Medizininformatik für eine datenbasierte Gesundheitsversorgung und Forschung - Dennis Kadioglu 25.01.2018 CCC-AG-Doku - MIRACUM
←
→
Transkription von Seiteninhalten
Wenn Ihr Browser die Seite nicht korrekt rendert, bitte, lesen Sie den Inhalt der Seite unten
Medizininformatik für
eine datenbasierte
Gesundheitsversorgung
und Forschung
Dennis Kadioglu
25.01.2018
CCC-AG-Doku
0
Medizininformatik… ... ist „die Wissenschaft der systematischen Erschließung, Verwaltung, Aufbewahrung, Verarbeitung und Bereitstellung von Daten, Informationen und Wissen in der Medizin und im Gesundheitswesen. Sie ist von dem Streben geleitet, damit zur Gestaltung der bestmöglichen Gesundheitsversorgung beizutragen“. (Definition Medizinische Informatik, Deutsche Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie e. V.) 1
BMBF-Förderkonzept MI • Ziel: ein vernetztes Gesundheitswesen für eine Verbesserung von Forschungsmöglichkeiten und Patientenversorgung • Aufgabe: kontextübergreifender Austausch und gemeinsames Nutzen von Daten und Wissen • Aufgabe: Kompetenzvermittlung für datengetriebene Versorgung und Forschung 2
3
Konsortien
ADMIRE
DIFUTURE*
HD4CR
HiGHmed*
MIRACUM*
share-it
SMITH*
4
BMBF-Förderkonzept MI • Ziel: ein vernetztes Gesundheitswesen für eine Verbesserung von Forschungsmöglichkeiten und Patientenversorgung • Aufgabe: kontextübergreifender Austausch und gemeinsames Nutzen von Daten und Wissen • Aufgabe: Kompetenzvermittlung für datengetriebene Versorgung und Forschung 5
SAP LIMS
Ontologies
E AV
DIC E AV
…
Research Search & Compose Metadata
Data
6 http://labblog.uofmhealth.org/industry-dx/for-optimizing-patient-data-track-and-share-every-moment
Verstehen wir uns denn?
I‘m feeling cold. My diagnosis: COLD
I caught a cold.
https://clipartfest.com/
7
8
9
Zusammenarbeit:
Intern, extern und national
• BMBF verpflichtet ALLE geförderten Konsortien zur
Mit- und Zusammenarbeit in einem Nationalen
Steuerungsgremium
• Drei AGs
• (Broad) Consent / Consent Management
• Data Sharing, Use & Access
• Interoperabilität
• Telcos und Workshops -> Eckpunktepapiere
10Medical Informatics
for Research and Care
in University Medicine
8 Universitätsklinika,
~200 Beteiligte
8 Medizinische Fakultäten,
2 Hochschulen
1112
Use Cases 1. Alerting in Care - IT Support for Patient Recruitment 2. From Data to Knowledge - Clinico-molecular predictive knowledge tool 3. From Knowledge to Action - support for Molecular Tumor Boards 4. Rare Diseases 13
Alerting in Care - IT Support for Patient
Recruitment
• Etablierung eines Studienregisters
• An jedem Standort
• Standortübergreifend (selektiver Umfang)
• Formalisierung von Ein-/Ausschlusskriterien
• MIRACUM-Datenelemente für Probandenrekrutierung im
M-MDR
• Benachrichtigung am klinischen Arbeitsplatz
• IT-unterstütztes Probandenmanagement
14MIRACUM-Auswertungen 15
MIRACUM-Auswertungen 16
MIRACUM-Auswertungen 17
MIRACUM-Auswertungen 18
MIRACUM-Auswertungen 19
From Data to Knowledge - Clinico-
molecular predictive knowledge tool
• Anwendung von Machine Learning zur
Mustererkennung und zum Clustering
• Componentwise Boosting, Deep Boltzmann Machines
• Inklusion von Daten aus allen Standorten, basierend
auf harmonisiertem Datenmodell
• OMOP CDM
• Alarmierung am klinischen Arbeitsplatz
• SMART-on-FHIR
20SMART-on-FHIR 21
SMART-on-FHIR 22
SMART-on-FHIR 23
From Knowledge to Action - support for Molecular Tumor Boards • Etablierung einer Infrastruktur für das Teilen und gemeinsame Nutzen von Analyse-Pipelines für Hochdurchsatzdaten (Wissen teilen, Qualität sichern) • Aufbau einer MIRACUM-Datenbank für genetische Varianten • IT-Unterstützung für die Auswertung, Interpretation und Dokumentation in Molekularen Tumorboards 24
25
Rare Diseases
• Identifikation von ähnlichen Patienten(-fällen) an den
MIRACUM-Standorten zur Diagnosenunterstützung
• Identifikation der passenden
Ansprechpartner/Experten im SE-Atlas
• Präsentation am klinischen Arbeitsplatz
• SMART-on-FHIR
2627
Use & Access 28
IT-Unterstützung: MIRACOLIX
Medical Informatics ReusAble eCosystem of Open source Linkable and Interoperable software tools
Primary Data Sources ID-Management Tools Data Anonymization Tools
GUF is MIRACUM competence center
Metadata Repository Data Harmonisation / Consent Management
Mapping Tool System
Natural Language Hospital-/Faculty- Project Proposal
Processing Tool /MIRACUM-wide Trial- Management Tool
/Project Registry
ETL Tools Data Integration and Data IT infrastructure to share
Exploration Repositories and easily deploy software
pipelines
Tools for Data Quality Modules for innovative Connector Component(s)
Analysis, Reporting and user-friendly and efficient
Visualisation patient care process
visualization
Long-Term Research Data Federated Authentication Tools for
Archive Development, Deployment
and Monitoring of IT
Solutions
29BMBF-Förderkonzept MI • Ziel: ein vernetztes Gesundheitswesen für eine Verbesserung von Forschungsmöglichkeiten und Patientenversorgung • Aufgabe: kontextübergreifender Austausch und gemeinsames Nutzen von Daten und Wissen • Aufgabe: Kompetenzvermittlung für datengetriebene Versorgung und Forschung 30
Strengthening Medical Informatics • Master Programme "Biomedical Informatics and Medical Data Science“ • Fortbildungsprogramm für Mediziner • Online-Kurse • Summer Schools • Training und Hospitation • in der Konzeptphase und bis heute: 40 Webinare 31
„…the culture of data sharing will be
levelled up from a project-by-project
Open Data? based approach to daily common
practice.”
Learning Health(care) System
32Sie können auch lesen
