seinerzeit einge-                                              schnittene Lösung, alle Informationen
                             froren hatte.                                                                      zu Zellen und Kryostocks zusammen-
                                Die Kryolagerung von Zellkultu-                                                 zufassen und in einem virtuellen Lager-
                             ren birgt eine besondere Herausfor-                                                system zu organisieren.                 •
                             derung. Man kann nicht so einfach
                             Inventur machen und den Inhalt der      Umso wichtiger ist es, sorgfältig zu do-   Kontakt:
  Bildnachweis: Cellseeker

                             Tanks überprüfen, ohne dabei die kon-   kumentieren, was, wann, und von wem        Dr. Oliver Wehmeier
                             tinuierliche Tiefsttemperaturlagerung   ein-, aus- oder umgelagert wurde. Über     Cellseeker GmbH, Hamburg
                             zu unterbrechen und die Qualität der    90% der Zellkulturlabore verwenden         oliver@cellseeker.org
                             Zellen zu gefährden.                    einfache Tabellen oder handschriftliche    www.cellseeker.org

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132 I LABORWELT. INTERVIEW                                                                                       |transkript 2.2021

       Aufwind für
       Plasmide
        Nicht zuletzt durch COVID sind die Zulieferer für mRNA-Vakzine
        sowie Zell- und Gentherapievektoren ins Rampenlicht gerückt.
        LABORWELT sprach mit Dr. Martin Schleef, Geschäftsführer von
        PlasmidFactory über die wachsende Bedeutung der DNA-Vorlagen.

        LABORWELT. Unlängst hat Ihr Unter-         durch In-vitro-Transkription sowie für         Herstellung zurückgestellt und ja gesagt.
        nehmen mit Unterstützung des Landes        Impf- oder Gen- und Zelltherapievektoren.      Das war für manche Kunden nicht ein-
        Nordrhein-Westfalen die Produktionska-     Im Zuge der aktuellen COVID-19-Pande-          fach, aber insgesamt war die Akzeptanz,
        pazität für Plasmid-DNA am Standort Bie-   mie ist insbesondere die Nachfrage bei         im RNA-Sektor sowie bei Kunden, die an
        lefeld ausgebaut. Warum?                   mRNA-Impfstoffen immens gestiegen. Di-         Gen- und Zelltherapien forschen, sehr
                                                   verse Hersteller haben im Frühjahr 2020        groß. Und entgegen allen Unkenrufen, es
        Schleef. Plasmid-DNA ist die Basis für     bei uns angefragt, ob wir mitmachen. Wir       gebe einen Impfstoffengpass, lief die Ent-
        die Forschung an und die Herstellung von   haben daraufhin zahlreiche der für 2020        wicklung mit atemberaubender Geschwin-
        mRNA-Impfstoffen und -Therapeutika         geplanten Projekte zur regulären DNA-          digkeit. Aktuell erweitern wir, und im

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|transkript 2.2021

                                                                                  beliefern schon jetzt weltweit alle größeren
                                                                                  Hersteller von RNA-Wirkstoffen, egal ob
                                                                                  es nun Antisense-Nukleotide oder mRNAs
                                                                                  für die Impfung oder den Einsatz in Kom-
                                                                                  bination mit Krebsimmuntherapien sind.
                                                                                  Zusätzlich liefern wir die Vorlagen für die
                                                                                  Vektorentwicklung von Zelltherapien, zum
                                                                                  Beispiel CAR-T-Therapien in der Onko-
                                                                                  logie, und für Gentherapien, die im auf-
                                                                                  strebenden Feld der seltenen Krankheiten
                                                                                  immer häufiger Einsatz finden. Das alles
                                            Dr. Martin Schleef                    sind Wachstumsfelder, die es auch nach
                                             Geschäftsführer PlasmidFactory       der aktuellen COVID-19-Pandemie geben
                                               GmbH & Co. KG, Bielefeld           wird und denen immenses Marktpotential
                                                                                  zugeschrieben wird. Genau wie an weiteren
                                                                                  mRNA-Impfstoffgenerationen wird gerade
                                    Sommer entsteht eine zusätzliche Anlage       im Bereich der Gen- und Zelltherapie inten-
                                    in Modulbauweise zur Plasmid-DNA-Her-         siv geforscht. PlasmidFactory wächst hier
                                    stellung mit Fermentation, Extraktion und     also mit dem Markt.
                                    Reinigung der Plasmid-DNA sowie Medi-
                                    envorbereitung und Lagerkapazität.            LABORWELT. Wohin geht aktuell die
                                                                                  Reise bei RNA-Pandemie-Vakzinen?
                                    LABORWELT. Es gibt also keinen Eng-
                                    pass in der Impfstoffproduktion?              Schleef. Der Bedarf an Plasmiden ist hoch
                                                                                  und wird wegen des Auftretens von SARS-
                                    Schleef. Was es gibt, ist eine jahrzehnte-    CoV-2-Mutanten weiter steigen. Zwar wird
                                    lange Ignoranz der RNA-Technologie für        aktuell über Dinge wie eine dritte Dosis oder
                                    Immunisierungen, die jetzt alle auf einmal    an die bekannten Mutanten angepasste Vak-                                    AAV
                                    und sofort haben wollten, inklusive dieje-    zine gesprochen, und entsprechende Ent-                                      Plasmids
                                    nigen, die vorher behauptet haben, dass       wicklungen werden schnell umgesetzt. Doch                                    TO GO
                                    mRNA-Vakzine nie funktionieren werden.        der Tag wird kommen, an dem die Vakzine,
                                    Ich freue mich über den Proof-of-concept,     die wir heute kennen, nicht mehr wirken           Helper & Packaging
                                    obgleich man den auch gut und gerne zehn      werden. Es muss also weiter geforscht wer-
                                    Jahre früher hätte haben können und vor       den, auch an mRNA-Impfstoffen, die andere            Plasmide zur
                                    allen Dingen ohne Pandemie. Das aktuelle      Targets als das virale Spikeprotein gleich-
                                    Bashing der AstraZeneca-Vakzine kann ich      zeitig angreifen. Ein unbestreitbarer Vor-         AAV-Herstellung
                                    indes nicht nachvollziehen.                   teil der mRNA-Vakzine gegenüber anderen
                                                                                  Impfstoffarten ist, dass man RNA-Vakzine
                                    LABORWELT. Ist die Erweiterung auch           mischen kann. Ein Nachteil ist der im Mo-                   In Stock Service
                                                                                                                                       für kurze Lieferzeiten (< 48 h)
                                    eine Investition in die Zukunft?              ment noch verlustreiche Prozess, zumindest
                                                                                  wenn man eine hohe Qualität erreichen will,                2-Plasmid-System:
                                    Schleef. Natürlich, denn wir liefern ja die   und dass zunächst einmal eine ganz neue            Helper- und Packaging-Funktionen
                                    DNA-Vorlagen, die Forscher und Hersteller     Produktionsinfrastruktur aufgebaut werden                auf nur einem Plasmid
                                    zur Produktion von RNA benötigen. Wir         musste.                                   TG   Langjährige Erfahrung mit der Herstellung
                                                                                                                                    von Vektorplasmiden („ITR Rescue“)

                                                                                                                                              Umfangreiche QC
                                                                                                                                       für reproduzierbare Ergebnisse
Bildnachweis: PlasmidFactory GmbH

                                                                                                                                    PlasmidFactory.com
                                                                                                                                        PlasmidFactory GmbH & Co. KG
                                                                                                                                      Meisenstraße 96 | D-33607 Bielefeld
                                                                                                                                            info@plasmidfactory.com
134 I LABORWELT. produkt                                                                                      |transkript 2.2021

Bresser GmbH

Mikroskope für Labor- und Klinikbetrieb
Moderne Mikroskope mit          fahren erfüllen und gleichzei-    kumentieren. Aufgrund des
komplexen Optiken und Fil-      tig hochauflösende Bilder in      modularen Aufbaus können
tern helfen in der Lebensmit-   zuverlässiger Qualität liefern.   diese Mikroskope für jede La-
telindustrie, Mikrobiologie     Dafür eignen sich beispiels-      borumgebung und Applika-
und Pharmazeutik, selbst        weise die flexiblen Mikrosko-     tion optimal individualisiert
kleinste Organismen bis in      pe der NE900-Serie aus dem        werden. Die flexiblen Mikros-
den Bereich 1 µm zu unter-      Hause Nexcope. Dank zahl-         kope von Nexcope werden im
suchen. Bei diesen Arbeits-     reicher Kontrastverfahren         europäischen Raum durch die
schritten müssen sie oft ein    und Möglichkeiten zur Erwei-      Bresser GmbH vertrieben.
besonders breites Spektrum      terung durch Mikrokameras                                           Bresser GmbH
an Anforderungen wie effi-      lassen sich mikroskopische                                          Tel.: +49-2872-8074-0
zientes Probenscreening mit     Proben untersuchen und so-                                          Fax: +49-2872-8074-444
verschiedensten Kontrastver-    gar im Gigapixelbereich do-                    www.bresser.de       info@bresser.de

SARSTEDT AG & Co. KG

SARSTEDT lumox®- und x-well-Technologie
Optimaler Gasaustausch,         des Folienbodens werden die       tät auch in der automatisier-
hohe Transparenz, geringe       Zellen direkt mit Sauerstoff      ten Analyse mittels Imaging-/
Autof luoreszenz und ge-        versorgt und Stoffwechsel-        Reader-Techniken.
steigerte Lichttransmission     produkte wie CO2 können             SARSTEDT bietet lumox®-
– viele Gründe für die Kul-     sofort entweichen, so dass        Schalen und -Platten sowie        trägern weiterer Materiali-
tivierung adhärenter Zellen     die Zellen ideale Wachstums-      x-well-Zellkulturkammern          en sowie mit verschiedenen
auf lumox ®-Produkten für       bedingungen vorfinden. Die        für die direkte Kultivierung      Aufsätzen erhältlich.
die Analyse mittels Fluores-    hervorragenden optischen Ei-      und Analyse von Zellen auf                 www.sarstedt.com
zenzmikroskopie oder fluo-      genschaften, auch bei kurzen      einem Objektträger an. Die
reszenzbasierter Assays. Auf-   Wellenlängen, erlauben eine       Zellkulturkammern sind            SARSTEDT AG & Co. KG
grund der Gasdurchlässigkeit    gleichbleibend hohe Sensitivi-    neben lumox® mit Objekt-          Tel.: +49 2293 305-0

CANDOR Bioscience GmbH

SafetyTector™ S: Schutz bei Antigentests
                                                                                                                                    Bildnachweis: Sarstedt (oben), Bresser GmbH (mitte), CANDOR Biosicence

SafetyTector™ S zur Produk-     Hierdurch werden SARS-CoV-        Safe Design von Antigen-
tion von Antigen-Schnelltests   2-Viren innerhalb von einer       Schnelltests kann so einfach
ist ein SARS-CoV-2 inakti-      Minute inaktiviert und die        umgesetzt werden. Die vi-
vierender Extraktions- und      Proben sind nicht mehr infek-     rusinaktivierende Wirkung
Verdünnungspuffer für Spei-     tiös. Das hohe Infektionsrisiko   wurde durch entsprechende
chelproben sowie Nasen- und     für den Anwender während          Testung mit infektiösen Co-
Rachenabstriche. Bisherige      und nach der Testdurchfüh-        rona- und Grippeviren in ei-      CANDOR Bioscience GmbH
Puffer ohne Virusinaktivie-     rung durch die Probe im Ent-      nem S3-Labor bestätigt. Safe-     Simoniusstraße 39
rung lassen sich einfach er-    nahmeröhrchen sowie durch         tyTector™ S kann sowohl für       88239 Wangen
setzen. Die Abstrichtupfer      andere Testmaterialien wird       Lateral-Flow-Tests als auch bei   Tel.: +49 7522 79527-0
können direkt in SafetyTec-     durch die Verwendung von          ELISA eingesetzt werden.          Fax: +49 7522 79527-29
tor™ S aufgenommen werden.      SafetyTector™ S minimiert.          www.candor-bioscience.de        info@candor-bioscience.de
|transkript 2.2021                                                                                          LABORWELT. I 135

                                              Naturstoffforschung

                                              Gemeinsam stark gegen
                                              Fressfeinde
                                              Auf engstem Raum, zum Beispiel im
                                              Waldboden, leben Mikroorganismen
                                              zusammen – das funktioniert mal
                                              besser, mal schlechter. Gesteuert wird
                                              dieses Zusammenleben von Natur-
                                              stoffen. Jenaer Wissenschaftler haben
                                              nun herausgefunden, dass zwei Bak-
                                              teriengattungen zusammenarbeiten,
                                              um sich ihres Fressfeindes Amöbe zu
                                              erwehren. Dafür nutzen Pseudomonas
                                              und Paenibacillus einen Verteidigungs-
                                              mechanismus: Pseudomonas bildet das
                                              Lipopeptid Syringafactin. Dieses wird
                                              durch Peptidasen von Paenibacillus ge-
                                              spalten. Dabei entstehen für die Amö-
                                              ben tödliche Verbindungen.
                                                Diese strategische Kooperation ent-
                                              deckten die Forscher um Pierre Stall-
                                              forth vom Jenaer Leibniz-Institut für
                                              Naturstoff-Forschung und Infektions-
Bildnachweis: Ruchira Mukherji, Leibniz-HKI

                                              biologie – Hans-Knöll-Institut (Leibniz-   Mikroskopaufnahme einer von Bakterien getöteten Amöbe
                                              HKI), weil sie die Mikroorganismen
                                              nicht wie üblich einzeln, sondern ge-      en möglichst naturnahe Bedingungen          lenzcluster „Balance of the Microverse“
                                              meinsam kultivierten.                      herzustellen, denn inzwischen wissen        mit, der sich mit der interdisziplinären
                                                „Der Mangel an neuen Wirkstoffen         wir, dass Mikroorganismen sich in           Mikrobiomforschung beschäftigt. Ihre
                                              für Medikamente erfordert, neue Wege       Gemeinschaft anders verhalten, als in       Ergebnisse veröffentlichten die Wissen-
                                              in der Naturstoff-Forschung zu gehen.      Reinkulturen“, so Stallforth. Der For-      schaftler in PNAS (https://www.pnas.org/
                                              Wir versuchen, in unseren Laboratori-      scher arbeitet auch am Jenaer Exzel-        content/118/6/e2013759118).            .
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