DNA-Reparatur, genomische Instabilität und klinische Syndrome

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DNA-Reparatur, genomische Instabilität und klinische Syndrome
DNA-Reparatur, genomische Instabilität und
        klinische Syndrome

    J. Dahm-Daphi, E. Dikomey

    Sektion für Strahlenbiologie & Experimentelle Radioonkologie
    Radiologisches Zentrum

        DNA Reparatur

         Krebsentstehung                    Strahlenempfindlichkeit

                            DNA-Reparatur

            Krebstherapie
                                                Erbkrankheiten

Nr. 2
DNA-Reparatur, genomische Instabilität und klinische Syndrome
Entstehung von Krebs

Nr. 3

        Gatekeeper und Caretaker ⇒ Neoplastische Transformation
                                                                                    Neoplasie

                            Caretaker, mindestens 4 Mutationen
         Normal

                           Gatekeeper, mindestens 2 Mutationen

        Caretaker: Erhalten die Integrität des genetischen Materials
        typischerweise DNA-Reparatur-Gene (z.B. ATM, BRCA1 und 2, p53, XP-Gene,
                                               HNPCC, Werner Syndrom, Fanconi-Anämie)
        Mindestens 4 zusätzliche Mutationen müssen zur primären hinzukommen

        Gatekeeper: Schutz vor ungebremster Proliferation
        Typischerweise Zellzyklusregulation (z. B Retinoblastom, APC (adenomatous
        polypous coloncancer). FAP (familial adenomatous polyposis), Wilms Tumor

        Nur ein bis zwei weitere Mutationen müssen zur primären hinzukommen

Nr. 4
DNA-Reparatur, genomische Instabilität und klinische Syndrome
Gatekeeper und Caretaker ⇒ Neoplastische Transformation

                                                                                                                    Neoplasie
                                            Caretaker, mindestens 4 Mutationen
        Normal

                                                      Genetische Instabilität
                                          Gatekeeper, mindestens 2 Mutationen

                            Normale Lymphozyten                             B-cell Lymphom

                                 (1000 x vergr.)                                 (2000 x vergr.)

                 Genetische Instabilität                                Chromosomenduplikationen
Nr. 5

        Schrittweise Karzinogenese am Beispiel Kolonkarzinom

                     APC-Mutation                          K-RAS-Mutation                               p53-Mutation
                 (adenomatöse Polyposis Coli)                                     Allelverluste
                         (> 70%)                              (> 40%)                                     (> 55%)
                                                                             DCC/DPC4/SMAD2
                                           Hypomethylierung

   normales                    hyperprolifera-          frühes          mittleres                  spätes
                               tives Epithel
                                                                                                                         Karzinom
    Epithel                                            Adenom           Adenom                    Adenom

                                                                                                    Polyp

                                                                                                  nach Fearon and Vogelstein, 1990
Nr. 6
DNA-Reparatur, genomische Instabilität und klinische Syndrome
Erbkrankheiten mit DNA-Reparaturdefekt

          Ataxia teleangiektatika (ATM) (Louis Bar Syndrom)
          Nijmegen breakage Syndrom (NBS)
          ATLD (Mre11)
          SCID-Artemis
          Ligase IV (Leukämie Prädisposition)
          DNA-PK Defekt (Immundefekt)
          Brustkrebs (BRCA1/2)                                Strahlenempfindlichkeit
          Li Fraumeni Syndrom (p53)                           Krebsdisposition
          Fanconi Anämie (A-F)
                                                              Immundefekte
          Bloom-Syndrom (BLM)
          Rothmund-Thomson-Syndrom                            Neuronale Defekte
          Werner-Syndrom (Progerie, WRN)
          Rett Syndrom
          Cockayne-Syndrom (A, B, C)
          SCAN 1
          HNPCC (Lynch-Syndrom)
          Xeroderma pigmentosum (A-F)
          Trichothiodsytrophie

Nr. 7

        Ataxia teleangiektatika - ATM-Gen (Chr.11q23)

        Beispiel 1

                                              Cerebelläre Ataxie
                                                        Stamm und Extremitäten
                                                        Oculomotorische Apraxie
                                                        Nystagmus
                                                        Dysarthrie
                                              Dystonien
                                              Athethosen
                                              Polyneuropathie, spin. Muskelatrophie
                                              Progressive zerebrale Degeneration (ab 3.LJ)
Nr. 8
Häufigkeit von autosomal rezessiven Erbkrankheiten

                                                1:100     heterozygot

                                        ?            0,01 x 0,01= 0,0001           : 4

                                                     0.000025

                                                1:40.000 homozygot

           Ataxia telangiektatika
            1:40.000- 1:100.000
                                            √(homozygot x 4) = heterozygot

           Phenylketonurie   1:15.000         (Hardy- Weinberg Gesetz)
Nr. 9      Down-Syndrom      1:800

        Ataxia teleangiektatika - ATM-Gen (Chr.11q23)

                                        Cerebelläre Ataxie
                                        Oculo-kutane Teleangiektasien

                                        Immunschwäche (T-Zell Depletion, B-Zell-Defekt
                                                 IgA, IgG, IgE Mangel, erhöhtes IgM)
                                        Mittlere Lebenserwartung 20-25 Jahre
                                        Keratose, graue Haare, irreguläre Pigmentation
                                        Strahlenempfindlichkeit
                                        Chromosomenschäden
                                        Erhöhtes Krebsrisiko, 5-fach
                                                 (Lymphome, Brustkrebs, Sarkome, Magen)

Nr. 10
DNA Schäden

                      Art und Anzahl der Schäden/Zelle /Gy

                                                                                                                1000
             150

                                                                                                                3000

             40
                                                                                                                200

                                                                                                                300

Nr. 11

     Reparatur von DNA-Doppelstrangbrüchen (DSB)

                                                         60                      2 Gy
                        DNA Double-Strand Breaks, GyEq

                                                         40

                                                         20                                 nicht-reparierbar

                                                         10
                                                          8        90 min
                                                          6       3 min
                                                                                                konst
                                                          4

                                                              0     1        2      3       4       5   24
                                                                        Time after Irradiation, h

Nr. 12
DNA-Doppelstrangbrüchen und Chromosomenschäden

         DNA Double-Strand Breaks, GyEq

                                                               60
                                                                                             2 Gy
                                                               40

                                                               20                                      nicht-reparierbar

                                                               10
                                                                                             AT-Zellen
                                                                8            90 min
                                                                6           3 min
                                                                                                            konst
                                                                4

                                                                    0          1         2      3       4           5   24
                                                                                    Time after Irradiation, h

Nr. 13

     Strahlenempfindlichkeit

                                                                1                                                                                   ATM
                                                                                                                                                          Nijmegen breakage
                                                                                                     normal
                                                               10 -1                                                                                          Syndrome
                                          Surviving fraction

                                                                                                                                                  Mre11 NBS
                                                                                                                                                    Rad50
                                                               10 -2

                                                                                                                                  Nicht-homologe                Homologe
                                                               10 -3                AT                                               Reparatur                Rekombination
                                                                                                                                      70 70
                                                                                                                                     Ku80Ku80
                                                                                                                                     DNA-PK
                                                               10 -4
                                                                        0           2       4       6           8            10           Artemis
                                                                                         X-ray dose, Gy                                               SCID
                                                                                                                                           Polymerase λ
                                                                                                                                    XRCC4 XRCC4
                                                                                                                                     Lig LigIV

Nr. 14
Severe combined immunodeficiency syndrome - Artemis

     Beispiel 2

                               1

                                                          normal            SCID
                              10 -1
         Surviving fraction

                                                                            T- und B-Zell Defekt
                                                                            V(D)J Rekombination
                                                                            (Diversität von Antikörpern und T-Zell-Rezeptoren)
                              10 -2
                                                                            DSB Reparatur-Defekt
                                                  SCID                      Strahlenempfindlichkeit (RS-SCID)
                                                                            Artemis-Gen
                              10 -3       AT                                z.B. bei Apache und Navajo-Indianern
                                                                            Athabaskan-sprechend (1:2000 Geburten)
                              10 -4
                                      0   2       4       6        8   10
                                               X-ray dose, Gy

Nr. 15

     DNA Reparatur und Translokationen

Nr. 16
Translokation und Leukämie

                         CML und das Philadelphia Chromosom

                    Translokation t(9;22) mit Fusionsprotein BRC-Abl

         Chromosomen Rearrangements sind für 80% der Leukämien verantwortlich

Nr. 17

     Nijmegen breakage syndrom (NBS)

     Beispiel 3                            Mikrocephalie
                                           Mikrognathie
                                           Wachstumsretardierung
                                           Immunschwäche
                                           Mittlere Lebenserwartung 20-25 Jahre
                                           Irreguläre Pigmentation
                                           Strahlenempfindlichkeit
                                           Chromosomenschäden
                                           Erhöhtes Krebsrisiko (Lymphome)
                                           Defekt in homologer Rekombination

Nr. 18
Homologe Rekombination

Nr. 19

      Homologe Rekombination ⇒ Genomische Stabilität

                                                  Rad52-Epistasisgruppe
                           RPA
                                                  • Rad51-Familie: Rad51, Rad51B,
                   Rad52
                                                    Rad51C, Rad51D, Xrcc2, Xrcc3
                                                  • Rad52, Rad54
                 Rad51   Rad54
                    Rad51
                  Rad51
         BRCA1        Rad51        Rad51D
           p53    Rad51                   Xrcc2
             BRCA2   Rad51
                     Rad51     Rad51C
         Fanconi           Xrcc3   Rad51B Rad51D

                    BLM
                                          Mre11
                   WRN           Rad50
  Tumor-Suppressoren                     NBS
  •   BRCA1, BRCA2
  •   p53,
  •   BLM, WRN, Fanconi
  •   MRN

Nr. 20
BRCA1/2 – Defekt in der Homologen Reparatur
     ⇒ Genomische Instabilität ⇒ Krebs
     Beispiel 3

         erblich bedingtes Mammakarzinom
         • 5-10% aller Mammakarzinome, 40-60% familiärer MammaCa
         • autosomaler dominanter Erbgang
         • 40-100-prozentige Penetranz
         • frühes Manifestationsalter (im Mittel bei 40 Jahren)
         • häufig synchrone Zweitkarzinome
         • Defekt in der Homologen Rekombination
              • Gene BRCA1, BRCA2, Rad51?, Fanconi D1,
         • Erhöhte Rate an Chromatidtypaberrationen
         • Erhöhtes Risiko für bds MammaCa, OvarialCa,
         • Colon, Prostata

         •BRCA1/2-Mut verantwortlich für familiäre Häufung von Mamma und OvarCa

Nr. 21

     Defiziente Homologe Rekombination ⇒ Chromosomale Instabilität ⇒ Krebs

 Späte S-Phase

     G2-Phase

                   Reparatur durch             Keine vollständige Reparatur bei
                      Homologe                       defekter homologen
                    Rekombination                       Rekombination
         Mitose

                                                   Chromatidtypaberrationen
Nr. 22                                             in der nächsten Metaphase
Mammakarzinom

                                                                              Deutschland: 10% der Frauen

                                                                                   48.000 Erkrankungen
                                                                                         pro Jahr

                                                                               4.000 genetisch bedingt; 5-10%

                                                                                      44.000 spontan
                                                                                          90-95%

Nr. 23

                                Mammakarzinom- familiär gehäuft- vererblich

                               100
                                     genetisch bedingt
                               90
                                     spontan
  Kummulative Häufigkeit (%)

                               80

                               70

                               60

                               50                                                   BRCA1
                               40                                                   BRCA2
                               30

                               20

                               10

                                0
                                 0   10    20   30       40   50   60   70
                                                Alter (Jahre)

                                                          Loman et al. 2003

Nr. 24
Fanconi Anämie

         Beispiel 4

                      Fanconi Anämie (A-E)
                      Aplastische Anämie
                               Infektionen, Blutungen
                      Microcephalie
                      Wachstumsstörung

Nr. 25

     Fanconi Anämie

         Beispiel 4

                      Fanconi Anämie (A-E)
                      Aplastische Anämie
                               Infektionen, Blutungen
                      Microcephalie
                      Wachstumsstörung
                      Schnelle Ermüdung
                      Deformation von Hand-Skelett (Daumen)
                      Hypogenital, infertil
                      Chromosomenaberrationen
                      Hypersensitiv gegen „Crosslinker“
                                          MitomycinC, Cis-Platin
                      mäßig strahlenempfindlich
                      Heterozygot 1:300
                               Ashkenasische Juden 1:90
                               Südafrika (Africaans-sprechend) 1:77

Nr. 26
Fanconi Anämie- BRCA1/2

          „stalled replication fork“                Fanconi
                                                                                    FancD2
                                                      A      F
                                                                 G
                                                       C
                                                            E
                                                                                               Aktivierung und
                                                                                               Monoubiquitinierung

                                                  BRCA1                                        Ub
                                            BRCA2                                    FancD2
           Homologe                        (FancD1)
         Rekombination
                                       RAD51

                                        XRCC2, 3
                                        Rad51B, C, D

Nr. 27

         Genetik und Epigenetik der Regulation der HR
         Rolle auch für spontanen Brustkrebs (!)

                                                                               BRCA1 Kopien Anzahl
                                                                               (LOH, Promoter-Methylierung)
           BRCA1 Mutation                                                      (assoz. mit ERBB2 Amplifikation, PR neg.)
                                                                                    45% sporad. MammaCa

            BRCA2 Mutation                                Cisplatin-                      EMSY-Amplifikation
                                                           sensitiv                       bind/silence Exon3 BRCA2
                                                                                        13% sporad. MammaCa
                                                                                        17% advanced OvarialCa

            Fanconi Mutation
                                                                                        FancF      hypermethyliert
                                                                      ?                    inaktiviert BRCA1/2
             RAD51 Polymorph.?                                                         Cisplat.-sensitiv. OvarialCa

               Überexpression?                                   Fanconi A. häufige Kopf-Hals-
                                                                 und VulvaCa, (mit HPV assoziiert)

Nr. 28     Staff, Cancer Res, 2003   Hughes-Davies, Cell, 2003   Taniguchi, Nat. Med. 2003,   Kutler, J Nat Cancer I, 2003
Homologe/Nichthomologe Rekombination- Werner Syndrom

         Beispiel 5

                                                           Progerie II

                                                           Setzt ein mit der Pubertät
                                                           Immunschwäche
                                                           Fehlender Wachstumsschub
                                                           Gonadeninsuffizienz
                                                           Ostroporose, Muskelabbau
                                                           Katarakt
                                                           Arteriosklerose
                                                           Diabetes TypII
              12 Jahre             48 Jahre
                                                           Frühzeitige Kancerogenese
                                                           Lebenserwartung unter 49 J
                                                           Defekt in der RecQ Helikase (WRN)
                                                           Chromosomenbrüchigkeit

Nr. 29

     Defekte Mismatch-Reparatur ⇒ Genomische Instabilität ⇒ Krebs
         Beispiel 6:

                         Nicht-polypöses kolorektales Karzinom (HNPCC)
                                       (Lynch-Syndrom)

                         5-10% aller kolorektalen Karzinome
                         autosomaler dominanter Erbgang
                         80-prozentige Penetranz
                         frühes Manifestationsalter (im Mittel bei 45 Jahren)
                         Therapie      Kolektomie
                         häufig synchrone Zweitkarzinome
                         Defekt in der Mismatch-Reparatur
                            Gene MLH1, MSH2, MSH6, PMS1, PMS2, MLH3
                         Numerische Änderungen von Tandem-Repeats
                            Mikrosatelliten-Instabilität

Nr. 30
Mismatch -Reparatur

                               ACTGCCTGACGCAATAGGA
                               TGACGGACTGCGTTATCCT

                                               A
                                ACTGCCTGA GCAATAGGA
                                TGACGGACT CGTTATCCT
                                               G8
                                  MLH1         0H   MSH2

                                ACTGCCTGACGCAATAGGA

Nr. 31

     Replikation von repetitiven Sequenzen
         normal

         Defekt: Insertion durch Zurückrutschen

                                                           Mismatch-Reparatur

         Defekt: Insertion durch Vorrutschen

                                                           Mismatch-Reparatur

Nr. 32
Instabilität von repetitiven Sequenzen

                                                          Kolorektales Karzinom

                          Länge der repetitiven Sequenz
                          kurz←                  →lang

Nr. 33

     Basenexcisionsreparatur (BER) – Cockayne Syndrom

    Beispiel 7

                                                             Empfindlichkeit gegen Sonnenlicht
                                                             Mikrognathie-„bird-like“ face
                                                             Mikrocephalie
                                                             Körperliche und mentale Retardierung
                                                             Kachektischer Zwergenwuchs
                                                             progressive neuronale Degeneration, Myelindefekte,
                                                             Gangstörung
                                                             Immunschwäche
                                                             Krebsdisposition (kein Hautkrebs !)
                                                             Mittlere Lebenserwartung: 16 Jahre
                                                             Defekt in der Basenexisions (BER)
                                                             und Nukleotidexzision (XP-G)

         Reparaturmechanismus
         BER repariert einzelne geschädigte Basen (durch oxidative Metabolismus, alkylierende Substanzen
         und Bestrahlung)
         Es wird die einzelne geschädigte oder einige wenige benachbarte Basen enfernt und die Lücke
         entsprechend der Komplementärsequenz aufgefüllt.
Nr. 34
Defekte DNA-Reparatur von UV-Schäden

    Beispiel 8                                              Xeroderma pigmentosum

                                                              O Häufigkeit in Japan ist 1:100.000
                                                              O Häufigkeit in den USA ist 1:1.000.000

          8 Jahre                  27 Jahre

                                Empfindlichkeit Sonnenlicht
                                kutane Maligome (BCC, SCC, Melanom)
                                autosomaler dominanter Erbgang
                                100-prozentige Penetranz
                                sehr frühes Manifestationsalter (bei 8-10 Jahren)
                                häufig synchrone Zweitkarzinome
                                Defekt in der Nukleotidexzisionsreparatur (NER)
                                     Gene XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG
Nr. 35

     Defekt in der NER ⇒ Hautkrebs

            O in der Normalbevölkerung liegt das mittlere Alter 60 Jahren
            O bei XP-Patienten liegt das mittlere Alter für Hautkrebs bei 8 Jahren
Nr. 36
Defekt in der NER ⇒ Hautkrebs
                                                          5‘      UV                          3‘

                                                                                   H     O
                                                                                    N   C
                                                                               O C        N
                                                                                CH3 C   C
                                                                                         O
                                                                                                              Thymidin
                                                                                    H
                                                                                    N   C
                                                                               O C        N
                                                                                CH C
                                                                                  3
                                                                                        C

                                                          3‘                                       5‘

                              5‘                                 3‘
                                                                                                                                                   H
                                                                                                                                 O
                                                                                                                                               N
                                                                                                                 O                   2         3

                                                                                                                             N1                    4 O

                                                                                                                                     6         5
                                                                                                                                                 CH3
                                                     H      O                                                                    4
                                                                                                                                               OH
                                                                                                                         5
                                                     N     C                                        P
                                                                                                                                         3 N
                                                 O C         N
                                                  CH3 C    C                                                         6
                                                                                                                                     2
                                                                                                             O               1
                                                      H     O                                                                N            O
                                                      N    C
                                                 O C         N
                                                  CH C
                                                    3
                                                           C

                                                                                                        P

                               3‘                                     5‘

                                       Thymidindimer (T-T)                                                  6-4 Photoprodukt (T-C)
Nr. 37

     Defekt in der NER ⇒ Hautkrebs

                        100
                                                  normal
         Überleben, %

                        10                                  XP-E
                                                          XP-F

                                                        XP-C
                         1         XP-G
                                             XP-B
                                    XP-D
                                            XP-A

                        0,1

                                   0       2    4       6                  8
                                           UV-Dosis, J/m 2

Nr. 38
×
     Defekt in der NER ⇒ Therapie ⇒ Hautkrebs

                               Therapie:
                               O   extremer Sonnenschutz
                                     OUV-undurchlässiger      Anzug
                                     OAufenthalt    im Freien nur nachts
                                                      „Mondscheinkinder“
                               O   Tumorexzisionen
                               O   nur Schutz gegen exogene Schädigung
                               O   kein Schutz gegen endogene DNA-Schädigung
                               O   Gentherapie !!

Nr. 39

     Zusammenfassung
               DNA Reparatur                            Genetische Defekte
                                                       Ataxia teleangiektatika (ATM)
                                                       Nijmegen breakage Syndrom (NBS)
                                                       ATLD (Mre11)
                                                       SCID-Artemis
                                                       Ligase IV (Leukämie Prädisposition)
                                                       DNA-PK Defekt (Immundefekt)
                                                       Brustkrebs (BRCA1/2)
                                                       Li Fraumeni Syndrom (p53)
                                                       Fanconi Anämie (A-F)
                                                       Bloom-Syndrom (BLM)
                                                       Rothmund-Thomson-Syndrom
                                                       Werner-Syndrom (Progerie, WRN)
                                                       Rett Syndrom
                                                       Cockayne-Syndrom (A, B, C)
                                                       SCAN 1
                                                       HNPCC (Lynch-Syndrom)
                                                       Xeroderma pigmentosum (A-F)
                                                       Trichothiodsytrophie

                                                     Strahlenempfindlichkeit
                                                     Krebsdisposition
                                                     Immundefekte
                                                     Neuronale Defekte
Nr. 40
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