Organspezifische molekulare Karzinogenese Kolonkarzinom - Prof. Dr. Gisela Keller Institut für Pathologie TU München

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Organspezifische molekulare Karzinogenese Kolonkarzinom - Prof. Dr. Gisela Keller Institut für Pathologie TU München
Organspezifische molekulare Karzinogenese

             Kolonkarzinom

             Prof. Dr. Gisela Keller
             Institut für Pathologie
                  TU München

             gisela.keller@tum.de
Organspezifische molekulare Karzinogenese Kolonkarzinom - Prof. Dr. Gisela Keller Institut für Pathologie TU München
Molekulare Karzinogenese - Kolonkarzinom

    • Epidemiologie
    • Modelle der Kolonkarzinogenese
    • Tumorsuppressorgene und Onkogene
    • Molekulare Klassifikation

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 1
Organspezifische molekulare Karzinogenese Kolonkarzinom - Prof. Dr. Gisela Keller Institut für Pathologie TU München
Häufigkeit kolorektaler Karzinome

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 1
Organspezifische molekulare Karzinogenese Kolonkarzinom - Prof. Dr. Gisela Keller Institut für Pathologie TU München
Kolorektale Karzinome in der BRD

57528 Neuerkrankungen im Jahr 2020

                    Frauen                                                          Männer

https://gco.iarc.fr/today/data/factsheets/populations/276-germany-fact-sheets.pdf

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 1
Organspezifische molekulare Karzinogenese Kolonkarzinom - Prof. Dr. Gisela Keller Institut für Pathologie TU München
Estimated age-standardized incidence rates (World) in 2020, colorectum,
both sexes, all ages
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Welche Risikofaktoren gibt es?

     • Ballaststoffarme Ernährung
     • Bewegungsmangel
     • Übergewicht
     • Rauchen
     • Alkohol

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 1
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Adenome

     • benigne Neoplasien des Drüsenepithels
     • Jeder dritte bis fünfte Mensch > 60 Jahre hat ein
         Adenom
     • 5% der Adenome entwickeln sich im Verlauf von
         10 Jahren zum Karzinom

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 1
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Adenome - Kennzeichen
    • exophytisches Wachstum
    • Atypien der Kernmorphologie, Kernlagerung und
      Epithelschichtung

    Normales                                            Tubuläres
    Epithel                                             Adenom

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 1
Organspezifische molekulare Karzinogenese Kolonkarzinom - Prof. Dr. Gisela Keller Institut für Pathologie TU München
Adenom                                     Karzinom

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 www.sgpgi.ac.in/path/seminars/Image6.gi

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 1
Organspezifische molekulare Karzinogenese Kolonkarzinom - Prof. Dr. Gisela Keller Institut für Pathologie TU München
Genetisches Modell der kolorektalen
Karzinogenese (Fearon-Vogelstein Modell)

•   Veränderungen in 4 bis 6 Genen
•   Veränderungen in einer präferentiellen Sequenz
•   Akkumulation ist entscheidend
•   Aktivierung von Onkogenen und Inaktivierung von
    Tumorsuppressorgenen

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 2
Akkumulation genetischer Veränderungen
                in der Adenom-Karzinom-Sequenz

Fearon ER and Vogelstein B: A Genetic Model for Colorectal Tumorigenesis.
Cell 61:759-767, 1990
Genetische Veränderungen in der
                    Adenom-Karzinom-Sequenz

                                  APC
                                 LOH 5q

Modifiziert nach: Vogelstein B. et al. 2013, Science 339:1546-1558

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 2
Eigenschaften und Funktion des APC Gens
(adenomatöse Polyposis coli)

• Chromosom 5q21
• codiert für Protein aus 2843 As (ca. 8.5kb)
• multiple Funktionen
      - Zelladhäsion, Migration
      - Segregation der Chromosomen, genetische Stabilität
      - Wnt-Signalweg

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 2
Dickdarmepithel                          APC im Wnt-Signalweg

Reya and Clevers (2005), Nature 434:843-850   Elisabeth Pennisi (1998), Science 281: 1438-1441
Eigenschaften und Funktion des APC Gens
(adenomatöse Polyposis coli)
• Chromosom 5q21
• codiert für Protein aus 2843 As (ca. 8.5kb)
• multiple Funktionen
     - Zelladhäsion, Migration
     - Segregation der Chromosomen, genetische Stabilität
     - Wnt-Signalweg

• Tumorsuppressorgen
     - Somatische Mutationen: 40-70% der Adenome und Karzinome
     - Keimbahnmutationen: FAP-Syndrom (familiäre adenomatöse
       Polyposis coli)
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Zwei-Hit-Inaktivierungstheorie von Tumor-
suppressorgenen (Knudson-Theorie, 1971)

                                                                  1. Mutation
                                                                  Keimbahn

1. Mutation                                                       2. Mutation
somatisch                                                         somatisch
                                             vererbbare Tumoren
2. Mutation
somatisch
                   sporadische Tumoren

 aus: Alberts, Molekularbiologie der Zelle
Darmpräparat
           eines 30jährigen
           FAP Patienten

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 2
Familiäre Adenomatöse Polyposis Coli (FAP)

• Keimbahnmutationen im APC-Gen
• autosomal dominant vererbte Tumorerkrankung
• > 100 Adenome im Kolon
• hohes Karzinomrisiko
• junges Erkrankungsalter
• Häufigkeit: 1% der Kolonkarzinome

 Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 2
Genetische Veränderungen in der
                   Adenom-Karzinom-Sequenz

                                  APC                            K-ras
                                 LOH 5q

Modifiziert nach: Vogelstein B. et al. 2013, Science 339:1546-1558

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Onkogene

• aktivierte Proto-
  onkogene
• fördern Zell-
  proliferation

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K-ras (Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog)

• somatische Mutationen
   - in 40-50% der Karzinome und Adenome (> 1cm)
• G-Protein
• Signaltransduktion (Rezeptor Tyrosinkinasen, z.B.
  EGFR = epidermal growth factor receptor)

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 3
Funktion und Aktivierung von K-ras

 Signaltransduktion                 Onkoprotein

Gschwind et al. 5 :361-369, 2004.
Onkogene in kolorektalen Tumoren
  • K-ras
        – Mutationen in 40-50% der Karzinome und Adenome ( >1cm)
        – G-Protein
        – Signaltransduktion
  • c-Myc
        – Überexpression in bis 70% der Karzinome
        – Transkriptionsfaktor
  • EGFR
        – Überexpression in 30-80% der Karzinome
        – Rezeptor für Wachstumsfaktor EGF

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 3
Rezeptor-Tyrosinkinasen als therapeutische
  Zielstruktur

Gschwind et al. 5 :361-369, 2004.
Rezeptor-Tyrosinkinasen als therapeutische
  Zielstruktur

                                      Antikörper gegen EGFR:
                                            Cetuximab

                                    Behandlung metastasierender
                                          Kolonkarzinome

Gschwind et al. 5 :361-369, 2004.
K-ras Mutation und Therapieansprechen

                                                        Welche Patienten würden Sie mit Cetuximab
                                                        behandeln?

                                                        • Mit

                                                          oder

                                                        • ohne

                                                          aktivierende Mutation im K-ras

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 3
K-ras Mutation und Therapieansprechen
                                                        89 Patienten mit metast. CRC
                                                        Therapie mit Cetuximab

                                                                       K-ras                     Rezidiv-
                                                                          nonmutated
                                                                                                 freies -
                                                               muta-
                                                              ted                                Überleben

                                                                          K-ras                  Gesamt-
                                                                mutated
                                                                              nonmutated         Überleben

                                                        Lievre, A. et al. JCO, 26:374-379 2008
Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 3
Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 3
Randomisierte Studie
(n=394)
• Cetuximab + „best supportive
  care“
versus
• „best supportive care“ allein

Ergebnis
K-ras Mutationen: 42.3%

Karapetis et al. 2008, New Engl J Med 359

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 3
Mutationen in KRAS und NRAS

modified: Douillard et al. 2013, N Engl J Med 369:1023-34

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 3
KRAS G12C Inhibitor – Sotorasib

Sotorasib -                                             KRK (n=62) mit KRAS G12C Mutation und
                                                        Sotorasib Monotherapie
bindet an Region der GTP–Bindungs-
stelle, die nur bei G12C Mutation in
der inaktiven Form vorhanden ist und
blockiert Übergang in aktive Form.

Yang et al. Pathol Oncol Research 27:63 1095, 2021       Fakih et al. Lancet Oncol 23, 115-124, 2022

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 3
Genetische Veränderungen in der
                 Adenom-Karzinom-Sequenz

                            APC                        K-ras           DCC
                           LOH 5q                                    SMAD 2/4
                                                                     LOH 18q

Modifiziert nach: Vogelstein B. et al. 2013, Science 339:1546-1558

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 4
DCC (deleted in colorectal cancer)
SMAD2/4 (mother against decapentaplegic homolog)

• Tumorsuppressorgene Chromosom 18q21
   – LOH 18q: 70% der Karzinome

• DCC
   – Mutationen: 6%
   – Reduzierte Expression: 30%
   – Zelladhäsion, Migration

• SMAD2/4
   – Mutationen: 7% - 12%
   – TGF-b Signalweg

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 4
Genetische Veränderungen in der
                  Adenom-Karzinom-Sequenz

                              APC                       K-ras          DCC       TP53
                             LOH 5q                                  SMAD 2/4   LOH 17p
                                                                     LOH 18q

Modifiziert nach: Vogelstein B. et al. 2013, Science 339:1546-1558

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 4
TP53: Eigenschaften und Funktionen

• Tumorsuppressorgen Chromosom 17p13
     – Somatische Mutationen: 50% der Karzinome
     – LOH: ca. 75% der Karzinome

• Protein aus 393 As., MG 53kdal
• Multiple Funktionen
     – Kontrollfunktion im Zellzyklus (G1-S „checkpoint“)
     – DNA-Reparatur
     – Apoptose

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 4
Genetisches Modell der kolorektalen
Karzinogenese (Fearon-Vogelstein Modell, 1990)

•   Veränderungen in 4 bis 6 Genen
•   Veränderungen in einer präferentiellen Sequenz
•   Akkumulation ist entscheidend
•   Aktivierung von Onkogenen und Inaktivierung von
    Tumorsuppressorgenen

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 4
The genomic landscapes of human breast and
colorectal cancers.
Wood LD, Parsons DW, Jones S, ………….. Kinzler KW, Velculescu VE, Vogelstein B.

Science 2007, Nov 16; 318:1108-13

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 4
„The genomic landscapes“ von Kolon- und
 Mammakarzinomen: Mutationen

• Sequenzierung von 18191 Genen in je 11 Tumoren
• Identifizierung von 280 CAN (cancer)- Genen
• Anzahl mutierter CAN-Gene / Tumor
   - Kolon:      15
   - Mamma:      14

 • Wenige CAN-Gene, die häufig mutiert sind
 • Mehrheit der CAN-Gene zeigt niedrige Mutationsfrequenz
                       große genetische Heterogenität

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 4
TP53
                              K-ras
                   APC

  Fig. 3 Cancer genome landscapes

                       Few gene mountains, many gene hills

Wood LD et al., Science 2007, Oct 11
Mutationshäufigkeit - kolorektale Karzinome

Genomweite Analysen von 276 Karzinomen

   Exom-Sequenzierung
   DNA-Kopien-Anzahl
   Promoter-Methylierung
   mRNA-Expression
   microRNA-Expression

The Cancer Genome Atlas Network
Comprehensive molecular characterization of human colon and rectal cancer.
Nature 487, 330-337 (2012) doi:10.1038/nature11252
Genetische Veränderungen in der
                   Adenom-Karzinom-Sequenz

                               APC                       K-ras         DCC       TP53
                              LOH 5q                                 SMAD 2/4   LOH 17p
                                                                     LOH 18q

                             Chromosomale Instabilität
Modifiziert nach: Vogelstein B. et al. 2013, Science 339:1546-1558
Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 4
Molekulare Klassifikation kolorektaler Karzinome

 • Chromosomale Instabilität (CIN)
 • Mikrosatelliteninstabilität (MSI)

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 5
Mikrosatelliten

 • kurze repetitive DNA-Sequenzen

        CACACACACACACA………...                            (CA)15-30
        CAGTAACAGTAACAGTAACAGTAA…                       (CAGTAA)15-30

 • anfällig für Fehler während der DNA-Replikation

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 5
Mikrosatelliteninstabilität (MSI)

                                                    BAT 25
                                                             Normal

                                                             Tumor

                                                    BAT 26
                                                             Normal

                                                             Tumor

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 5
Replikation

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 5
Replikation

                                                        Mismatch-
                                                        repair Proteine

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 5
Replikation

                                                        Mismatch-
                                                        repair Proteine

                       Replikation                                         Replikation

                       Insertion                                           Deletion
                                   Mikrosatelliteninstabilität
Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 5
PMS2             MLH1
                                                                      DNA Mismatch-
                                                                      Reparatur Proteine
                                       MSH6             MSH2

                                   Fehler in Mikrosatellitensequenz

                                            Längenalterationen
                                  Mikrosatelliteninstabilität
Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 5
MSI – Definition und Nachweis
   • Fragmentanalyse mit fluoreszens-markierten Primern
         - MSI-H: > 2/5 Markern instabil
         - MSI-L: 1/5 Marker instabil
         - MSS: stabil

   • Next generation sequencing (NGS) - Analyse von
     wenigen bis mehreren Tausend Mikrosatelliten-Loci
          Verschiedene Auswertealgorithmen und Schwellenwerte in
           Abhängigkeit der verwendeten Plattform
          z.B. Genpanel TS500 von Illumina: MSI >10% der
           analysierbaren MS Sequenzen

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 5
Nachweis auf Proteinebene - Immunhistochemie

 MSH2                MSH6
                                        Mismatch-Repair-Deficiency
                                        (MMRD)

 MLH1               PMS2                Expressionsverlust
                                        MLH1/PMS2 – Komplex

Nachweis auf DNA Ebene - Fragmentanalyse

                   BAT 25
                                        Normal

                                        MSI im Tumor
Mikrosatelliteninstabilität (MSI) und DNA -
   “Mismatch“-Reparaturgene

   • MSI
         - Auftreten zusätzlicher Allele im Tumor

   • Defekte in DNA- „Mismatch“-Reparaturgenen
         – MLH1, MSH2, MSH6, PMS2

   • Mutationen in Genen mit repetitiven Sequenzen
         – TGF-b-Rezeptor Typ II, IGFII-Rezeptor, Axin2, BAX

   • MSI-H in Kolonkarzinomen
         - sporadische: 15 - 20%
         - hereditäre(HNPCC): 80 - 90%

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 5
Lynch-Syndrom
 (HNPCC - hereditary nonpolyposis colorectal cancer)

 • Keimbahnmutationen in DNA-Reparaturgenen
      (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2)
 • Tumorspektrum
       – Kolon
       – extrakolonisch (Endometrium, Magen, ableitende Harnwege,
         Dünndarm)
 • syn-, metachrone Karzinome
 • junges Erkrankungsalter
 • Häufigkeit: 2-3% der kolorektalen Karzinome

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 5
Stammbaum einer HNPCC-Familie

                                                 Colon-Ca
                                                 ED: 32J

                                 Colon-Ca,
                                 Endometrium-Ca
                                 ED: 35J

               Colon-Ca,
               DD-Ca
               ED: 30J

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 5
Diagnose                     Prognose
                            Lynch-Syndrom                   KRK-Patienten

                                                 Mikrosatelliten-
                                                   instabilität
                                                     (MSI)

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 6
MSI und Prognose beim KRK

 • bessere Prognose frühe Stadien (I,II)

     Metaanalyse: 39 Studien mit 12,110 Patienten
     MSI-H Status signifikant reduziert HR
     (HR=0.64, p
Diagnose                         Prognose
                            Lynch-Syndrom                      KRK-Patienten

                                                 Mikrosatelliten-
                                                   instabilität
                                                     (MSI)

                                                        Therapie
                                    Immuncheckpoint-Inhibitoren

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 6
MSI und Immun-Checkpoint- Inhibitoren
                                                        Ansprechen auf Pembrolizumab Behandlung

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 6
Checkpoint Inhibitor-Therapie

M. Guha. The Pharmaceutical Journal Nov 2014

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 6
Checkpoint Inhibitor-Therapie

M. Guha. The Pharmaceutical Journal Nov 2014

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 6
Landscape of Microsatellite Instability Across
   39 Cancer Types
   Bonneville R et al. JCO Precision Oncol 2017

   • NGS-basierte Bestimmung von Mikrosatelliteninstabilität

   • 11139 Exome von 39 Tumorentitäten

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 6
Fig. 1. Patient survival and clinical response to pembrolizumab across 12 different tumor types with mismatch
          repair deficiency. (A) Tumor types across 86 patients. (B) Waterfall plot of all radiographic responses across 12
          different tumor types at 20 weeks. Tumor responses were measured at regular intervals; values show the best
          fractional change of the sum of longest diameters (SLD) from the baseline measurements of each measurable
          tumor

          Le et al. Mismatch repair predicts response of solid tumors to PD1 blockade. Science 357, 409–413 (2017) 28 July 2017

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 6
December 28, 2017
Cancer Drugs Approved Based on Biomarkers and Not Tumor
Type—FDA Approval of Pembrolizumab for Mismatch Repair-
Deficient Solid Cancers
Vinay Prasad, MD, MPH1,2; Victoria Kaestner, BS1; Sham Mailankody, MB, BS3
JAMA Oncol. Published online December 28, 2017.

On May 23, 2017, the US Food and Drug Administration (FDA) granted accelerated
approval to pembrolizumab (Keytruda, Merck & Co) for patients with unresectable or
metastatic, microsatellite instable-high (MSI-H) or mismatch repair-deficient (dMMR)
solid tumors that have progressed on prior therapy and have no satisfactory treatment
options. This approval is, to date, the first drug authorized for use based on a molecular
biomarker rather than a traditional histopathologic diagnosis. The approval bridges
several themes in modern oncologic drug development: the rapid translation of high-
quality basic science, tailoring therapy based on genetic subgroups, and a flexibility on
the part of the FDA to authorize drugs based on early, favorable data.

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 6
Molekulare Klassifikation kolorektaler Karzinome

  • Chromosomale Instabilität (CIN)
  • Mikrosatelliteninstabilität (MSI)
  • Epigenetische Instabilität-
    CpG island methylator phenotype (CIMP)

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 7
Epigenetische Veränderung: DNA-Methylierung

 •   kovalente Modifikation von Cytosin
     in CpG Sequenzen

 •   70% von CpGs sind methyliert

 •   CpG reiche Stellen im Promoterbereich
     von Genen sind nicht methyliert,
     Transkription möglich

 Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 7
Epigenetische Veränderung: DNA-Methylierung

 •   kovalente Modifikation von Cytosin
     in CpG Sequenzen

 •   70% von CpGs sind methyliert

 •   CpG reiche Stellen im Promoterbereich
     von Genen sind nicht methyliert,
     Transkription möglich

      Promoterhypermethylierung
           Abschalten der Transkription

 Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 7
Karzinogenese im Kolorektum

    • klassische Adenom-Karzinom-Sequenz
    • serratierte Karzinogenesewege

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 7
Sägezahnartige (serratierte)
                     Morphologie des Kryptenepithels

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 7
Sessil serratierte Karzinogenese
                                                                              Karzinom
                                                        Methyl. MLH1          MSI-H
                                    sessil
Normales
                                    serratiertes
 Epithel
                    BRAF            Adenom                                    Karzinom
                                                           partielle Methyl.
                                                                              MSI-L, MSS
                                                           MLH1, Methyl. MGMT
                                                  CIMP-H   Mut. p53

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 7
Sessil serratierte Karzinogenese
                                                                                       Karzinom
                                                             Methyl. MLH1              MSI-H
                                     sessil
 Normales
                                     serratiertes
  Epithel
                     BRAF            Adenom                                            Karzinom
                                                                  partielle Methyl.
                                                                                     MSI-L, MSS
                                                                  MLH1, Methyl. MGMT
                                                   CIMP-H         Mut. p53

Traditionell serratierte Karzinogenese - Mischtyp
                                     traditionell
                                     serratiertes                                      Karzinom
 Normales                            Adenom                                            MSI-L, MSS
  Epithel                            (TSA) /
                     KRAS                                    Methyl.   CIN
                                     villöses                MGMT
                                     Adenom
                                                                       Mut. p53, APC
                                                                       LOH 18q
                                                         CIMP-L
 Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 7
Molekulare Klassifikation kolorektaler Karzinome

                                                                     „classical adenoma
                                                             CIN
                                                                     carcinoma pathway“
                                    CIMP-L
„serrated                  K-ras, p53-
pathway“                   Mutation
                                                   20%
                                                                          APC, K-ras,
                                                                          p53 Mutation
                   CIMP- H                      8%
                                                                   57%
            BRAF-Mutation                                                CIMP-negativ
            MLH1-Methyl.
                                                12%
                                                        3%
 „MSI pathway“ MSI-H

nach: Jass JR, Histopathol 2007, 50:113-130

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 7
The consensus molecular subtypes of colorectal cancer

Guinney et al. 2015, Nat Medicine 21:1350-1356

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 7
The three major molecular pathways of colorectal cancer

Schmitt M, Greten FR: The inflammatory pathogenesis of colorectal cancer
Nature Reviews Immunology volume 21, pages 653–667 (2021)

Organspezifische Karzinogenese - Kolonkarzinom Teil 7
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