Zell- und Gentechniken - Nr. 1/2019 - 20. Jahrgang - Transkript
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|transkript 1.2019 laborwelt zell- und gentechnik. I 69 · Zell- und Gentechnik · · Der Universalkrebstest ist da · · Das Labor aus Glas · Interview: Woran sterben Zellen wirklich? · · Schütteln für den Erfolg · · Einzelne Zellen besser dosieren · Finanzierunsgrunde Sepsisdiagnostik Akquisition Sophia Genetics Kapital für Keim- Cellink schnappt sich Steuert auf IPO ZU sequenzierer Fraunhofer-Produkt Der in der Nähe von Lausanne beheima- Das Münchner Family Office Wieland Ca- Bereits zwei Jahre nach ihrer Gründung tete Krebsdiagnostik-Pionier Sophia Gene- pital, der High-Tech Gründerfonds sowie wurde die Stuttgarter Dispendix GmbH tics SA forciert seinen Wachstumskurs. drei Business Angels haben im Dezember aufgekauft. Für einen Preis von 5 Mio. Anfang 2019 konnte das Unternehmen 2018 gemeinsam einen siebenstelligen Euro sicherte sich Ende 2018 die schwe- weitere 77 Mio. US-Dollar an Wachs- Betrag in die Noscendo GmbH investiert. dische Firma Cellink AB (CLNKB:SS) die tumskapital einsammeln und wird nach Bei der Duisburger Firma steht als nächs- am Fraunhofer IPA entwickelte „Immedia- der aktuellen Serie E-Runde mit 450 Mio. tes die CE-Zertifizierung ihres Next-Ge- te Drop on Demand“-Technologie (I-DOT). US-Dollar bewertet. Das Kapital kommt neration-Sequencing-basierten Systems 2017 hatte Dispendix das erste auf I-DOT unter anderem von Ex-US-Vizepräsident zur Diagnose von blutstromassoziierten basierende Gerät für das kontaktlose Al Gore, der über seinen Fonds Generation Infektionen an. . Dispensieren im Nanoliterbereich auf den Investment Management nun 10% an dem Markt gebracht. 2 Mio. Euro zahlt Cellink Schweizer Start-up hält. Sophia ist ein in bar, 3 Mio. Euro in eigenen Aktien. . Einzelzellanalyse Datenanalysehaus, welches Ärzten bei der Krebsdiagnostik im Klinikalltag unter die Die nächste Antikörper Arme greift. Die verwendeten Algorithmen Revolution stammen aus dem Bereich maschinelles Konsortium will Lernen und funktionieren unabhängig von Die Redaktion des Wissenschaftsmagazins Datenschatz Heben der Probenaufarbeitungsmethode und der Science hat Ende 2018 die Einzelzellanaly- Plattform, mit der die Nukleinsäuresequen- se zum Durchbruch des vergangenen Das europäisch-kanadische Forscherkon- zen von gesundem und Tumor-Gewebe Jahres gewählt. Die umfassende und sortium Ireceptor Plus hat Anfang 2019 bestimmt wurden. Die Bioinformatik- automatisierte Analyse großer Mengen eine Förderzusage über 8,65 Mio. Euro er- Lösung von Sophia wird derzeit an 850 einzelner Zellen hat das Potential, neue halten. Das Ziel ist, eine Softwareplattform Krankenhäusern weltweit eingesetzt, was Prinzipien des Zusammenspiels der Zellen zu konzipieren, auf der weltweit alle bisher einem Zuwachs von mehr als 50% inner- aufzudecken. Forscher erhoffen sich davon und künftig gesammelten Sequenzdaten halb von anderthalb Jahren entspricht. neue Therapieansätze. Den Science-Re- von menschlichen Antikörpern vereint Auch Pharmakonzerne wie Novartis und dakteuren zufolge hat die Einzelzell-Revo- werden können. Insgesamt dürfte es sich Roche gehören zu den Kunden. . lution gerade erst begonnen. . um 1012 einzigartige Antikörper handeln. .
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|transkript 1.2019 Laborwelt Zell- und Gentechnik. I 71 F&E treibt Wachstum Von dem Hype bei der Entwicklung von CAR-T-Zell- und Genthe- rapien haben auch die Hacke-und-Schaufel-Firmen etwas. Die ex- plodierende Forschungsaktivität in der Akademie beschert Dienst- leistern, Reagenzien- und Geräteherstellern sattes Wachstum. Fragt man Martin Schleef, Chef von Plas- Präsentationen (116) wie im Jahr zuvor So berichteten unlängst österreichische mid Factory, könnten die Zeiten nicht (66), die meisten davon zu CAR-T-Zell- Wissenschaftler darüber, dass sie dank besser sein. Der Entwickler sogenannter therapien (94; 2017: 46) zeugen davon, epigenetischer Analysen vorbehandel- Minicircle-Plasmide profitiert von der was sich derzeit in den F&E-Labors von ter einzelner Krebszellen von Patienten Technologieentwicklung im Feld der Arzneientwicklern, aber auch akademi- Rückschlüsse auf die optimale Kombi- Zell- und Gentherapie. „Rund drei Viertel schen Innovatoren tut. nationstherapie bei Blutkrebs ziehen der gut 350 derzeit entwickelten CAR-T- Ähnlich wie Schleef, der Plasmide für konnten (vgl. Seite. 7). Zelltherapien befinden sich im präklini- die Herstellung der benötigten Virus- Neue Konzepte wie jenes der zellmem- schen Entwicklungsstadium. Verbesserte vektoren produziert, profitieren auch branlosen Kompartimentierung biologi- Vektoren zur Transfektion von T- oder NK- andere Anbieter vom boomenden Feld scher Funktionen wie der Transkriptions- Zellen, dendritischer Zellen etc werden der Zell- und Gentechnologie. aktivierung durch Phasentransfer (vgl. fieberhaft in der Akademie entwickelt. Seite 37) setzen sogar Einzelzellanalysen Das spüren wir bereits seit zwei Jahren Einzelzellanalyse im Fokus voraus. deutlich bei der Nachfrage nach unse- Die vom Fachblatt Science zur Techno- Ganz allgemein bietet die Einzelzell- ren Plasmodien und Minicircle-DNA“, so logie des Jahres 2018 gekürte Einzelzell analyse genaueren Aufschluss über die Schleef, „auch im Feld Gentherapie.“ analyse wurde zwar bereits vor Jahren arbeitsteiligen Zellfunktionen in hetero- Der Trend zu Zelltherapien zeigte sich in großen Pharmafirmen erprobt, doch genen Zellverbänden, wie zum Beispiel auch auf der Jahrestagung der American angesichts gewinnträchtiger Anwendun- Tumoren, Organen oder Embryonen Society of Hematology (ASH), Anfang gen drängt sie erst jetzt verstärkt in den –und damit verbesserte Informationen Dezember in San Diego: Doppelt so viele Forschungs- und Anwendungsmarkt. über interessante Zielstrukturen für die Funktionsanalyse bessere Funktionsanalyse Vor Studien auf Genom-, Transkrip- tions, Proteom- oder Metabolomebene ist jedoch zuallererst einmal die ver- lässliche Identifizierung und Isolierung einzelner Zellen durch Laser capture Microdissection, FACS, Microfluidics (vgl. Interview Seite 76), Dielektropho- retische digitale Sortierung, Raman- Pinzetten etc. erforderlich (vgl. Seite 80). Erst dann lassen sich Zellmosaike einzeln analysieren und die Summe ihrer Funktionen danach wieder zu- Bildnachweis: InvivoGen sammenrechnen, um Rückschlüsse auf die Entwicklung von Geweben, Krankheiten oder biologischen Fehl- Lentivirales Transduktionssystem für CAR-T-Zellen funktionen ziehen zu können. TG
72 I Laborwelt Expertenstatement. |transkript 1.2019 Ein Test für alles Ein deutsches Unternehmen will einen blutbasierten Test auf dem Markt plazieren, der unabhängig vom Tumortyp alle Krebs- leiden rechtzeitig, das heißt bevor der Tumor streut, entdeckt. LABORWELT sprach mit dem Erfinder und Serienunternehmer Johannes Coy. vorhanden ist, dort aber seine Aufgabe – Risiko falsch-positiver und falsch-negativer Dr. Johannes die Zerstörung der DNA der Tumorzelle – Ergebnisse wird mit einer Sensitivität von Coy nicht erfüllt. Anti-TKTL1 richtet sich gegen 97,5% und einer Spezifizität von 99,53% Der promovierte Bio- das Enzym Transketolase-like 1, dessen äußerst gering gehalten. Dass er einfach loge arbeitete am DKFZ in Heidelberg und für Spiegel (unter anderem) in Krebszellen durchzuführen und mit 114 Euro für den die Biotech-Firmen mit ihrem aeroben Vergärungsstoffwech- Patienten preiswert ist, ermöglicht in un- MTM Laboratories sel erhöht ist. Dieses Gesamtkonstrukt seren Augen – ganz im Gegensatz zu den und R-Biopharm. Er ist Gründer der Unter- wird dann mittels Durchflusszytometrie meisten anderen empfohlenen Screening- nehmen Tavartis, Tavar- gemessen. Die Eignung von DNaseX und verfahren – eine jährliche Durchführung genix und Zyagnum. TKTL1 als Tumormarker wurde bei bis- des Tests. Das ist insofern sinnvoll, da sich her mehr als 40 untersuchten Tumorarten Tumore zu Beginn langsam entwickeln. Der bestätigt. Etliche dieser Versuche führten Übergang von einem lokal wachsenden Laborwelt. Herr Dr. Coy, Anfang des Jahres übergreifend Wissenschaftler durch, die Tumor hin zu einem invasiv wachsenden hat die von Ihnen mitgegründete Zyagnum international an verschiedensten Instituten und metastasierenden Krebs ist für die Vor- AG die Vermarktung des „ersten universellen an DNaseX und TKTL1 forschen. Es gibt sorge entscheidend, da metastasierende Krebstests für solide Tumore“ forciert. Wel- natürlich bereits einige andere Krebstests Krebsformen bisher nicht heilbar sind. che Technologie steckt hinter dem Produkt auf dem Markt, die unseres Wissens zwi- Unser Ziel ist es, mit einem konsequenten und welches Potential birgt es? schen 5 und 15 Tumorentitäten entdecken jährlichen Screeningverfahren mit Pan- können. Insofern sehen wir uns mit 40 tum Detect einen Tumor rechtzeitig vor der Coy. Die EDIM-Technologie ist eine Kom- nachgewiesenen Tumorentitäten als ersten Metastasierung zu entdecken, wodurch die bination aus extrazellulärer und intrazel- universellen Krebstest auf dem Markt. Das Chance auf Heilung ermöglicht wird. ML lulärer Antikörperfärbung von Monozyten. Sie beruht darauf, dass diese Immunzel- len durch den Körper ‚patrouillieren‘ Kritischer PanTum und dabei ungewünschte Zellstrukturen, Detect wie Bakterien, Viren oder auch entartete Detektionspunkt körpereigene Zellen, aufnehmen. Mit ex- Tumor: Krebs: trazellulären anti-CD14- und anti-CD16- lokal wachsend oftmals tödlich, Antikörpern werden ‚aktivierte‘ Monozyten schwer behandelbar in einer EDTA-Blutprobe markiert. Nach der Permeabilisierung der isolierten Mo- Gesundes Gewebe Entartetes Gewebe Karzinome in situ Karzinome mit Metastisierende Matrix Degeneration Karzinome nozyten werden zwei weitere Marker hin- zugefügt, die dann im Innern der Zellen Bildnachweis: Zyagnum AG an den ‚gefressenen‘ Tumorstrukturen binden. Diese intrazellulären Marker sind Apo10- und anti-TKTL1-Antikörper. Apo10 erkennt DNaseX, ein DNA-abbauendes Zyagnum empfiehlt, den Test einmal im Jahr durchzuführen, da sich die meisten Tumore im Enzym, das in Krebszellen zwar reichlich frühen Stadium nicht innerhalb von 12 Monaten zu einem metastasierenden Krebs entwickeln.
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74 I ADVERtORIAL. |transkript 1.19 Das Labor aus Glas Oberflächenbeschichtungen Gene analysieren, Krankheiten erkennen: Biochips erledigen solche Aufgaben in der Molekular diagnostik schnell und effizient. Die SCHOTT-Produktgruppe Nexterion® liefert die nötige Basis für die medizinische Hoch technologie – speziell beschichtetes Glas. agnoseverfahren, etwa um aus so wenig Probenmaterial wie möglich in kürzester Zeit so viele Ergebnisse wie möglich zu erzielen. Schnellerer Nachweis „Biochips mit unseren beschichteten Substraten sparen viel Zeit und Geld und ermöglichen ganz neuartige Diagno- severfahren“, sagt Marcel Fischer, Ver- triebsleiter bei SCHOTT Nexterion®. Die Produktgruppe Nexterion liefert etwa die Basis für Antikörper-Microarrays: Glas wird mit einer chemischen Beschichtung versehen, auf der Antikörper haften. Die- se werden in einem Raster winziger Punk- te aufgetragen. Darauf wiederum werden Proteine aus einer Probe gegeben, die zuvor mit einem Fluoreszenz-Farbstoff behandelt wurden. Anschließend wird der Bei dem Aufbringen von Biomolekülen werden 10.000 mikroskopisch kleine Tröpfchen auf Objektträger eingescannt, die Bindungs- einen Microarray gespottet. ereignisse treten als rote und grüne Punk- te hervor. Anhand der so gefundenen Bio- Kleiner ist schneller, ist effizienter: Was rays, Mikroskopie, Microfluidic, Next marker lassen sich Krankheiten oft schon in der Computertechnik längst eine Art Generation Sequencing, Single Molecule vor ihrem Ausbruch nachweisen. Aber Naturgesetz ist, gilt inzwischen auch für Sequencing oder gar das gesamte La- auch in der Forschung helfen Nexterion®- die medizinische Diagnostik. Wie kann bor auf dem Glas, kurz Lab-on-a-Chip. Substrate, schneller zu Ergebnissen zu man Krankheiten frühzeitig, schnell und Das Entscheidende: Diese Biochips, die kommen, etwa bei der Krebsdiagnostik kostengünstig, aber gleichzeitig auch durch zusätzliche Markierungen oder eine oder der Analyse von Genen. verlässlich erkennen? Gewebe-, Blut- Strukturierung weiter individualisiert wer- „Das Glasmaterial BOROFLOAT ® ist oder Urinproben einzeln und nacheinan- den können, sie sind so schnell und effizi- für uns die perfekte Ausgangsbasis“, der zu testen, war bislang langwierig und ent wie ein Computerprozessor. Denn bei so Fischer. „Denn es bietet genau die aufwendig. Die Lösung: Der Biochip aus der Arbeit im Labor ist die Reproduzier- Eigenschaften, die für unsere Produk- Bildnachweis: SCHOTT Glas. Das ist ein gläserner Objektträger, barkeit der Ergebnisse wichtig, aber auch te entscheidend sind. Etwa die hohe der mit einer funktionellen Beschichtung Geschwindigkeit und Kosteneffizienz Oberflächengüte, die uns ext rem ho- versehen wird, die ihn für zahlreiche spielen eine große Rolle. Daraus ergibt mogene Beschichtungen ermöglicht. Technologien tauglich macht: Microar- sich die stetige Miniaturisierung der Di- Und die niedrige Autofluoreszenz von
|transkript 1.19 ADVERtORIAL. I 75 Kapillarkräfte ihren Weg. Für das Einbrin- gen von Kanälen in Glas hat SCHOTT ein Verfahren entwickelt, bei dem die Struk- turen mit Hilfe eines Ultrakurzpulslaser- Verfahrens in extrem dünne Gläser einge- bracht werden. Fischer: „Durch die reine Verwendung von Glas, das wir je nach Kundenwunsch auch beschichten und mit anderen Gläsern zu einem Sandwich ver- binden können, erhält man einen präzisen Biochip mit hervorragenden Eigenschaf- ten für den Einsatz in der Diagnostik.“ 135 Jahre Erfahrung in der Glasferti- gung von SCHOTT und 15 Jahre Praxis Bei einer umfassenden Qualitätskontrolle werden Nexterion-Slides auf mögliche kosmetische in der Produktion von beschichteten Sub- Defekte geprüft. straten für die Forschung und Diagnos- tik verbinden sich bei Nexterion zu einer BOROFLOAT ist besonders wichtig, um die wesentliche Basis für solche Ideen – Hightech-Produktgruppe in einem der das optische Auslesen der Signale nicht und für das Wachstum von Nexterion in spannendsten Zukunftsmärkte. „Gerade zu beeinträchtigen.“ Beim Auslesen muss diesem sehr speziellen Bereich der Glas- bei Neuentwicklungen ist die Nähe zu den das Glas unsichtbar bleiben – eine An- anwendungen.“ Experten von SCHOTT ideal“, so Marcel forderung, die BOROFLOAT durch seine Fischer. „So können wir den Anforde- hohe Transparenz und extrem niedrige Für die Mikrofluidik geeignet rungen und Wünschen unserer Kunden Eigenfluoreszenz in besonderem Maß Dazu gehört auch das „Lab-on-a-Chip“: gerecht werden.“ Schnell, kostengünstig erfüllt. Größter Vorteil von Nexterion- Wie in einem großen Labor durchlaufen und effizient wie ein Chip – aus Glas. Produkten: Als Teil der SCHOTT-Gruppe Proben hier biologische, chemische oder kann der Bereich die Spezifikationen mit physikalische Prozesse, aber das alles Kontaktdaten dem SCHOTT-Bereich Glasherstellung miniaturisiert auf einem Substrat von der Karola Koban exakt abstimmen, Verfügbarkeit und Größe einer Fingerkuppe. Viele der Lab- SCHOTT Technical Glass Solutions Qualitätskontrolle sind über die gesamte on-a-Chip-Verfahren basieren auf der Otto-Schott-Straße 13 Wertschöpfungskette gewährleistet. „Un- Technologie der Mikrofluidik. Je nach An- 07745 Jena sere Stärke sind langfristig reproduzierba- wendung wird die Flüssigkeit durch ein Telefon: +49 (0)3641/681-4065 re Ergebnisse beim Kunden in Forschung Kanalsystem gepumpt oder findet durch karola.koban@schott.com und Diagnostik“, so Fischer. „Denn Ärzte und Patienten müssen sich auf die Diag- nose verlassen können.“ Die hochspezialisierte Produktion von Substraten für Biochips benötigt im Mo- ment noch kleine Glasmengen. Aber der Markt wächst stetig durch immer neue Technologien. Wenn es um Infektions- krankheiten, Genveränderungen oder Krebserkennung geht, bietet die Moleku- lardiagnostik in Zukunft große Potentiale. Neben den etablierten Unternehmen und Instituten, die etwa an der Krebsfrüh erkennung arbeiten, bringen immer mehr Start-ups ihre Innovationen ein – und eröffnen immer neue Anwendungsbe- reiche. „Einer unserer Kunden stellt All- Bildnachweis: SCHOTT ergietests für Haustiere her, ein anderer arbeitet daran, Gerüche und Geschmä- cker mit Hilfe von Biochips zu messen“, sagt Marcel Fischer. „BOROFLOAT bildet Nexterion-Slides durchlaufen die Ultraschallreinigung in Reinraumbedingungen.
76 I laborwelt Zell- und Gentechnik. |transkript 1.2019 Woran sterben die Zellen wirklich? Joachim Wegener und seine Gruppe an der Fraunhofer EMFT auf das kontinuierliche Monitoring der Zellen entwickeln und optimieren zellbasierte Assays und Sensoren für die nicht voll ausgenutzt. Es lassen sich bereits Zellanalytik. Es gibt bereits viele ausgereifte Technologien, doch noch verschiedene Gewebe züchten, zum Teil auch aus Stammzellen. Die modernen Möglichkeiten kommen sie trotz all ihrer Vorteile nicht flächendeckend zum Einsatz. der sensorischen Überwachung durch akusti- sche, impedimetrische oder optische Sensoren LABORWELT. Woran arbeiten Sie aktuell? brandaktuell. Bereits jetzt können die Zel- werden aber meist nicht ausgeschöpft. Das len mehrerer Organe integriert auf einem Wohlbefinden der Zellen könnte mit einer viel Wegener. Was mich umtreibt, ist, Sensorik Chip miteinander kultiviert werden. besseren lateralen und zeitlichen Auflösung viel mehr als bisher in mikrofluidische Zell- verfolgt werden, als es gemeinhin getan wird. kulturen zu integrieren. Wir bearbeiten das LABORWELT. Warum wird das Thema Das will unser Team unter anderem gemein- Problem bislang nur von der sensorischen Sensoren hier immer wichtiger? sam mit der Firma Presens ändern. Seite.. Organ-on-a-chip, body-on-a-chip und so weiter – verschiedene Gewebe mi- Wegener. Das Potential dieser Kultivie- LABORWELT. Nehmen wir ein Beispiel: krofluidisch hintereinander zu schalten, ist rungstechnologien wird derzeit im Hinblick Biopsiematerial von Krebspatienten wird WITH GREATER DETAIL AND FEWER SEQUENCING READS. At BD, we’re transforming how cells are understood and enabling you to tackle your most demanding research needs with powerful single-cell RNA-seq tools. The new high- throughput BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System with customizable, targeted assays is designed to increase sampling sensitivity, resulting in drastically reduced sequencing costs. Now you can analyze large single-cell data sets and multiplex up to 12 samples in parallel— up to 20,000 cells with one BD Rhapsody ™ cartridge— in a streamlined workflow. This groundbreaking tool empowers you to detect rare transcripts and focus on the genes that really matter. Discover the difference of a new vision in cellular research. Discover the new BD. Learn about the difference of one transcript at bd.com/RhapsodyEU For research use only. Not for use in diagnostic or therapeutic procedures. BD, the BD Logo and Rhapsody are trademarks of Becton, Dickinson and Company. © 2019 BD and its subsidiaries. All rights reserved. 1910001349
|transkript 1.2019 laborwelt zell- und gentechnik. I 77 in einem Mikrofluidiksystem kultiviert und sel der Zelle oder des Gewebes. Etab- die Wirkung möglicher Therapeutika an lierte, elektrochemische Verfahren sind diesem System getestet. Wie kann hier für Mikrofluidiken nicht geeignet, weil eine bessere Sensorik helfen? sie Sauerstoff verbrauchen – nicht so die auf Luminiszenz basierenden optischen Wegener. In einem solchen Szenario Sauerstoff- und pH-Sensoren, die wir könnte die Sensitivität des Zellmaterials gemeinsam mit Presens auf zellbiologi- auf verschiedene therapeutische Wirkstof- sche Fragestellungen anwenden. Da sie in fe parallel untersucht werden. Bei Krebs das Wachstumssubstrat integriert werden stellt sich natürlich die Frage: Wachsen können, wachsen die Zellen auch auf den die Zellen in Gegenwart des Wirkstoffes Prof. Dr. Joachim Wegener Sensoren. Damit erreicht das System eine weiter, bleiben sie unverändert, sterben Gruppenleiter, hohe örtliche und zeitliche Auflösung der sie – und mit Blick auf ihre Fähigkeit, Fraunhofer EMFT Regensburg pH- und Sauerstoffsituation innerhalb des Die Fraunhofer EMFT betreibt angewandte Metastasen zu bilden: Bewegen sie sich? Forschung an Sensoren und Aktoren Chips. Ein gutes Einsatzfeld dieser Senso- Zellformveränderungen und Zellbewe- für Mensch und Umwelt. ren ist die Vitalitätsbestimmung während gungen lassen sich sehr exakt mit einer eines Experimentes. Die Zellen sollten in Impedanzanalyse auslesen, ohne die Zellen einem Zustand kultiviert werden, der der Bildnachweis: Universität Regensburg dabei zu beeinflussen. Solche generischen, LABORWELT. Was gibt es neben den In-vivo-Stituation möglichst nahe kommt. universell einsetzbaren Sensoren sind un- Impedanzsensoren noch für Optionen? Bei manchen Set-ups leidet die Zelle an sere Spezialität in der Gruppe. Sie sind Sauerstoffüber- oder -unterversorgung nicht-invasiv, markerfrei und automati- Wegener. Die pH- und Sauerstoffsen- – und nicht aufgrund des veränderten ex- sierbar. Die beschriebene Impedanzsen- sorfilme. Mit der gleichzeitigen Messung perimentellen Parameters. Die optischen sorik basiert auf dünnen Filmelektroden, beider Parameter erhält man einen diffe- Sensoren können helfen, dieses Problem auf denen die Zellen wachsen. renzierten Eindruck über den Stoffwech- zu erkennen. ML TM I SC : & F ies Cell I B M g le on CI nolo Sing issi s T S IB ch d sm de Te ase Tran Mo g e B with nce a e Im ation resc l o Iso d Flu X1 & F1 an ® HIGH RECOVERY RATE & HIGH CELL VIABILITY SINGLE CELL ISOLATION FOR SEQUENCING AND CLONING scRNA-Seq scWGS scATAC-Seq scMS mAb Stem Cells CRISPR/CAS9 cellenion SASU - 60 Avenue Rockefeller, 69008 Lyon, France - Tel. +33 9 86 48 70 70 - contact@cellenion.com - www.cellenion.com
78 I ADVERtORIAL. |transkript 1.2019 Erfolg in vierter Generation Zellkultivierung INFORS HT hat eine neue, optimierte Version des Multitron-Inkubationsschüttlers für noch bessere Kultivierungs- bedingungen lanciert. Mehr als 20 Jahre nach der erstmaligen Markt- einführung des Multitron-Schüttlers besticht die vierte Generation mit besten Kultivierungsbedingungen. Die neue Multitron wird in einem neuen mit wenigen Teilen aus und ist daher be- oberste Einheit bleibt nach wie vor mit Design präsentiert und bietet Forschern sonders einfach zu reinigen. Zusammen einer bequemen Arbeitshöhe von 1,40 m noch bessere Voraussetzungen für die mit der neuen UV-Dekontamination, der zugänglich. Der neue Türmechanismus Kultivierung von Mikroorganismen, Zell- kondensatfreien Direktdampfbefeuch- und die schnelle Start-Stopp-Automatik kulturen und phototropen Organismen – tung und der antibakteriellen Gehäusebe- minimieren die Unterbrechungen wäh- und das bei einfacher Bedienung sowie schichtung erfüllt die Multitron die hohen rend der Kultivierung. ungeschlagener Kapazität bei minimalem Anforderungen für Zellkultur-Anwendun- Platzbedarf. gen. SCADA-Ansteuerung integriert Zudem erfüllt die neue Multitron die „Die neue Multitron kombiniert die be- Vorteil Hygiene zunehmenden Effizienzansprüche in der währten Vorteile mit neuen Features als Durch das neue Temperierkonzept wird Biotechnologie. Wie auch bei der Vorgän- Antwort auf die Trends und die geän- eine optimale, gradientenfreie Tempera- gerversion ist die Kapazität des Inkubati- derten Anforderungen in Forschung und turuniformität erreicht, die vergleichbare onsschüttlers im Verhältnis zum Platzbe- Entwicklung, wie etwa die fortschreiten- Wachstumsbedingungen für alle Batches darf einzigartig. In einer Dreifachstapelung de Digitalisierung. So bietet die Multitron garantiert. Dazu bietet die neue Multitron können über 50 Liter beziehungsweise ab jetzt eine Ethernet-Schnittstelle, mit ein verbessertes Hygienedesign. Der In- 23.000 Parallelansätze kultiviert werden, der einfach SCADA-Softwares wie eve® nenraum mit abgerundeten Ecken kommt obwohl das Gerät nur 1 m breit ist. Die angebunden werden können“, erklärt Dr. Dirk Hebel, Produktmanager Bioprocess Equipment bei INFORS HT. Die neue Multitron kann seit Mitte Januar bei allen INFORS HT-Filialen sowie INFORS HT- Distributoren bestellt werden. INFORS HT hat sich auf Bioreaktoren, Schüttelinkubatoren und Bioprozess- Software spezialisiert. Ausgeklügelte Systeme, in denen Zelllinien oder Mikro- organismen reproduzierbar die volle Pro- duktivität entfalten, tragen zum Erfolg der Kunden bei. Kontaktdaten Julia Brück Bildnachweis: INFORS HT Marketingspezialistin INFORS HT Rittergasse 27 4103 Bottmingen Telefon: +41 (0)61 4269 835 Eine Erfolgsgeschichte wird fortgesetzt: INFORS HT stellt die vierte Multitron-Generation vor. marketing@infors-ht.com
|transkript 1.2019 laborwelt. I 79 Immunologie ronin 1, um in Zellen des Immunsystems Intelligente zu überleben. Sinkt die Konzentration des regulatorischen Proteins dagegen Immunsuppression in den T-Zellen ab, steigt der Spiegel des Signalmoleküls cAMP – das über das cAMP-bindende Protein CREB die Kalzium-abhängige Aktivierung von T-Zellen steuert – und die Toleranz ge- genüber Transplantaten nimmt zu. Vielversprechender Ansatz Von Antigen-präsentierten Zellen (APC) präsentierte mikrobielle Anti- gen führten dagegen zur CD89/CD28- vermittelten Ko-Stimulation von T- Zellen, die den immunmodulierenden, cAMp-vermittelten Effekt aufhebt. Die Modulation des Coronin 1-abhängigen Signalweges sehen die Wissenschaftler REM-Aufnahme von T-Zellen ohne Coronin 1 als vielversprechenden Ansatz, um eine dauerhafte Toleranz von Spenderorga- Das Potential ist laut Rajesh Jayachand- stießen Mäuse transplantierte Organe nen zu induzieren. Bildnachweis: Swiss Nanoscience Institute/Universität Basel, Biozentrum ran riesengroß. Der Immunologe hat nicht länger ab. Antigene von Viren, herausgefunden, wie er T-Zellen des Im- Bakterien oder Pilzen erkannten sie Patent angemeldet munsystems modifizieren muss, damit aber weiterhin. An dem medizinischen Einsatz von Co- sie Organe nicht mehr angreifen. Das „Nach dem Entfernen von Coronin 1 ronin 1 und den Coronin 1-Modulatoren Besondere: Die Zellen greifen weiter konnten die T-Zellen die Immunreaktion basteln Jayachandran und sein Mentor mikrobielle Pathogene an – bisher hat gegen das transplantierte Organ nicht Pieters allerdings schon länger herum. der Forscher aus der Gruppe von Jean nur massiv unterdrücken, sondern die Das erste offengelegte Patent datiert Pieters an der Universität Basel das al- Abstoßung sogar aktiv verhindern“, so vom März 2006 (WO2007110385A3). lerdings nur bei Mäusen erforscht. der Erstautor der Studie in Immunity. Die darin beschriebenen Anwendungen Schlüssel für die selektive Allo-To- (doi: 10.1016/j.immuni.2018.12.011). reichen neben dem Schutz vor Organ- leranz ist die Manipulation des Prote- Hinweise auf die Wirkung des Proteins abstoßung und Autoimmunkrankheiten ins Coronin 1. Drosselten die Wissen- hatten Pieters und Kollegen in Krank- über Antiinfektiva gegen Mykobakterin schaftler dessen Produktion in T-Zellen, heitserregern gefunden. Die nutzen Co- und Blutkrebstherapeutika. . Multi Test Zellkulturanalyzer mit wartungsfreien Sensoren Umfassendes Testmenü mit 16 Tests: • Gluc, Lac, Gln, Glu, NH4+, Na+, K+, Ca++ • pH, PCO2, PO2 • Osmolalität • Gesamtzelldichte, Lebendzelldichte, Zellviabilität, Zelldurchmesser 265 µl Probenvolumen für alle 16 Tests Analysezeit von 4,5 Minuten für alle 16 Tests Neues 48 Positionen Osmometer Modul Automatisierte Probenmessung direkt anbindbar an ambr® 15 und ambr®250 Für weitere Auskünfte: info@novabiomedical.ch • Tel.+41 41 521 66 55 Nova Biomedical Switzerland GmbH Turmstrasse 18 6312 Steinhausen
80 I laborwelt. |transkript 1.2019 Einzelne Zellen besser dosieren In der biologischen Analyse gewinnen Einzelzelltechnologien zunehmend an Bedeutung. Neue Applikationen können die Arbeit deutlich vereinfachen. von Holger Eickhoff, Alba Simon Munoz und Guilhem Tourniare; Cellenion SAS Ergänzend zu den Durchschnittsmes- (Entwicklung monoklonaler Antikörper, ckungen und Fortschritten geführt. Bis sungen an Zellpopulationen bieten Ein- Stammzellen, CRISPR/Cas9), Einzelzell- vor kurzem waren Millionen von Zellen zelzellmessungen ein feinkörniges Bild sequenzierungen (scRNA-Seq, scWGS, erforderlich, um genügend DNA (oder komplexer Biologie und demaskieren die scATAC-Seq) oder der Isolierung von RNA) für eine Sequenzierung zu erhalten. in Geweben vorhandene Heterogenität. seltenen Zellen, wie beispielsweise zir- Molekularbiologen haben neue Techno- Mit moderner Mikrofluidik, Elektrophy- kulierenden Tumorzellen (CTCs), und logien entwickelt, um die Genome oder siologie, hochauflösender Bildgebung, anderen, frei wählbaren Zelltypen wie auch Transkriptome einzelner Zellen zu Tiefensequenzierung und Massenspek- Bakterien und Sporen. sequenzieren. Diese Untersuchungen trometrie-Plattformen zeichnet sich ein Das akustische Prinzip der CellenONE- haben signifikant zu einem besseren detaillierteres Bild des zellulären Sub- Technologie ermöglicht aufgrund seiner Verständnis über eine ganze Reihe von typs, des physischen Ortes im Gewebe Sanftheit und der geringen auftretenden Prozessen beigetragen, bei denen die kon- und der klonalen Evolution ab. Darüber Scherkräfte eine Überlebensrate von weit ventionelle Untersuchung von heteroge- hinaus ermöglicht die Empfindlichkeit über 90% der dosierten Zellen. Diese nen Zellverbünden nicht repräsentativ neuer Methoden die Identifizierung sel- grundlegende Eigenschaft machen die für das ist, was passiert, wenn zelluläre tener Zellen mit potentiell funktionell CellenONE- Geräte zu einer geeigneten Heterogenität, zum Beispiel bei Krebs, ein oder pathogenen Konsequenzen1. Plattform für eine Reihe von Probenvor- Schlüsselproblem darstellt. Technologien Cellenion ist ein auf Einzelzelltech- bereitungen zur Analyse von einzelnen zur genauen Isolierung von einzigartigen nologien spezialisiertes Start-up und Zellen. Zellen, die für die Genese verschiedener wurde im Mai 2016 in Lyon gegründet. Erkrankungen an zentraler Stelle stehen, Die Firma ist eine Tochter der SCIENION EinzelzeLL-Analyseverfahren sind jedoch immer noch selten und für AG, eines deutschen Precision-Dispen- DNA- und RNA-Sequenzierungstechni- klinische Proben nicht geeignet. Mit dem sing-Unternehmens mit Sitz in Berlin. ken haben zu vielen biologischen Entde- CellenONE X1 können nun einzelne Zel- Während bei Scienion vorzugsweise len in einem Dosierer aus inertem Glas diagnostische Applikationen für DNA- visualisiert und so selektiert werden, dass oder Proteinassays entwickelt werden, einzelne Zellen auf oder in verschiedene adressiert Cellenion die Dosierung von Substrate abgegeben werden. Diese offene einzelnen, lebenden Zellen. Die bei Plattform, in der Zellen und Reagenzien Cellenion entwickelten Systeme und im Pikoliterbereich dosiert und so Assays Lösungen werden für automatisierte weiter miniaturisiert werden können, Einzelzellisolationen in analytischen wurde von Nutzern zur Sequenzierung Verfahren und im 3D-Bioprinting ange- von 40.000 verschiedenen Zellen ange- wendet. Die vermarktete CellenONE®- wendet. Die eingesetzten Materialien Technologie, in der eine sanfte und und Zellen führten in diesem Ansatz zu Bildnachweis: Cellenion SAS akustikbasierte Technologie für die einem durchschnittlichen Preis von nur Dosierung von einzelnen Zellen in Flüs- 0,26 US-Dollar für die Sequenzierung pro sigkeitsvolumen von wenigen Pikolitern Zelle. So konnten miniaturisiert, günstig mit hoher Präzision eingesetzt wird, hat Abb. 1: 100 einzelne Spheroide aus Lungen- und im Hochdurchsatz wesentliche Merk- Applikationen im Bereich Klonierungen krebszellen als gedruckter 10 x 10-Array male der zellulären Heterogenität eines
|transkript 1.2019 laborwelt. I 81 Krebsgewebes, wie negativ ausgewählte und Fluorescence Image Based Single Genomtopologien, subklonale Mutations- Cell Isolation (FIBSCI®). In beiden Modi muster und Genomreplikationszustände entscheidet eine Bildanalysesoftware in durch Sequenzierung von Einzelzellge- Echtzeit anhand automatisch aufgenom- nomen mit hoher Genauigkeit effektiv mener Bilder, ob ein abgegebener Tropfen untersucht werden. Der gewählte ampli- eine einzelne Zelle enthält. Dabei wer- fikationsfreie Einzelzell-Genom-Sequen- den alle einzelnen dispensierten Zellen zierungsansatz konnte auch zeigen, dass inklusive einiger Parameter gespeichert. eine relativ flache Sequenzierung über Im IBSCI-Modus werden Durchlichtbil- Tausende von Genomen die Rekonstruk- der bezüglich der Größe und Rundheit tion von klonalen Genomen bis hin zur von Zellen analysiert. Im FIBSCI-Modus Auflösung von Einzelnukleotiden durch werden die Fluoreszenzsignale von bis Aggregationsanalyse von Zellen ermög- zu vier Farben in einzelnen Zellen für licht, die eine Genomstruktur höherer die Festlegung von Dosierungskriterien Abb. 2: Zwei einzeln dosierte Fibroblasten Ordnung gemeinsam nutzen. Die groß- verwendet. Die optischen On-Board-Sys- in einer Alginatmatrix nach Zugabe in eine räumige Populationsanalyse identifizierte kalziumhaltige Lösung (3D-Imaging mit teme in CellenONE-Geräten ermöglichen unter Tausenden von Zellen auch einige Nanolive 3D Explorer) dabei eine frei konfigurierbare Beladung wenige, seltene Zellen, die mitotische von Anwendersubstraten, die 384, 1536 Fehlsegregation ganzer Chromosomen pern und Zelllinien, für die eine Automa- und 3456 Well-Mikrotiterplatten sowie aufwiesen2. tisierung von Klonierungsschritten vor- Lab On A Chip-Systeme einschließen. Neben den verschiedenen Analysever- teilhaft ist. In den CellenONE-Geräten Die mit der CellenONE-Technologie fahren bietet die CellenONE-Technologie werden dafür insbesondere zwei inno- bislang vereinzelten Zelltypen sind auch interessante Möglichkeiten in der vative Technologien verwendet: Image zwischen 2 und 60 μm klein. Zelltypen Gewinnung von monoklonalen Antikör- Based Single Cell Isolation (IBSCI®) wie CHO (Chinese Hamster Ovary), Lebende Zellen sehen mit Cell³iMager Estier von SCREEN Optisches Kohärenztomografie-System (OCT) für das Wirkstoff-Screening Markierungsfreie Detektionstechnologie in einem Applikationen berührungslosen, bildgebenden 3D-Tomographie-System lot-qd.de Kann abgestorbene Bereiche erkennen und Volumen, interne Hohlräume oder röhrenförmige Strukturen absolut quantifizieren Wir beraten Sie gern: LOT-QuantumDesign GmbH, Dr. Raimund Sauter +49 6151 8806-24, sauter@lot-qd.de
82 I laborwelt. |transkript 1.2019 Spieler betreten. Beim 3D-Bioprinting mer, das die extrazelluläre Matrix nach- kommen nur einige der additiven Fer- ahmt und sowohl Zellfunktionen als auch tigungsprinzipien des konventionellen den Stoffwechsel unterstützt, mit dem 3D-Drucks zum Einsatz, da beim 3D-Bio- Ziel entwickelt 3D-Kulturen zu erhalten. printing in der Regel hochspezialisierte Für die Erzeugung dieser 3D-Strukturen biologische und biokompatible Materi- werden von der Dispenserdüse Alginat- alien verwendet werden müssen. Hohe tröpfchen mit einzelnen Zellen in eine Drücke oder hohe Temperaturen, wie sie Lösung dosiert, die zweiwertige Kationen in konventionellen 3D-Druckverfahren enthält3. Die divalenten Kationen, typi- verwendet werden, schließen den Druck scherweise Ca2+, verursachen bei Diffu- von einzelnen, lebenden Zellen aus, da sion in die Tröpfchen eine Gelierung des diese unter solchen Bedingungen nicht Alginats. So können elegant gute Umge- weiterleben. Die CellenONE-Technologie bungsvoraussetzungen für eine anschlie- bietet die einzigartige Möglichkeit zwei- ßende Charakterisierung der dosierten, oder dreidimensionale Zellsysteme durch lebenden und interagierenden Zellen und nacheinander folgendes Drucken von ein- Zellverbünde erzeugt werden. . Der cellenONE F1 isoliert einzelne Zellen, die von Interesse sind, mit Hilfe seiner vier Fluo- Anzeige Literatur reszenzdetektionsmodule. Der Piezodispen- 1.) Nature Biotechnology, Single Cell Technology, ser ermöglicht die präzise Ablage von Zellen 1. November 2016 auf einem breiten Spektrum von Substraten 2.) Emma Laks et al, Resource: Scalable whole genome sequencing of 40,000 single cells HEK293T, HeLa, A549, PC3, H1975 und identifies stochastic aneuploidies, genome replication states and clonal repertoires, HepRG, dazu noch Primärzellen wie http://dx.doi.org/10.1101/411058 doi: bioR- PBMCs (Peripheral Blood Mononuclear xiv preprint first posted online Sep. 7, 2018 Cells, einschließlich B- und T-Zellfraktio- 3.) Ilaria Ghidoni et at, Alginate cell encapsulation: new advances in reproduction and cartilage nen), Fibroblasten, Keratinozyten, Mela- regenerative medicine, Cytotechnology. Sep- nozyten, Kardiomyozyten, HUVEC und zelnen Zellen zielgenau und spezifisch zu tember 2008 neurale Stammzellen wurden mit einer generieren. Erste Schritte hierfür wurden Überlebensrate von >90% vereinzelt. mit einer Zellverkapselung, bei der eine Kontakt einzelne lebende Zelle in einer semiper- Cellenion SAS, Auf in die 3. Dimension meablen Membran eingeschlossen wird, Pépinière Laënnec 3D-Bioprinting, eine nur entfernt ver- realisiert. Dafür wurde die Technologie 60 av. Rockefeller wandte Art von 3D-Druck, ist ein schnell der Zellverkapselung in Alginat, einem 69008 Lyon, Frankreich wachsendes Feld, das nahezu täglich neue natürlichen biologisch abbaubaren Poly- eickhoff@scienion.de Nova Biomedical Zellkulturanalyse mit wartungsfreien Sensoren Der Multitest-Zellkultur- NH4+, Na+, K+, Ca++, Blutgas: Parametern liegt in nur 4:30 analyzer BioProfile® FLEX2 pH, PCO2, PO2 und Osmolali- Minuten vor – unter Nutzung kombiniert die wartungs- tät. Die Zelldichte- und Vita- eines sehr kleinen Probenvo- Bildnachweis: Cellenion SAS, Nova Biomedical f reie M ic roSensor-K a r- litätsbestimmung erfolgt mit- lumens (265 μl). tenTM-Technologie mit opti- tels der Trypanblau-Methode Der Austausch der Mic- scher Messtechnologie und und digitaler Bildanalyse. Bis roSensor-Karten dauert nur Gefrierpunkt-Osmometrie zu einer Konzentration von wenige Sekunden. Zudem für eine automatisierte und 80 x 106 Zellen/ml ist dabei reduzieren die integrierten, umfassende Zellkulturanaly- keine manuelle Verdünnung automatisierten Qualitäts- Nova Biomedical se. Die MicroSensor-Karten für die Bestimmung der Zell- kontrollen den manuellen Switzerland GmbH gibt es für folgende elf Meta- dichte erforderlich. Ein voll- Aufwand signifikant. Tel.: +41 41 521 66 55 boliten: Gluc, Lac, Gln, Glu, ständiges Testmenü mit 16 www.novabiomedical.com info@novabiomedical.ch
|transkript 1.2019 laborwelt. I 83 Biozym Scientific Transfektion 2.0 Die Lipocalyx GmbH hat eine Transfektion von Komplexen Plasmide, erlaubt eine effekti- 2. Generation synthetischer aus aktivem Cas9-Protein und ve Transfektion der Zellen und Transfektionsreagenzien ent- gRNA. Diese neue Methode VIROMER mRNA bietet die wickelt – die sogenannten der CRISPR/Cas-Technik er- Möglichkeit, Expressionsstu- Viromere®. Sie ermöglichen möglicht ein potenteres und dien in schwer zu transfizieren- ein aktives Ausschleusen aus schnelleres Genome Editing, da den Zellen wie Monozyten und len, die wegen geringer Prolife- dem Endosom, was zu deutli- im Vergleich zur Nutzung von Makrophagen durchzuführen, rationsraten eine verminderte chen Verbesserungen auf dem Plasmiden und mRNA die heik- bei denen die Plasmidprozes- Transkription aufweisen. Gebiet von CRISPR-, Plasmid- len Schritte der Transkription sierung aufgrund erhöhter www.biozym.com und mRNA-Delivery führt. und Translation übersprungen DNase-Aktivität im Zytosol Das Kit VIROMER® CRISPR werden. VIROMER PLASMID, vermindert ist. Ein weiteres Biozym Scientific GmbH for RNP delivery ermöglicht die das neue Standardreagenz für Target sind viele primäre Zel- support@biozym.com PromoCell Angiogenese-Assay – einfach und verlässlich PromoCells „Angiogenesis unter dem Einfluss bestimm- mitgelieferten Fluoreszenz- Assay Kit“ bietet eine ein- ter Stimulanzien röhrenför- farbstoff angefärbt und das fache, robuste und semi- mige Strukturen auszubilden Ausmaß der Röhrenbildung quantitative Methode zur („tube formation“). Hierzu (zum Beispiel durchschnittli- Bestimmung von Angioge- werden Endothelzellen auf che Röhrenlänge und Anzahl nese-Inhibitoren und -Stimu- einer speziell entwickelten, der Verzweigungspunkte) latoren/Regulatoren sowie entsprechend optimierten bestimmt. Der Kit beinhal- für die Untersuchung der 3D-Zellkulturmatrix aus- tet eine Inhibitor-Kontrolle Angiogenese-spezifischen plattiert. Nach Zugabe von und genügend Reagenzien Signaltransduktion in vitro Angiogenese-auslösenden für die Durchführung von in weniger als 18 Stunden. Verbindungen werden die bis zu 50 Assays in 96-Well- PromoCell GmbH Der Assay basiert auf der Fä- sich neu formierenden endo- Mikrotiterplatten. Tel.: +49 6221 64934-0 higkeit endothelialer Zellen, thelialen Röhren mit einem www.promocell.com info@promocell.com LOT-QuantumDesign Hochdurchsatz-Analysen von 3D-Mikrogeweben Bildnachweis: Biozym Scientific, Promocell, LOT-QuantumDesign Mit den Cell 3iMagern hat 50 Sekunden und ermög- zu 5 min bei einer SCREEN innovative Lösun- licht eine Auflösung von 2,6, Au f lös u ng von gen entwickelt, Beschränkun- 5,0 oder 10,0 µm/Pixel. Der 0,8 µm) kann der gen hinsichtlich Geschwin- Cell3iMager Duos kombiniert Duos mit einem digkeit und Durchsatz in Hellfeld- und Fluoreszenz- Inkubator und ei- phänotypischen Screenings messungen mit verschiede- ner automatischen Probenzu- zu überwinden und gleich- nen Farben. Zusätzlich zu führung kombiniert werden. zeitig die Möglichkeiten zur der Scangeschwindigkeit Die Systeme sind kompatibel Datenanalyse zu verbessern. von bis zu 60 Sekunden für mit den meisten 2D- und 3D- LOT-QuantumDesign GmbH Der Cell3iMager Neo scannt eine 96-Well-Platte bei einer Zellkultur-Plattformen. Im Tiefen See 58 eine 96-Well-Platte in bis zu Auflösung von 4 µm (und bis www.lot-qd.com 64293 Darmstadt
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