Platform for Science beschleunigt genomische Studien
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Lösungen für das Datenmanagement im Labor
Thermo Fisher Platform for Science-Software
Platform for Science beschleunigt
genomische Studien
Die Zukunft der Medizin beruht auf Die wichtigsten Vorteile einer Platform for Science-
genomischen Studien Genomiklösung
Genomische Studien, größtenteils in Form von Next • Schnellere Implementierung Ihrer Platform for Science-
Generation Sequencing (NGS), liefern Medizin und Software durch die Nutzung von Applikationen (Apps)
Forschung entscheidende Informationen über komplexe
• Vollständige Nachverfolgung vom Probeneingang bis zur
Krankheiten wie Herz-Kreislauf-Erkrankungen, Krebs
Sequenzierung und Berichterstellung
und Diabetes. Die neuen Erkenntnisse verbessern das
Verständnis des Zusammenspiels von mehreren Genen • Frühzeitiger Einblick in den Assay-Durchsatz
und Umweltfaktoren. So können sie zu einer früheren
Diagnose, Intervention und der Entwicklung von gezielten • Fundierte Entscheidungsfindung und effiziente
Behandlungsmaßnahmen beitragen. Genomische Studien Projektplanung
bestehen aus zahlreichen Komponenten wie Studiendesign
• Transparenz der Vorgänge im Labor durch System-
und Protokollen, Nachverfolgung von Materialien, Geräten
Dashboards und Berichte
und Proben, Pflege und Speicherung von Daten, Analyse
von Daten und Erstellung von Berichten. • Qualitätssteigerung der Laborverfahren und der
generierten Daten
Die Thermo Fisher™ Platform for Science™-Software ist
eine flexible, skalierbare und erweiterbare Lösung für
Genomiklabore. Die Software ist cloudnativ und nutzt
Amazon Web Services (AWS). Sie bietet die Werkzeuge,
um unterschiedliche Laborgeräte und Softwaresysteme zu
einer Plattform zu verbinden. Laborspezifische Workflows
können auf der Plattform einfach konfiguriert werden, ohne
dass hierfür eine individuelle Programmierung notwendig
ist. So können Labore ihre Platform for Science auch bei
Prozessänderungen aktuell halten.
Eine Vielzahl von Angeboten für Genomik und NGS Die Apps basieren auf branchenüblichen Praktiken und
Jedes Genomiklabor hat andere Workflows, und oft werden können schnell konfiguriert werden, um die besonderen
mehrere Methoden kombiniert. Deshalb haben wir für Eigenschaften und Prozesse Ihres Labors abzubilden.
die Platform for Science-Software eine große Auswahl
von Genomik-Lösungen entwickelt. Diese Lösungen Im Zuge der Verfügbarkeit neuer Technologien und
bestehen aus einer Reihe von Applikationen (Apps), die Techniken für die Genomik erweitert Thermo Fisher den App
bestimmte Teilmengen der Gesamtfunktionalität wie Marketplace ständig um neue Apps.
Nukleinsäureextraktion und Bibliothekherstellung abdecken.
Aktuell verfügbare Genomik-Lösungen: • Zur Verwendung mit:
Die derzeit verfügbaren Genomik-Lösungen für die Platform
for Science-Software unterstützen eine Vielzahl von – Array-Platten im 96er- und 384er-Format
Plattformen und nutzen Applikationen (Apps) für Funktionen – Applied Biosystems™ Nimbus™-Target-Präparationsgerät
wie Probenaufnahme, Probenvorbereitung, QS und
Bibliothekherstellung, PCR und Sequenzierung. – Katalog- oder kundenspezifische Arrays
– Applied Biosystems™ Gene Titan™-Multi-Channel-Gerät
Axiom-Genotypisierungslösung
• Unterstützte Geräte: • Die wichtigsten Vorteile
– Workflow-Verwaltung und Verfolgung aller erzeugter
Metadaten.
– Einfaches Navigieren im System und Verfolgen des
Status von Proben mit Dashboards.
– Bietet einen Qualitätskontrollpunkt, an dem fehlerhafte
Proben aus dem Workflow entfernt und zur erneuten
Bearbeitung gesendet werden können.
– Das Dashboard bietet einen Überblick über die laufende
Arbeit.
– Bietet Aufschluss über Verarbeitungsengpässe,
Probenausfälle und Reagenzienleistung.
– Nachverfolgung von Projekten, Proben, Anwendern,
Geräten, Verbrauchsmaterialien und Versandaufträgen.
Ion Torrent Illumina
• Zur Verwendung mit: • Zur Verwendung mit:
– Ion Chef™ – Illumina™ iSeq100
– Ion OneTouch™ 2 – Illumina™ Miniseq
– Ion GeneStudio™ S5 – Illumina™ MiSeq
– Ion PGM™ – Illumina™ HiSeq
– Ion Proton™ – Illumina™ Novaseq
• Die wichtigsten Vorteile – Illumina™ Infinium-Microarray-Technologien
– Alle Daten befinden sich in der Probenplattform, was die • Die wichtigsten Vorteile
Überprüfung der Daten vereinfacht.
– Fertige-Workflows für DNA-Seq, RNA-Seq, Amplicon
– Die bei der Erstellung von Ionenbibliotheken erzeugten und Targeted Sequencing sowie Infinium-Arrays
Metadaten werden zentral erfasst, einschließlich
– Schnelle Erzeugung von Probenblättern für Illumina-
Reagenzienkit, verbrauchte Chargen sowie verwendete
Sequenzer
Geräte und Instrumente.
– Vollständige Verfolgung der hergestellten Bibliotheken
– Einfaches Ergänzen von Funktionen im Laufe der Zeit
durch die Sequenzierung
durch Apps, Lösungssets und Konfigurationen – ohne
individuelle Programmierung. – Sichtbarkeit der Einzelschritte DNA-Amplifikation,
-Fragmentierung, -Fällung, -Resuspension,
– Verarbeitung aus Proben extrahierter FFPE-DNA oder
-Hybridisierung sowie Waschen und Scannen
-RNA durch Bibliothekherstellung und Pooling mit dem
Ion Chef-Gerät. – Alle relevanten Workflow-Informationen werden an
einem Ort gespeichert, einschließlich Daten wie Datum/
– Durchführung der Probenvorbereitung und Chip-
Uhrzeit, Wissenschaftler, Reagenzienchargen und
Beladung mit den Geräten Ion OneTouch 2 und Ion
verwendete Geräte
Chef. Verfolgung von Reagenzienchargen und Planung
von Durchläufen für die Geräte Ion GeneStudio S5, Ion – Probeninformationen, einschließlich Volumen,
PGM und Ion Proton. Konzentration, Derivate und Kontrollkette werden
aufbewahrt
qPCR
• Zur Verwendung mit:
– qPCR-Geräten
• Die wichtigsten Vorteile
– Gewährleistung der Qualität der Proben und Ergebnisse
anstatt Auflistung für spätere QK.
– Einfache Erzeugung eines Probenblattes für die
Vorbereitung von OpenArray-Platten
– Möglichkeit zur Erfassung von Platten- oder Proben-QS-
Metriken
– Nahtlos kombinierbar mit anderen Genomik-
Applikationen, die für Platform for Science verfügbar
sind
Kapillarelektrophorese und Sanger-Sequenzierung Unterstützung über Genomik und Sequenzierung
• Zur Verwendung mit: hinaus
NGS und andere Sequenzierungstechniken kommen in den
– Applied Biosystems™ SeqStudio™ Genetic Analyzer unterschiedlichsten Laboren und Forschungsumgebungen
– Applied Biosystems™ Genetic Analyzer der Serie 3500 zum Einsatz. Thermo Fisher hat zusätzliche Lösungen zur
und 3700 Unterstützung von Genomik-Workflows entwickelt. Erfahren
Sie mehr darüber, wie diese Anwendungen Ihre Workflows
• Die wichtigsten Vorteile optimieren können:
• Biobanking
– Ein Dashboard zur Verwaltung von Proben, die für die
Verarbeitung mit dem SeqStudio Genetic Analyzer • Mikrobiomforschung
vorbereitet sind.
• Biologika-F&E
– Verfolgung der Metadaten des Durchlaufs wie Gerät,
SeqStudio-Kassette und Applikationstyp. • Forschung und Entwicklung im Bereich Crop Science und
Agrigenomik
– Automatisierte Generierung der Plate Template File für
den Import in den SeqStudio Plate Manager.
– Anbindung anderer Geräte und Softwaresysteme über
das OData Application Programming Interface (API).
Generierung von Qualitätsdaten höchster
Zuverlässigkeit
Die Implementierung eines Labor-Informations- und
Management-Systems (LIMS) zur Verfolgung, Pflege
und Speicherung Ihrer Daten fördert die Konsistenz
und Qualität der Laborverfahren. Für Kunden, deren
Labore, in einer regulierten Umgebung arbeiten, steht ein
validiertes Cloud-Angebot zur Verfügung. Die validierte
Cloud bietet eine qualifizierte Infrastruktur und zusätzliche
Sicherheitsparameter für Kunden, die diese Standards
und Lenkungsmöglichkeiten nutzen möchten. Thermo
Fisher kann Ihr Team mit Validierungsdiensten bei der
Systemvalidierung unterstützen.
Weitere Informationen: thermofisher.com/digitalscience
Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung in diagnostischen Verfahren. © 2021 Thermo Fisher Scientific Inc. Alle Rechte
vorbehalten. Sofern nicht anders angegeben, sind alle Markenzeichen Eigentum von Thermo Fisher Scientific und Tochtergesellschaften des
Unternehmens. BR80307-DE0121Sie können auch lesen
