PHAGEN THERAPIE - VOM LABOR ANS KRANKENBETT - BFR FORUM VERBRAUCHERSCHUTZ BAKTERIOPHAGEN

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Phagen Therapie –
vom Labor ans Krankenbett
   BfR Forum Verbraucherschutz Bakteriophagen
                  Harald Brüssow
           KU Leuven Universität, Belgien
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Ein attraktives Laborkonzept: Infektion von bakteriellen Krankheitserregern mit Viren

          Escherichia coli infiziert mit T4 Phagen

                          Microbe 2, 341
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Die Herausforderung: Durchfallserkrankungen von Kleinkindern in Entwicklungsländern

  Dhaka/ Bangladesch: der Welt grösstes Durchfalls-Forschungszentrum
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Problem 2: Phagen sind nicht nur Spezies-
                                                           spezifisch (Vorteil über Antibiotika), sondern
                                                           Serotype-spezifisch (über 100 O Serotypen in E.
                                                           coli)

Problem 1: mehrere bakterielle Durchfallserreger (Vibrio
cholerae, Shigella, E. coli), dazu noch Rotaviren
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Vom Ausgangsmaterial Stuhl über Phagen Isolierung zur Phagen Produktion

        Stuhl als Phagen Quelle                              Phagen auf
                                           JB 186, 8287
                                                             Bakterienrasen: K803           Vermehrung in Fermentern
                                                             R/M-; O-; φ-; seq

                                                 MALDI-TOF

       Reinigung und Analyse      AEM 80, 1469                                                             Metagenom:
                                                                           Virol 434, 222
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Das russische Vergleichsprodukt von Microgen

Analyse mittels
Metagenom                                     zwei unterschiedliche Konzepte:
Sequenzierung                                 *Cocktail von T4 Phagen
                                              *Cocktail von >12 Phagen Gruppen

                                             Virol 443, 187
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A              7
                                                                                                                                   T7
                                                                               6
          Phagenvermehrung im Darm                                             5
          von Mäusen:

                                                                 log [pfu/g]
                                                                               4
          Pharmakokinetik- und                                                 3
          Sicherheits-Studien                                                  2                                                 Keimfrei
                                                                               1
                                                                               0
                                                                                   0       5       10      15    20    25   30
                                                                                                        Time [hours]
                                     T4                         B
              9                                                                12
                                                                               11
              8
                                                                               10
log [pfu/g]

              7                                          MC

                                                              log [pfu/g]
                                                                               9
                                                                               8
              6
                                                                               7
                                                                                                                                 E. coli
              5                                                                6                                                 besiedelt
                                                                               5
              4                                          GF                    4
              3                                                                3
                  0           5      10     15     20   25
                                      Time [hours]                             2
                                                                               1
                                                                                       0   4   6    8     11 24 30 48 144 168
                      Virol 393,16                                                                      Time [hours]
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Sukzessive Sicherheitsstudien
                              Metagenom Sequenzierung der Phagencocktails + Bioinformatik Analyse

                                                             Tierversuch

                                         Sicherheitstest in der Schweiz (gesunde Erwachsene)

                                        Sicherheitstest in Bangladesch (gesunde Erwachsene)

                                        Sicherheitstest in Bangladesch (gesunde Halbwüchsige)

                                           Sicherheitstest in Bangladesch (gesunde Kinder)

                                         Sicherheitstest in Bangladesch (Kinder mit Durchfall)
AAC 48, 2558; AAC 49, 2874; Virol   Es wurden keine Sicherheitsbedenken in der Verwendung beider
434, 222; EMI 19, 237; EBioMed
4, 124
                                                      Phagen Produkte gefunden
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Pharmakokinetik von oral verabreichten Phagen im Stuhl von gesunden Probanden

 100
  90
                                                    High
  80
                                                    Low
  70
                                                    Placebo
  60
% 50
  40
  30
  20
  10
   0
         0     1     2      3          4   5   6           7
                                Days
             Oraler Phage                                        Oraler Phage hatte
                                                                 keinen negativen Einfluss
                                                   AAC 49,2874
                                                                 auf Darmmikrobiota
                                                                 Zusammensetzung
                                                                 EMI 19, 237
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Vielfältige klinische und Blut Untersuchungen zeigten keine auffälligen Befunde

                                           E
Plazebo-kontrollierter, randomisierter doppelt-blind Versuch in Diarrhö Patienten

                                            Geplant:                                  Lausanne
                    Sicherheitstest         Wirksamkeitstest                          Labor
                    nach 75 Patienten       nach 375 Patienten

              T4 Phage

              Microgen
              Phage

              Plazebo

              Orale Phage sind
              sicher in Diarrhö
              Patienten                           Der klinische Test wurde bezahlt von:
                                               EBioMed 4, 124

              Interimanalyse nach 120
              Patienten
Probleme mit der Rekrutierung von informativen Patienten

                                                          Ausschluss von ungeeigneten Patienten
                                                          (andere Erreger)

              Zeitaufwendige E. coli Erreger Diagnostik
Kein Behandlungserfolg auf objektive Durchfallsparameter
gegenüber Standardtherapie

                                               Phagendurchtritt, aber keine
                              EBioMed 4, 124
                                               Phagenvermehrung
Randomisierte Patienten waren vergleichbar zum Therapiebeginn:

Auch kein Behandlungseffekt in der Untergruppe der E.coli-positiven Patienten:

           EBioMed 4, 124
Stuhlmikrobiom Analyse zeigte wenig E. coli, aber eine
massive Streptokokken Vermehrung
                                                                        EBioMed 4, 124

                                                      Streptokokken korrelierten mit
                                                      Stuhlmenge und Diarrhö Verlauf

                                                                        lt - E T E C
                                                 10
                                                  9
                                                  8
                                                  7
                                                  6

                                       c fu /g
                                                  5
                                                  4
                                                  3
                                                  2
                                                  1
                                                  0
                                                 -1
                                                      H   D 01   D 02   D 03   D 04    D 05   D 21
Die Genom Analyse von Stuhl
         Streptokokken zeigten

*    S. bovis Arten,
*    Kommensale des Dünndarms,
•     Ohne Virulenz Gene
•     Darm Mikrobiom Dysbiose

                                                                          S6
                                                                           S5

                                                                         S1

                                                                    S5    S3

             pyo     mac   gal.   inf.   pas.   equ   sal.   the.
              .       .                          .

    EBioMed 4, 124
Fehleranalyse:

Der Darm ist ein schwieriges Versuchsfeld für Phagentherapie,
• Unzugänglich (invasive Probennahme bei Durchfall ethisch nicht zulässig),
• Orale Phagen müssen gegen Säureeinwirkung bei Magenpassage geschützt werden
• Rolle von E. coli bei Durchfall zunehmend angezweifelt
• Bei E.coli Durchfall ist die Erregerkonzentration eventuell unterhalb der Phagen Replikationsschwelle
• Tierexperimente zeigten, dass Phagen-Bakterien Interaktionen im Darm stark von Laborbedingungen
  abweichen

• Phagentherapie aus unserer Sicht:
•      Bedarf nach mehr Grundlagenforschung
• von der Laborbank ans Krankenbett und wieder zurück zum Tiermodell
•      Definition geeigneter Infektionen mittels mikrobiologischer Auswertung von Fallstudien
  (belgisches Modell)
Danksagung
Am icddr,b:
S. A. Sarker (PI), S. Sultana, S. Huq, K. A. Talukder,
F. Qadri, A. Cravioto

Am NRC:
G. Bourdin, J. Sidoti, A. Bruttin, M. Weiss,
S. Chenouffi-Chibani, S. Zuber, G. Reuteler,
F. Charton, S. McCallin, S. Kieser, B. Berger, C.
Barretto, C. Ngom-Bru, M. Delley, A.-C. Pittet, O.
Sakwinska

                     …und den Kindern von Bangladesch, die an
                     den Versuchen teilnahmen
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