SPREAD: SilphiumPerfoliatum Resource Evaluation and Development - Elena Pestsova Fachgespräch "Durchwachsene Silphie" - Thüringer ...

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SPREAD: Silphium Perfoliatum
Resource Evaluation and Development

                                          Photos: C. Wever

           Elena Pestsova
   Fachgespräch “Durchwachsene Silphie”
           10.07.2018 Dornburg
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Durchwachsene Silphie in der Landwirtschaft

              Biomasseertrag der Silphie / Mais                                      Anbaufläche in Deutschland (ha)
                                                                              1500

                                                                              1200

                                                                              900
   Dt TM/ha

                                                                              600

                                                                              300

                                                                                 0

              Year: 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011   2012                        2009   2012   2015   2016   2017
FNR project report 2013 (Thüringer Landessanstalt für Landwirtschaft - TLL)
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Ziel des SPREAD-Projektes

 Anbau von Silphie profitabler zu machen

     • Das Potential der Silphie als
       nachwachsendem Rohstoff für
       neue industrielle
       Anwendungen zu erforschen

     • Einen Grundstein für die
       Etablierung eines
       Zuchtprogramms zu legen
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Potential für die stoffliche Nutzung

                            Martin Höller, Ralf Pude
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Leichtbeton und Schüttdämmung

                              Substitution of expanded polystyrene (EPS)
                              by Silphium particles.
                              The 37,5% Silphium sample shows a similar
                              compressive strength with a 19% improvement of
                              the thermal conductivity
                              compared to the 100% EPS standard.

                                     0%

 Lightweight and air-
entrained lightweight
      concrete              37,5%
  Silphium : cement (2:3)
                                                       6
                                                 Martin Höller, Ralf Pude
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Papier aus Silphie

      Paper from 100% Silphium cellulose has a higher tensile
strength (650-1750 N m-1) compared to recycled paper (490 N m-1).
                                                                    Martin Höller
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Schematischer Bioraffinerie-Ablauf

                                Kaskadennutzung
                                   der Silphie
                                                  Fraktionierung,
          Wertvolle chemische                     Raffination und
            Verbindungen                          Höherveredlung
                                                   der Biomasse

Anne Lunze, Antje Spieß
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Wertvolle Komponente aus Silphie

 Silphie ist eine Heilpflanze der
 Indianer
                          •   antioxidant
                          •   entzündungshemmend           Flavonoide
                          •   antibakteriell
                          •   antiallergisch
                          •   krebshemmend

                                                                  Quercetin

                                                   Rutin

                                               Kaempferol-3-o-rutinosid
Anne Lunze, Antje Spieß
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Zusammensetzung der Pflanze

                                   Silphium biomass
                                   harvested in February

             Silphie und Buche haben ähnliche Zellulosegehalte
Anne Lunze
SPREAD – Verbreitung
  der Silphie in Europa

• Im 18. Jahrhundert von Nordamerika als
  Zierpflanze nach Europa gebracht

• Mitte des 20. Jahrhunderts – Bewertung
  als Futter- und Silage Pflanze in der
  UdSSR

• Beginn des 21. Jahrhunderts – Benutzung
  als Bioenergiepflanze

     Nur einige Herkünfte / Cultivaren mit
    unklaren Verwandschaftsverhältnissen
            sind in Europa bekannt
Sammlung der “europäischen”
            Becherpflanzen
Silphium perfoliatum L.                       Place               Country                  no.
 1   „USA“ (TLL)                              Jena                USA / Germany            11
 2   „East Germany“ (TLL)                     Jena                Germany                  11
 3   „Russia“ (TLL)                           Jena                Russia / Germany         11
 4   „North Europa“ (TLL)                     Jena                North Europe / Germany   11
 5   „Ukraine“ (TLL)                          Jena                Ukraine / Germany        11
 6   Botanic Garden, Loci-Schmidt-Garten      Hamburg             Germany                  6
 7   Botanic Garden, HHU                      Düsseldorf          Germany                  6
     Schau- und Sichtungsgarten Hermannshof   Weinheim            Germany                  6
 8
     e.V. (C. Schmidt)
 9   SILP1, IPK Genebank                      Gatersleben         Germany                  5
10 SILP2, IPK Genebank                        Gatersleben         Germany                  4
11 „Wisconsin x Arkansas“ (K. Albrecht)       Jülich / Bayreuth   USA / Germany            8
12 Ontario Native Scape                       Ontario             Canada                   2
13 Botanic Garden, Basel                      Pennsylvania        USA / Switzerland        3
14 „ssp. connatum“ (I. Kaczmarek)             Hamburg             USA / Germany            1
Phänotyp der ausgewählten Herkünften

      “Ukraine” (TLL)              “Russia” (TLL)

            “Ukraine”   “Russia”
Feldexperimente am Klein Altendorf (Uni Bonn)
Phänotypische Variationen zwischen Herkünften
                               Flowering                                                  Height
                 2,5                                                   240                   a, b, d, e
                       b-e                                             230
                  2                                                    220    b-e
                                                  a-c, e                              a, c                a, c   a, c
                 1,5                                                   210
                                        a, b, d            a-b, d      200
                  1
                               a, d-e                                  190
                 0,5                                                   180
                  0                                                    170

                             Stalk number                                           Stem diameter
                                                                       22                    b, d, e
                 14                                                          d, e
                                                                       21
                 12                                                    20
                                                                       19             c                   a, c   a, c
                 10                                                    18
                  8                                                    17
                        a       b         c        d        e          16
                  6                                                    15
                  4
                  2
                  0          Node number
                 12    USA     East   a, d, e Northern Ukraine
                                      Russia
                              a, d, e
                             Germany           a, b, c a, b, c
                                               Europe
                 10    b-e

                  8                                                 No. of accessions                     5
                  6
                  4                                                 No. of clones/genotypes               60     12 per accession
                                                                    No. of plants                         180    3 per genotype
                                                                    No. of stalks                         540    3 per plant
11.07.2017 CKA
Phänotypische Variationen (innerhalb der Herkünfte)

                                Height
   280
   260
   240
   220
   200
   180
   160
   140
   120
   100

                               Flowering
   3,5
     3
   2,5
     2
   1,5
     1
   0,5
     0
   -0,5
    -1
          USA   East Germany      Russia   Northern Europe   Ukraine   11.07.2017 CKA
Genomgröße der Silphie

   Arabidopsis thaliana              0.1 GB
   Orysa sativa                      0.4 GB
   Helianthus annuus                 2.4 GB
   Zea mays                          2.5 GB
   Silphium perfoliatum              8 GB
   Triticum aestivum                 16 GB

              Tunable Genotyping by
                Sequencing tGBS®
    is the cost effective method of choice for
    genome wide SNP discovery without prior
    knowledge of the genome sequence.
Genetische Distanzen zwischen 55 Pflanzen
 der fünf Herkünfte
 Principal Component Analysis
                                       Ukraine (TLL)
                                       East Germany (TLL)
                                       USA (TLL)
                                       Northern Europe (TLL)
                                       Russia (TLL)

                                      PC3

          PC1
                                PC2

Lukas Becker
Phylogenetischer Baum

                         USA (TLL)

                         Northern Europe (TLL)

                         Ukraine (TLL)

                         East Germany (TLL)

                         Russia (TLL)

Lukas Becker
Phänotyp – Genotyp Assoziationen

      Plant height (cm)                    Node number                     Flowering (no. flower levels)
      Silphium_51173, p < 0.0001         Silphium_417033, p < 0.0001          Silphium_570147, p < 0.001
                                    12                                 3
200
                                    10
150                                                                    2
                                     8
100
                                                                       1
 50                                  6

  0                                  4                                 0
        GG        AA        AG            TT         CC        TC            AA         TT        AT

       Plant height (cm)                  Node number                  Flowering (no. flower levels)
      Silphium_1010791, p < 0.001        Silphium_85186, p < 0.001         Silphium_1116226, p < 0.0001
250                                 12                                 3
200
                                    10                                 2
150
100                                 8
                                                                       1
 50                                 6
  0                                 4                                  0

         AA        TT        AT           AA         GG        AG             AA         GG        AG
Entwicklung der molekularen Marker
                                                                          P46
                        -PstI

         PCR fragment                    mit VspI geschnitten                                             mit TaiI geschnitten
                                                        Northern Europe

                                                                                                                                 Northern Europe
                                                                                      S. integrifolium

                                                                                                                                                             S. integrifolium
                                         East Germany

                                                                                                                  East Germany
                                                                            Ukraine

                                                                                                                                                   Ukraine
                                Russia

                                                                                                         Russia
          4.10

                   800 bp
                   339 bp
                                                                                                                                   3% Agarose
Anton Kraege
SPREAD
Acknowledgements

                      13
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