Barbara Grune, Daniel Butzke - ZEBET-Datenbank und Informationsbeschaffung Strategien zum Finden hochwertiger Informationen zu Alternativmethoden ...
←
→
Transkription von Seiteninhalten
Wenn Ihr Browser die Seite nicht korrekt rendert, bitte, lesen Sie den Inhalt der Seite unten
Strategien zum Finden
ÜR RISIKOBEWERTUNG
hochwertiger Informationen zu
Alternativmethoden zum Tierversuch
UNDESINSTITUT
Barbara Grune, Daniel Butzke
ZEBET-Datenbank und Informationsbeschaffung
Die Inhalte der Präsentation
7. Tools
6. Suchschema
5. Arbeiten mit PubMed
4. Informationsquellen und Portale
3. Vorbereitung einer Recherche
2. Allgemeines zu Recherchen
1. Gesetzliche Regulierung von Tierversuchen
1. Gesetzliche Regulierung
1. Gesetzliche Regulierung von Tierversuchen
• EU-Richtlinie 86/609/EEC (24. November 1986) zum
Schutz der für Versuche und andere wissenschaftliche
Zwecke verwendeten Tiere, Artikel 7 (2)
• Deutsches Tierschutzgesetz, § 7 Absatz 2:
„Bei der Entscheidung, ob Tierversuche unerlässlich sind,
ist insbesondere der jeweilige Stand der
wissenschaftlichen Erkenntnisse zugrunde zu legen und
zu prüfen, ob der verfolgte Zweck nicht durch andere
Methoden oder Verfahren erreicht werden kann.“
1. „Stand der wissenschaftlichen Erkenntnis“
20.000.000
18.000.000
16.000.000
14.000.000
12.000.000
10.000.000
8.000.000
Abstracts Cited in MEDLINE
6.000.000
1986 1988 1990 1992 1994 1996 1998 2000 2002 2004 2006 2008
1. Eingesetzte Zeit für eine Recherche
Leenaars et al. 2009 ATLA 37
1. Häufigste Probleme bei der Recherche
Sources:
1. PubMed (Medline): 96%
2. ISI Web of Science: 52%
3. Spezielle Seiten
(z.B. AWIC, Altweb, Altbib etc.): 0%
Leenaars et al. 2009 ATLA 37
2. Allgemeines zu Recherchen
2. Zielsetzung einer Recherche
1. Übersichts-Recherche
(Ideen sammeln, Überblick gewinnen, etc.,
Muscheln, See- kein Anspruch auf Vollständigkeit)
sterne, Seeigel
Spülsaum
Bild von einem Strand
Aussage: Vergleich einer einfachen Google-/PubMed-Suche mit
einem Spaziergang am Spülsaum. Angespülte Muscheln etc.
vermitteln einen sehr unvollständigen Eindruck vom Leben im Meer.
Diese Art der „Informationsgewinnung“ ist sehr passiv, man hat
kaum Einfluß darauf was an erster Stelle „angespült“ wird.
2. Zielsetzung einer Recherche
2. Systematische Recherche
(Fragen beantworten, spezifische
Information finden bzw. ausschließen;
Autoschlüssel
Vollständigkeit ist unerläßlich)
Bild von einem Strand
x
Aussage: Die systematische Suche ist vergleichbar mit einer Suche
nach einem verlorenen Autoschlüssel. Zuerst macht man sich
Gedanken, an welchen Stellen die Suche am erfolgversprechensten
ist und wie man diese am Besten eingrenzen kann. Diese sucht
man dann nacheinander ab.2. Recherche-Phasen eines Tierversuchsvorhabens
Idee zu einem Versuchsvorhaben Stop! Falls eine geeignete Ersatzmethode gefunden wurde
Vorbereitung Formulierung des Prüfung durch Zustimmung
Genehmigungsantrages Genehmigungsbehörde oder
berücksichtigt 3R Ablehnung
Recherchen zum Stand Recherchen zur Unerläßlichkeitsrecherche
der Erkenntnis/ Verfügbarkeit von für beantragte Form
Forschung Alternativmethoden 3R des Versuchsvorhabens
Deutsches Tierschutzgesetz und
Legen den Einsatz von Versuchstieren nahe
Verwaltungsvorschrift
„ Die Genehmigungsbehörde prüft, ob der Antragsteller − in einer den Zeit
= formlos
Anforderungen an wissenschaftliches Arbeiten entsprechenden
= vorgegeben Weise – Tatsachen und Sachverhalte so dargelegt hat …“2. Qualitätsmerkmale einer Recherche
1. Vollständigkeit (recall)
2. Präzision (precision)
3. Aktualität
4. Verläßlichkeit (peer reviewed)
=>
Informationen haben Relevanz als Entscheidungsgrundlage3. Vorbereitung einer Recherche
3. Rechercheplanung
• Zielsetzung (TSG!)
• Merkmale
• Suchbegriffe und Quellen
(systematisch herleiten)
• Ausschlusskriterien
(Anforderungen an gefundene Informationen um sie in die Erwägungen mit
einzubeziehen?)
• Abbruchkriterium
(wann ist die Recherche beendet?)
• Protokollierung (Transparenz, Reproduzierbarkeit)3. Suchbegriffe
• Suchbegriffe sind die „Grundbausteine“
einer Recherche
• Sie haben verschiedene Wertigkeiten!
• Sie sind meistens nicht eindeutig!
Begriffe für das 3R- Kontextabhängige
Gebiet der Recherche Begriffe
• humane Endpunkte Bereich:
• Stoffsicherheit
Zielsetzung:
• lokale Reaktion
Methode/Modell:
• Kaninchen, Auge usw.3. Operatoren und Tools
1. Boolesche Verknüpfungen AND, NOT finden Koinzidenz
bzw. Nicht-Koinzidenz von Suchtermen
eye AND irritation „keep an eye on public irritation!“
2. Boolesche Verknüpfung OR kann eingesetzt werden, um
Synonyme eines Suchterms zu finden
eye OR ocular „…ocular irritation…“, „…eye irritation…“
3. Kontext Verknüpfung NEAR findet Suchterme im
Sinnzusammenhang
eye NEAR irritation „…an irritation of the left eye…“
4. Stellvertretersymbole $, ?, * finden verschiedene
„Morphologien“ eines Suchterms
irrita? „…irritation…“, „irritating…“, „…irritant…“4. Informationsquellen und Portale
4. Ressourcen im Überblick
A.„Added-value“ Datenbanken mit 3R-Focus
NORINA
AnimALT- ZEBET (BfR)
B. Bibliografische und Meta- Datenbanken, Hosts, Open Access Resourcen
C. 3R-relevante Zeitschriften und Organisationen, wiss. Spezialdatenbanken4. Portale als komfortabler Einstiegspunkt
http://altweb.jhsph.edu/
http://www.knockoutmouse.org
http://rzblx10.uni-regensburg.de/dbinfo/4. DBIS, Nationallizenzen
http://rzblx10.uni-regensburg.de/dbinfo/4. DBIS, Nationallizenzen im Bereich Biologie
4. Patendatenbanken (esp@cenet, USPatfull, …): http://www.patentlens.net/patentlens/quick.html
4. AnimAlt-ZEBET; http://www.bfr.bund.de
4. AnimAlt-ZEBET, eigenständige Version demnächst verfügbar
4. Schlüsselinformationen auf einen Blick
Name Zweck
Replacement,
Reduction, Entwicklung,
Refinement Validierung,
Akkzeptanz
Replacement
Relevanz4. Zur Zeit rund 140 Methoden“portraits“
Toxicology 59
Physiology 2
Pharmacy 26
Pharmacology 21
Parasitology 4
Molecular Biology 3
Microbiology 6
Immunology 6
Food Hygiene 5
Cell Biology 1
Animal Production 24. Beispiele aus der Grundlagenforschung: transgene Tiere
„Humanisierte“ Mäuse:
• zur Gewinnung von therapeutischen „humanen“ Antikörpern
• Mögliche Alternative:
„Phage Display“ - Technik
z.B. Adalimumab (Humira) gegen Arthritis
Tiermodelle für genetische Erkrankungen:
• z.B. zur in vivo Validierung neuer Medikamente
• Mögliche Alternativen:
iPS-Zellen von Betroffenen
taxodros.unizh.ch Aasen et al Nat Biotech 2008
Transgene Fliegen als Alzheimermodel4. ECVAM Database Service on Alternative Methods to Animal Experimentation (DB-ALM); http://ecvam-dbalm.jrc.ec.europa.eu/
5. Arbeiten mit PubMed
5. PubMED; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
5. PubMED; neue Oberfläche
5. PubMED; simple search
5. PubMED: Query Translation
5. PubMED: Query Translation
5. PubMED: Query Translation
5. Index
• Recherche anhand der „Indexierung“
von Dokumenten,
z.B. MeSH-Term basierte Recherchen in PubMED
B
io
m
ed
ic
al
t
en
re
r im
se
ar
pe
Natural sciences
ch
ex
An
al
im
im
An
al
!
ce
us
p la
Re
ea
In v
it r o
lt e
…
rn a
t iv
el
od
es
m
Refine!
S k in5. PubMED: MeSH Terms
5. PubMED: MeSH Terms
Simple search vs. MeSH-term-based search
5. PubMED; simple search
5. PubMED; simple search
5. PubMED; simple search
3R Relevanz ???5. Index
• Recherche anhand der „Indexierung“
von Dokumenten,
z.B. MeSH-Term basierte Recherchen in PubMED
B
io
m
ed
ic
al
t
en
re
r im
se
ar
pe
Natural sciences
ch
ex
An
al
im
im
An
al
!
ce
us
p la
Re
ea
In v
it r o
lt e
…
rn a
t iv
el
od
es
m
Refine!
S k in5. PubMED: MeSH-Thesaurus
5. PubMED; MeSH term based search
3R Relevanz !!!5. AGRICOLA; http://agricola.nal.usda.gov/
6. Suchschema
6. Vorschlag für ein „Suchschema“
+++
„Added-value“ Datenbanken (z.B. AnimAlt-ZEBET):
Spezifität
Vollständigkeit
Hochwertige Information mit geringem Aufwand finden
+
„Broad-coverage“ Datenbanken (z.B. PubMED
(+ Bereichsdefinition):
Information mit mittlerem Aufwand finden
++
Metasuche (mehrere Quellen)
Information mit hohem Aufwand finden
-
komplexe Suchstrategie erforderlich
Ozean
der unstrukturierten
Rohinformation
+++7. Tools
7. Semantische Tools
Semantik (gr. σηµαίνειν sēmainein „bezeichnen“):
Theorie oder Wissenschaft von der Bedeutung der (sprachlichen)
Zeichen
In der Anwendung (Computerlinguistik):
Inhalt (Thema) eines Textes rechnergestützt anhand der getroffenen Wortwahl
erfassenhttp://www.go3r.org/
7. Pubfinder, http://www.glycosciences.de/tools/PubFinder/
7. Pubfinder, http://www.glycosciences.de/tools/PubFinder/
7. ECVAM Guide to Good Search Practice
Journals
Legislation Databases
Good Search Practice
Search Engines Open Access
OrganizationsÜR RISIKOBEWERTUNG
DANKE FÜR IHRE
AUFMERKSAMKEIT
UNDESINSTITUT
Dr. Daniel Butzke
Dr. Barbara Grune
Bundesinstitut für Risikobewertung
Thielallee 88-92 D-14195 Berlin
Tel. 0 30 - 84 12 - 0 Fax 0 30 - 84 12 - 47 41
bfr@bfr.bund.de www.bfr.bund.deSie können auch lesen
